الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
تناول اللوز يعدل الميكروبيوم المعوي والميتابولوم بالتزامن مع تحسين علامات القلب والأوعية الدموية والالتهابات
2025 | المؤلف: Gwoncheol Park وآخرون | المجلة: npj Science of Food | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تبحث الدراسة في تأثير تناول اللوز كوجبة خفيفة على صحة الأمعاء والاضطرابات الأيضية المرتبطة بأنماط النظام الغذائي الغربي، وخاصة النظام الغذائي الأمريكي المتوسط (AAD). تم إجراء تجربة تغذية عشوائية متقاطعة شملت خمسة عشر بالغًا يعانون من زيادة الوزن أو السمنة، حيث تمت مقارنة نظام غذائي أمريكي متوسط لمدة 4 أسابيع مع نظام غذائي متساوي السعرات…
-
نموذج دمج للتنبؤ ببقاء مرضى سرطان القولون والمستقيم بناءً على الصورة النسيجية والتغيرات الجينية
2025 | المؤلف: Binsheng He وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الأشعة والطب النووي والتصوير الطبي (Radiology, Nuclear Medicine and Imaging)تتناول ورقة البحث القضية الحرجة المتعلقة بتوقع البقاء على قيد الحياة لدى مرضى سرطان القولون والمستقيم (CRC)، وهي حالة مرتبطة بمراضة ووفيات كبيرة. يبرز المؤلفون الاستكشاف المحدود لدمج خوارزميات التعلم العميق المتقدمة مع الصور النسيجية والامتيازات المحتملة لدمج هذه الصور مع البيانات الجزيئية لتحسين توقعات البقاء. لمعالجة هذه الفجوة، يقترحون إطار عمل جديد للتعلم العميق…
-
تحليل متعدد الأوميك يكشف عن التخليق الحيوي والتراكم المحدد للأنسجة للقلويدات ثنائية التيربين في Aconitum japonicum
2025 | المؤلف: Megha Rai وآخرون | المجلة: Journal of Natural Medicines | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تتركز الأبحاث حول *Aconitum japonicum*، وهي نبات معمر سام من اليابان، على توضيح المسارات الحيوية لتخليق القلويات الديتيربينية، وهي مركبات نشطة بيولوجيًا ذات إمكانات صيدلانية كبيرة. من خلال استخدام تحليلات الميتابولوم والترانسكريبتوم عالية الإنتاجية عبر أربعة أنسجة متميزة—الورقة، الجذر الأم، الجذر الابن، والجذر الصغير—تدمج الدراسة هذه البيانات للكشف عن أنماط التعبير الجيني وملفات الميتابوليت المرتبطة…
-
تصميم حاسوبي لبناء لقاح متعدد الإبيتوبي يستهدف بروتين السنبلة لفيروس SARS-CoV-2 ويثير استجابات مناعية قوية في السليكو
2025 | المؤلف: Varughese Deepthi وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تركز الأبحاث على تطوير بناء لقاح متعدد الإبيتوبي (MEVC) يستهدف بروتين S لفيروس SARS-CoV-2 لمعالجة التحديات التي تطرحها المتغيرات الناشئة. من خلال الفحص الحسابي الشامل، تحدد الدراسة مجموعة من الإبيتوبيات، بما في ذلك الإبيتوبيات الخطية وغير الخطية لبروتينات B، بالإضافة إلى إبيتوبيات CD8+ و CD4+ T-cell، محققة تغطية تصل إلى 90.03% من السكان العالميين. تم…
-
رسم خرائط موضعي للخلايا المرتبطة بالسمات المعقدة لدى الإنسان
2025 | المؤلف: Liyang Song وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم طريقة جديدة تُسمى رسم الخرائط الجينية المكانية للخلايا للسمات المعقدة (gsMap)، والتي تدمج بيانات النسخ الجيني المكاني مع إحصائيات دراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) لرسم خرائط مكانية للخلايا ذات الصلة بالسمات المعقدة البشرية، بما في ذلك الأمراض المختلفة. قام المؤلفون بتقييم gsMap باستخدام مجموعات بيانات النسخ الجيني المكاني الجنينية من 25…
