الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
التحليل الحاسوبي للببتيدات المضادة للميكروبات المستهدفة لمستقبلات رئيسية في الأمراض القلبية الوعائية المرتبطة بالعدوى: رؤى من الربط الجزيئي والديناميات
2025 | المؤلف: Doni Dermawan وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)يكشف التحليل الحسابي للببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs) التي تستهدف مستقبلات رئيسية مرتبطة بأمراض القلب والأوعية الدموية المرتبطة بالعدوى (CVDs) عن نتائج مهمة تتعلق بقدراتها على الارتباط واستقرارها. أظهرت محاكاة التفاعل الجزيئي والديناميكي أن Tachystatin وThermolysin وPleurocidin وSubtilisin A أظهرت تفاعلات ملائمة مع مستقبلات مثل ACE2 وCRP وMMP9 وNLRP3 وTLR4، متفوقة على المثبط القياسي DX600. ومن…
-
تحسين فائدة بيانات زينيوم في الموقع من خلال تقييم الجودة وتحليل أفضل ممارسات سير العمل
2025 | المؤلف: Sergio Marco Salas وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم قسم ورقة البحث نظرة عامة على منصة Xenium In Situ، وهي تقنية جديدة للتعبير الجيني المكاني تم تطويرها بواسطة 10x Genomics، والتي تمكن من رسم خرائط لمئات الجينات بدقة تحت خلوية. في ضوء العدد المتزايد من تقنيات التعبير الجيني المكاني المتاحة، يؤكد المؤلفون على أهمية اختيار المنصات المناسبة والالتزام بإرشادات التحليل. تدرس الدراسة 25…
-
تحليلات GWAS ونسخ الجينوم تكشف أن ZmGRAS15 ينظم تحمل الجفاف وإطالة الجذور في الذرة
2025 | المؤلف: Dongmei Wang وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علوم النبات (Plant Science)تبحث هذه الدراسة في الآليات الجزيئية لتحمل الجفاف في الذرة، وهو عامل حاسم لنموها وتطورها تحت الضغط غير الحيوي. تستخدم الدراسة نموذجًا خطيًا مختلطًا (MLM) على 362 خطًا من الذرة، حيث تم تحديد 40 موضعًا مرتبطًا و150 جينًا مرشحًا مرتبطًا بمعدلات البقاء تحت ظروف الجفاف. بالإضافة إلى ذلك، كشفت تحليل النسخ الجيني لخطوط تحمل الجفاف…
-
MYC ecDNA يعزز التباين والمرونة داخل الورم في سرطان البنكرياس
2025 | المؤلف: Elena Fiorini وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث دور التباين داخل الورم والمرونة الظاهرية في تقدم الورم ومقاومة العلاج، لا سيما في سرطان الغدة البنكرياسية القنوي (PDAC). يحدد المؤلفون الحمض النووي خارج الصبغي (ecDNA) كمساهم رئيسي في التضخيم البؤري العالي لمستويات عالية من الأورام، وخاصة MYC، الذي يظهر تباينًا في PDAC. يوضحون أن التغيرات في جرعة MYC،…
-
Spotiphy يمكّن النسخ الجيني الشامل المكاني على مستوى الخلية الواحدة عبر قسم كامل
2025 | المؤلف: Jiyuan Yang وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم استخدام فئران 5xFAD و C57BL/6J التي تبلغ من العمر أربعة أشهر للتحقيق في عمليات بيولوجية محددة. تم تربية الحيوانات في ظروف محكومة في مستشفى سانت جود لأبحاث الأطفال وجامعة توماس جيفرسون، مع الالتزام بدورة ضوء/ظلام مدتها 12 ساعة مع وصول غير مقيد إلى الطعام والماء. تم الموافقة على جميع البروتوكولات التجريبية…
-
هضم النشا: تحديث شامل حول آليات التعديل الأساسية وطرق تقييمه في المختبر
2025 | المؤلف: Daniela Freitas وآخرون | المجلة: Trends in Food Science & Technology | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تقدم هذه القسم نظرة شاملة على المنهجيات المستخدمة لمحاكاة هضم النشا في المختبر، مع تسليط الضوء على أهمية فهم كل من معدل ومدى هضم النشا من أجل الآثار الغذائية والصحية. ويؤكد على أنه بينما تعتبر النماذج في المختبر مفيدة بسبب بساطتها وقابليتها للتكرار، إلا أنها غالبًا ما تفشل في عكس الحقائق الفسيولوجية بدقة، خاصة في…
-
فتح الإمكانيات العلاجية للمركبات النباتية غير المستكشفة كعوامل واقية للكبد من خلال دمج علم الأدوية الشبكي والتحليل الحاسوبي
2025 | المؤلف: Pranali Jadhav وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تسلط هذه الدراسة الضوء على الحاجة الملحة لاستراتيجيات وقائية وعلاجية مبتكرة في أمراض الكبد، التي تمثل أكثر من مليوني وفاة سنويًا. تجمع الدراسة بين تقنيات الحوسبة المتقدمة والمعرفة التقليدية بالأعشاب لتحديد المركبات المحتملة الواقية للكبد. من خلال استخدام علم الأدوية الشبكي لتحديد أهداف البروتين المرتبطة باضطرابات الكبد واختيار المركبات النباتية بناءً على تنوعها الجزيئي، أجرت…
-
خلايا اصطناعية من الحمض النووي استجابة لتنظيم الاتصال والسلوك للخلايا الثديية
2025 | المؤلف: Miao Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش قسم الورقة البحثية تطوير خلايا اصطناعية قابلة للتحفيز مدعومة بالحمض النووي، تُسمى STARM (الخلايا الاصطناعية للتواصل المستهدف والمنظم بين خلايا الثدييات)، والتي تم تصميمها للتفاعل مع خلايا الثدييات من خلال التواصل الاصطناعي المعتمد على الاتصال. تم بناء هذه الخلايا الاصطناعية باستخدام تجميع ذاتي للحمض النووي تحت التحكم في درجة الحرارة وفصل الطور السائل-السائل (LLPS)…
-
شريحة ميكروفلويدية متكاملة لتحليل الحويصلات خارج الخلوية للعدلات وتشخيص سرطان المعدة
2025 | المؤلف: Dan Yu وآخرون | المجلة: ACS Nano | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم الدراسة شريحة ميكروفلويدية متكاملة لتحليل الحويصلات خارج الخلوية المشتقة من العدلات (NEVs)، والتي تعتبر علامات حيوية محتملة في تقدم المرض، وخاصة سرطان المعدة (GC). تسهل الشريحة الفصل المناعي للحويصلات NEVs الموجبة لـ CD66b والكشف المتعدد عن الميكروRNAs (miRNAs) المحتواة فيها، والتي تُسمى توقيعات NEV، باستخدام 10 ميكرولتر فقط من عينات المصل. حقق تصميم القناة…
-
الدهون الأيونية المستوحاة من البربارين لاستقرار الهيكل الذاتي واستهداف توصيل العلاجات النووية إلى الدماغ
2025 | المؤلف: Xufei Bian وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)قسم “طرق” في ورقة البحث يوضح تصميم التجارب والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب متنوعة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة تأثيراتها على النتائج ذات الأهمية. شملت جمع البيانات أدوات وبروتوكولات موحدة لضمان الموثوقية…