الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
الترميز الجيني والتعبير عن الهيكليات السيتوسكلية من RNA الأورغامي في الخلايا الاصطناعية
2025 | المؤلف: Mai P. Tran وآخرون | المجلة: Nature Nanotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يقدم المؤلفون إطارًا مفاهيميًا لبناء خلايا اصطناعية باستخدام طي RNA داخل حويصلات دهنية. على عكس طي DNA، يسمح الترميز الجيني لـ RNA لهذه الخلايا الاصطناعية بإنتاج وحداتها البنائية بشكل مستقل من خلال عمليات نشطة وغير متوازنة. يختلف هذا النهج عن الطرق التقليدية التي تقتصر فقط على احتواء هياكل DNA. إن دمج الوظائف،…
-
مادة بكتيرية فوق جزيئية لمنع وعلاج الأغشية الحيوية المرتبطة بالنباتات
2025 | المؤلف: Jinghan Yang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)يتناول القسم التحديات المتعلقة بعلاج الأغشية الحيوية البكتيرية على النباتات، والتي تعيق فعالية المبيدات البكتيرية بسبب المقاومة الناتجة عن الأغشية الحيوية وضعف الالتصاق على أسطح الأوراق. يقدم المؤلفون مادة جديدة ذات تركيب ذاتي التجميع متوافقة حيوياً وتتميز بهيكل فوق جزيئي طبقي، مما يعزز الاحتفاظ على أوراق النباتات بينما يمنع ويعالج الأغشية الحيوية البكتيرية بشكل فعال.…
-
تحديد في السيليكو لمركبات جديدة تستهدف بروتين FKBP5 البشري المرتبط بالتوتر في الاضطرابات النفسية
2025 | المؤلف: Ovinuchi Ejiohuo وآخرون | المجلة: PLoS ONE | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تبحث الدراسة في تفاعلات مختلف الروابط مع بروتين FK506 المرتبط بـ 51 (FKBP51 أو FKBP5)، وهو منظم رئيسي للتوتر مرتبط بالاضطرابات النفسية. تستخدم الدراسة تقنية الربط الجزيئي لتقييم الروابط مثل الراباميسين، التاكروليموس، والكركم، حيث تم تحديد الروسوجينين والنيوروسوجينين كأفضل المرشحين بسبب قدرتهم على عبور حاجز الدماغ والدم وإظهار امتصاص معوي عالي. تصنف توقعات السمية هذه…
-
يكشف تحليل التعبير الجيني للخلايا الفردية عن تغييرات ديناميكية في البيئة الدقيقة للكبد خلال تقدم سرطان القولون والمستقيم النقيلي
2025 | المؤلف: Yue Jiang وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: علم المناعة (Immunology)تستكشف هذه الدراسة آليات انتشار السرطان الكبدي في سرطان القولون والمستقيم (CRC)، وهو سبب رئيسي للوفيات المرتبطة بالسرطان. باستخدام نموذج فأر موضعي وتسلسل الخلايا الفردية، تكشف الدراسة عن تغييرات كبيرة في الميكروبيئة الكبدية خلال كل من المراحل السابقة للانتشار والمراحل الانتشارية. ومن النتائج الملحوظة تحديد مجموعة فرعية من العدلات التي تعبر عن مستويات عالية من…
-
الميزات الخلوية والجزيئية لسدادات المخاط في الربو تقدم أدلة حول تشكيلها واستمرارها
2025 | المؤلف: Maude A. Liegeois وآخرون | المجلة: Journal of Clinical Investigation | المجال: علم وظائف الأعضاء (Physiology)تبحث الدراسة في تكوين واستمرار سدادات المخاط في الربو، مع تسليط الضوء على دور الحمضات وغيرها من خلايا المناعة. باستخدام التحليل النسيجي والبروتيوميات على مستوى الخلية الواحدة، فحصت الدراسة مجاري الهواء المسدودة بالمخاط من 14 مريضًا بالربو (9 حالات ربو قاتل و5 حالات ربو غير قاتل) جنبًا إلى جنب مع مجموعات التحكم التي تضم أفرادًا…
-
التوافق الجيني والترابط البيئي يدفعان انتشار جينات مقاومة المضادات الحيوية
2025 | المؤلف: David Lund وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)تسلط الأبحاث الضوء على القضية الحرجة لجينات مقاومة المضادات الحيوية المتنقلة (ARGs) التي تنتشر من خلال النقل الجيني الأفقي (HGT)، مما يشكل تهديدًا كبيرًا للصحة العامة العالمية. تهدف الدراسة إلى توضيح العوامل الجينية والبيئية التي تسهل نقل ARG بنجاح، باستخدام نهج تطوري لتحليل حوالي 1 مليون جينوم بكتيري. تم تكملة هذا التحليل بأكثر من 20,000…
-
رسم خرائط المادة البيضاء للناقلات العصبية يكشف بصمات كيميائية عصبية للسكتة الدماغية
2025 | المؤلف: Pedro Alves وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)قسم “الطرق” في ورقة البحث يحدد تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، مع دمج التحليلات الإحصائية لتقييم العلاقات بين المتغيرات. شملت جمع البيانات استبيانًا منظمًا تم إدارته لعينة سكانية، مما يضمن ديموغرافية تمثيلية. تم تحديد حجم العينة بناءً على تحليل القوة لتحقيق دلالة إحصائية كافية. شملت الطرق التحليلية…
-
DTIAM: إطار موحد للتنبؤ بتفاعلات الأدوية مع الأهداف، والألفة المرتبطة بها وآليات الأدوية
2025 | المؤلف: Zhangli Lu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)يتكون إطار عمل DTIAM من ثلاثة مكونات رئيسية: تعلم تمثيل الجزيئات ذاتية الإشراف، تعلم تمثيل البروتينات غير المراقب، ودمج التمثيل لمهام استنتاج الأدوية والأهداف عبر التعلم الآلي الآلي (AutoML). يستخدم تعلم تمثيل الجزيئات ذاتية الإشراف نهجًا على غرار BERT من خلال نموذج يسمى BERMol، الذي يتعلم تمثيلات متجهية للتركيبات الجزيئية من بيانات غير مصنفة على…
-
رسم الخرائط المكاني الزمني للبروتينات خارج الخلوية عبر TyroID المتوافق مع الحياة
2025 | المؤلف: Zijuan Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الخلوي (Cell Biology)تعتبر البروتينات خارج الخلوية حاسمة للإشارات داخل الخلوية والتواصل بين الخلايا، مما يؤثر بشكل كبير على الصحة والمرض. لقد أدت التطورات الأخيرة في تقنيات وسم القرب (PL) إلى تحسين رسم خرائط البروتينات خارج الخلوية؛ ومع ذلك، كانت قابليتها للتطبيق في الجسم الحي محدودة. تقدم هذه الدراسة TyroID، وهي طريقة مبتكرة متوافقة مع الجسم الحي للوسم…
-
تسلسل القراءة الطويل يعزز اكتشاف التغيرات المرضية والجديدة في المرضى الذين يعانون من أمراض نادرة
2025 | المؤلف: Shruti Sinha وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الوراثة (Genetics)يستعرض قسم “الطرق” الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يوضح اختيار المشاركين، بما في ذلك معايير الإدراج والاستبعاد، بالإضافة إلى حسابات حجم العينة لضمان القوة الإحصائية. استخدمت الدراسة تصميم تجربة عشوائية محكومة، حيث تم توزيع المشاركين على مجموعة العلاج أو مجموعة التحكم. شملت جمع البيانات تقييمات وقياسات موحدة، تم إجراؤها في البداية وفي فترات المتابعة.…