-
تستهدف الزيوت الأساسية للنباتات TRPV3 لتجديد الجلد وآلية العمل الهيكلية
2025 | المؤلف: Yang Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الأنظمة الحسية (Sensory Systems)تسلط الأبحاث الضوء على دور السيتروينال، وهو مونوتيربين غير حلقي يُستخدم عادةً في منتجات العناية الشخصية، في تعزيز تجديد الجلد من خلال تنشيط قناة TRPV3، التي تحفز تكاثر الكيراتينوسيت. تقدم الدراسة هياكل مجهرية إلكترونية بالتبريد (cryo-EM) لقناة TRPV3 البشرية في تعقيد مع مجموعة متنوعة من المونوتيربينات غير الحلقية، بما في ذلك السيتروينال، والستراتال، واللينالول، كاشفةً…
-
تحديد الجينات الرئيسية في التهاب اللثة
2025 | المؤلف: Zhenyun Du وآخرون | المجلة: Frontiers in Genetics | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تقدم هذه القسم نظرة عامة على التهاب اللثة، وهي مشكلة شائعة في صحة الفم تتميز بالتهاب مزمن بسبب العدوى البكتيرية، تؤثر على الأنسجة الداعمة للأسنان. يتأثر تقدم المرض بالعوامل الوراثية، والاستجابات المناعية، والتغيرات في تكوين الميكروبيوم الفموي. غالبًا ما تكون الأعراض المبكرة خفية، مما يؤدي إلى تأخير التدخل الطبي؛ وبالتالي، فإن تحديد العلامات الحيوية للتشخيص…
-
الكشف عن التنوع الهيكلي لآثار المخدرات المهلوسة
2025 | المؤلف: Ryan H. Gumpper وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم النفس السريري (Clinical Psychology)في هذا القسم، يوضح المؤلفون المنهجيات المستخدمة في تخليق وتنقية المركبات الكيميائية. تم استخدام جميع المواد الكيميائية والمذيبات دون تنقية مسبقة. تم إجراء كروماتوغرافيا العمود الفلاش باستخدام جهاز Teledyne ISCO CombiFlash Rf+، بينما تم إجراء كروماتوغرافيا الطور العادي على أعمدة هلام السيليكا مع الهكسان/أسيتات الإيثيل أو ثنائي كلورو الميثان/الميثانول كمذيبات. تم تحقيق التنقية النهائية للمركب…
-
GraphBAN: نهج استقرائي قائم على الرسوم البيانية لتحسين توقع تفاعلات المركبات والبروتينات
2025 | المؤلف: Hamid Hadipour وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)يقدم هذا القسم نظرة عامة على أهمية فهم تفاعلات المركبات والبروتينات (CPIs) في اكتشاف الأدوية المبكر ويقدم GraphBAN، وهو إطار عمل جديد قائم على الرسوم البيانية مصمم للتنبؤ بهذه التفاعلات. يستخدم GraphBAN معلومات ميزات المركبات والبروتينات لأداء تنبؤات الروابط الاستقرائية، مما يسمح له بالتنبؤ بفعالية بالتفاعلات التي تشمل مركبات وبروتينات لم تُرَ من قبل. تعالج…
-
الترميز الجيني والتعبير عن الهيكليات السيتوسكلية من RNA الأورغامي في الخلايا الاصطناعية
2025 | المؤلف: Mai P. Tran وآخرون | المجلة: Nature Nanotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يقدم المؤلفون إطارًا مفاهيميًا لبناء خلايا اصطناعية باستخدام طي RNA داخل حويصلات دهنية. على عكس طي DNA، يسمح الترميز الجيني لـ RNA لهذه الخلايا الاصطناعية بإنتاج وحداتها البنائية بشكل مستقل من خلال عمليات نشطة وغير متوازنة. يختلف هذا النهج عن الطرق التقليدية التي تقتصر فقط على احتواء هياكل DNA. إن دمج الوظائف،…