الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
قاعدة بيانات مطياف الكتلة MALDI-ToF لتحديد وتصنيف البكتيريا عالية الضراوة
2025 | المؤلف: Peter Lasch وآخرون | المجلة: Scientific Data | المجال: الكيمياء الحيوية السريرية (Clinical Biochemistry)تستعرض هذه القسم التقدمات في مطيافية الكتلة بالليزر المدعوم بالمصفوفة / التأين بالوقت (MALDI-ToF MS) كطريقة موثوقة لتوصيف وتحديد البكتيريا المسببة للأمراض، لا سيما في بيئات الميكروبيولوجيا السريرية. على الرغم من توفر قواعد بيانات طيفية شاملة للبكتيريا ذات الأهمية السريرية، لا يزال هناك فجوة في الموارد التي تتناول بشكل خاص البكتيريا شديدة pathogenic (HPB). لمعالجة…
-
SLC29A1 و SLC29A2 هما ناقلات غشاء الخلايا البشرية للنيكوتيناميد
2025 | المؤلف: Mingyang Chen وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)في هذا القسم، يحقق المؤلفون في دور ناقلات النوكليوزيد المتوازنة 1 و2 (ENT1 وENT2)، المشفرة بواسطة SLC29A1 وSLC29A2، في امتصاص النيكوتيناميد (NAM)، وهو سلف حاسم للنيكوتيناميد أدينين ثنائي النوكليوتيد (NAD+). تكشف الدراسة أن ENT1 وENT2 ضروريان للحفاظ على توازن استقلاب النيكوتيناميد ويؤثران بشكل كبير على تركيبة المستقلبات الخلوية وتعبير الجينات المتعلقة بالنيكوتيناميد. علاوة على ذلك،…
-
استطلاع عالمي للميتابولوميات وتحليلات جينومية متعمقة لـ Ruminococcus gnavus تكشف عن اختلافات عبر أنماط حياة المضيف وحالة الصحة
2025 | المؤلف: Sam Nooij وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تبحث هذه الدراسة في بكتيريا الأمعاء Ruminococcus gnavus، التي تتواجد بشكل شائع في أكثر من 90% من الأفراد الأصحاء ولكنها مرتبطة أيضًا بالأمراض الالتهابية المزمنة، وخاصة مرض كرون. قامت الدراسة بتحليل 12,791 ميتاجينوم معوي، مؤكدة الروابط المعروفة مع الأمراض الأيضية ومرض الأمعاء الالتهابي، بينما كشفت عن انتشار أعلى لـ R. gnavus في السكان الغربيين ووفرة…
-
تحليل النسخ المرتبطة بالسيتوكينات المميزة لخلايا T γδ الفعالة يكشف عن منظمات محددة فرعية للتفعيل المحيطي
2025 | المؤلف: Daniel Inácio وآخرون | المجلة: Nature Immunology | المجال: علم المناعة (Immunology)قسم “طرق” في ورقة البحث يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تجارب محكومة لجمع البيانات حول المتغيرات المحددة. تم اختيار المشاركين من خلال طريقة أخذ عينات طبقية لضمان عينة تمثيلية، وتم إجراء تحليلات إحصائية متنوعة لتقييم العلاقات بين المتغيرات ذات الاهتمام. شملت جمع البيانات استخدام أدوات…
-
إطار عمل قائم على التعلم العميق والمحولات البصرية لتحديد سرطان الثدي وأنواعه
2025 | المؤلف: Ishrat Jahan وآخرون | المجلة: Neural Computing and Applications | المجال: الذكاء الاصطناعي (Artificial Intelligence)تقدم هذه البحث إطار عمل متقدم للتعلم العميق للكشف التلقائي عن سرطان الثدي وأنواعه الفرعية باستخدام صور الشرائح الكاملة الملونة بالهيماتوكسيلين والإيوزين (H&E). يتكون الإطار من ثلاثة مكونات رئيسية: مصنف بقع سرطانية، مصنف نوع السرطان، ومصنف على مستوى الشرائح الكاملة. تستخدم الدراسة تصور Score-CAM لتعزيز القابلية للتفسير من خلال تسليط الضوء على المناطق التي تؤثر…
