الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوم، البكتيري
-
الليبتوسبيرا والليبتوسبيروز: مراجعة لتصنيفات الأنواع، الجينومات، الهياكل الشكلية، مقاومات المضادات الحيوية، طرق الانتقال، والتجليات السريرية
2026 | المؤلف: Lesley Maurice Bilung وآخرون | المجلة: Current Microbiology | المجال: علم الطفيليات (Parasitology)تقدم هذه القسم نظرة عامة عن داء الليبتوسبيروز، وهو مرض حيواني مهم تسببه أنواع الليبتوسبيرا، مما يؤدي إلى أكثر من مليون حالة وحوالي 60,000 وفاة سنويًا. تطورت التصنيفات التقليدية لليبتوسبيرا إلى مجموعات مرضية، ومتوسطة، وسابروفتيك بسبب التصنيف الجزيئي، مما يكشف عن علاقات تطورية معقدة بين العديد من الأنواع. تكون عبء المرض ملحوظًا بشكل خاص في…
-
إزالة النيتروجين هي سمة مجتمعية مع مسارات جزئية تهيمن عبر الجينومات والبيئات الميكروبية
2025 | المؤلف: Grace Pold وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التلوث (Pollution)قسم “الطرق” في ورقة البحث يوضح الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة مزيجًا من الأساليب الكمية والنوعية، بما في ذلك التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. تم تنفيذ منهجيات محددة، مثل التجارب المسيطر عليها، الاستطلاعات، أو المحاكاة، لضمان موثوقية وصلاحية النتائج. تم تحليل البيانات باستخدام برامج إحصائية مناسبة، مع…
-
أدلة تطورية على التوسع الوطني لسلالات Brucella melitensis تدفع إعادة ظهور وباء حمى البروسيلات البشرية في جيانغسو، الصين
2025 | المؤلف: Weixiang Wang وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تستكشف الدراسة عودة داء البروسيلات البشري في مقاطعة جيانغسو، مع التركيز على مصادر وديناميات انتقال سلالات بروسيلة ميلتينسيس. باستخدام البيوتيب التقليدي، وتحليل تسلسل الجينوم الكامل، وتحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات الفردية (WGS-SNP)، ونمط تسلسل الجينوم الأساسي (cgMLST)، قام الباحثون بتحليل 89 عينة، مؤكدين جميعها كـ B. melitensis—16 كنوع حيوي 1 و73 كنوع حيوي 3. أظهرت السلالات…
-
الجينات المقاومة للمضادات الحيوية في التربة العالمية مرتبطة بزيادة المخاطر والترابط مع مقاومة البشر
2025 | المؤلف: Yuxiang Zhao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التلوث (Pollution)تسلط هذه القسم من ورقة البحث الضوء على الدور الحاسم للتربة كمستودع لجينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) وتأثيراتها على صحة الإنسان ضمن إطار الصحة الواحدة. تحلل الدراسة مجموعة بيانات كبيرة تتكون من 3,965 عينة ميتاجينومية من موائل مختلفة، بما في ذلك التربة والبراز والمياه العادمة، إلى جانب 8,388 جينوم لعزلات *Escherichia coli*. تشير النتائج إلى…
-
تسلسل طويل القراءة مع تحديد الجينوم يوسع التنوع الميكروبي المعروف عبر المواطن الأرضية
2025 | المؤلف: Mantas Sereika وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على التقدمات الكبيرة التي جعلها تسلسل الحمض النووي طويل القراءة وعالي الإنتاجية ممكنة في استعادة الجينومات الميكروبية من عينات بيئية معقدة. من خلال تسلسل نانوبور العميق وطويل القراءة لـ 154 عينة من التربة والرواسب من مشروع Microflora Danica، نجح المؤلفون في تحديد جينومات من 15,314 نوعًا ميكروبيًا لم يتم وصفه سابقًا. استخدمت…
-
إعادة بناء الجينوم التكاملي تكشف عن التباين في استخدام الكربوهيدرات عبر بكتيريا البيفيدوبكتيريا المعوية البشرية
2025 | المؤلف: Aleksandr A. Arzamasov وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “طرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، معتمدين على التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة استخدام مجموعات التحكم، والتوزيع العشوائي، والتعمية لتقليل التحيز وضمان موثوقية النتائج. تم تحليل البيانات باستخدام برامج إحصائية مناسبة، مع تحديد الأهمية عند عتبة قيمة p تبلغ…
-
القواعد العالمية تحكم عدد نسخ البلازميد
2025 | المؤلف: Paula Ramiro-Martínez وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التغيرات والعوامل المحددة لعدد نسخ البلازميد (PCN) في البلازميدات البكتيرية، وهي جزيئات DNA تتكرر بشكل مستقل. من خلال استخدام بيانات تسلسل DNA واسعة النطاق، يكشف المؤلفون أن PCN يتغير بشكل كبير، حيث يغطي ما يقرب من ثلاثة أوامر من الحجم، وهو مرن تجاه التغيرات في السياق الجينومي. تسلط الدراسة…
-
تتبع الانتشار الدولي والإقليمي لبكتيريا كليبسيلا الرئوية المنتجة بالتعاون KPC/NDM
2025 | المؤلف: Feilong Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)تسلط الأبحاث الضوء على اتجاه مقلق في الزيادة المشتركة لإنتاج KPC و NDM في كليبسيلا الرئوية المقاومة للكاربينيم (KN-CRKP)، ومع ذلك تلاحظ نقص التحليلات العالمية الشاملة. تم جمع ما مجموعه 968 عينة محلية من CRKP من ست مقاطعات في الصين، بالإضافة إلى 64,354 جينوم من GenBank، مما كشف عن 413 جينوم KN-CRKP من 32 دولة…
-
تحليل شامل لفهرس الجينوم لمقاومة الجراثيم، الفيروسات، والمتحولات في ميكروبيوم أمعاء القوارض البرية
2025 | المؤلف: Kai-Meng Shang وآخرون | المجلة: npj Biofilms and Microbiomes | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة ميكروبيوم الأمعاء للقوارض البرية كمصدر مهم لجينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) وجينات عوامل الضراوة (VFGs). من خلال تحليل 12,255 جينوم بكتيري مشتق من الأمعاء، حدد الباحثون ما مجموعه 8,119 ARGs و7,626 VFGs، مع كون ARGs الأكثر شيوعًا تمنح مقاومة للإلفاميسين والمضادات الحيوية متعددة الفئات. ومن الجدير بالذكر أن عائلة Enterobacteriaceae، وخاصة Escherichia coli،…
-
التحقيق في الجزيرة الجينومية 2 يكشف تطور جنس بروسيلا
2025 | المؤلف: Menachem Banai | المجلة: Scientific Reports | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تحقيق الجزيرة الجينومية 2 (GI-2) في جنس بروسيلا يكشف عن رؤى مهمة في تاريخه التطوري. أظهر تحليل الجينوم الخاص بالبروسيلا فاج Pr تشابهات تسلسلية مع منطقة DNA محددة في الكروموسوم 1 من Ochrobactrum anthropi ATCC 49188 و Brucella GI-2. وهذا يشير إلى أن GI-2 اندمجت في منطقة DNA مشتركة داخل الكروموسومات لكلا السلالتين، على الرغم…