-
نسخ جديدة من EMT التي تقود التحول الخبيث لليف الأنسجة تحت المخاطية الفموية
2025 | المؤلف: Smitha Sammith Shetty وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تبحث الدراسة في التليف تحت المخاطي الفموي (OSF)، وهو حالة مزمنة من الغشاء المخاطي الفموي مرتبطة بزيادة خطر الإصابة بالسرطان. تركز الدراسة على تحديد وتأكيد الجينات الجديدة المعنية في تنظيم الانتقال من الظهارة إلى الميزانشيم (EMT) في OSF. باستخدام تحليل التعبير الجيني التفاضلي مع عتبة LogFC تبلغ -1 و +1 وقيمة padj < 0.05، قام…
-
نهج محسّن كمي للكشف عن سرطان الثدي باستخدام SqueezeNet-SVM
2025 | المؤلف: Anas Bilal وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث نهج هجين جديد، يسمى Q-BGWO-SQSVM، لتصنيف سرطان الثدي الذي يدمج بين مُحسّن الذئب الرمادي الثنائي المستوحى من الكم (Q-BGWO) مع SqueezeNet وآلات الدعم المتجهة (SVM). يعالج هذا الأسلوب قيود أنظمة التشخيص بمساعدة الكمبيوتر الحالية (CAD)، مثل الإفراط في التكيف والاعتماد على مجموعات بيانات موسومة كبيرة، من خلال تعزيز دقة معالجة وتفسير صور الماموجرام.…
-
الدهون المدمرة للأنسجة الحويصلية المتفرعة (BEND) تسهل توصيل mRNA ومجمع ريبونوكليوبروتين CRISPR-Cas9 لتحرير الجينات الكبدية وهندسة خلايا T
2025 | المؤلف: Marshall S. Padilla وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)ظهرت جزيئات الدهون النانوية (LNPs) كنظام توصيل غير فيروسي رائد للعلاجات المعتمدة على mRNA، مع تركيز كبير على تحسين هيكل الدهون القابلة للتأين (ILs). تتميز هذه ILs، التي تتميز بنواة أمينية مرتبطة بذيل الدهون، بفعالية متفاوتة بناءً على تعديلات هيكلية طفيفة. لا يزال التحدي الرئيسي في توصيل LNP هو الهروب من الحويصلات الداخلية لـ mRNA.…
-
توقع ملف ADMET والقدرة المضادة للالتهابات للكاموانغون
2025 | المؤلف: Sompot Jantarawong وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)يتناول القسم المعنون “نظرة عامة” النمذجة التنبؤية لملف ADMET (الامتصاص، التوزيع، الأيض، الإخراج، والسمية) والقدرة المضادة للالتهابات لمركب الشاموانغون، وهو مركب تم التحقيق فيه من قبل سومبوت جانتاراوونغ. تستخدم الدراسة طرق حسابية لتقييم الخصائص الدوائية والسلامة للشاموانغون، بهدف إثبات جدواه كعامل علاجي. تشير النتائج الرئيسية إلى أن الشاموانغون يظهر خصائص ADMET ملائمة، مما يشير إلى…
-
تمثيل الإجماع لرسوم بيانية متعددة للخلايا من مسارات الإشارات الجينية لتوصيف نوع الخلية
2025 | المؤلف: Yu‐An Huang وآخرون | المجلة: BMC Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم القسم نظرة عامة على التحديات والتقدم في توضيح نوع الخلايا باستخدام تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq). تعاني الطرق التقليدية من مشاكل مثل خصوصية العلامات وتأثيرات الدفعة، مما يعقد التعرف الدقيق على أنواع الخلايا بسبب تعقيد التفاعلات الخلوية وشبكات تنظيم الجينات. لمعالجة هذه التحديات، يقدم المؤلفون scMCGraph، وهو إطار حسابي جديد يدمج بيانات التعبير الجيني…