الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوم، البكتيري
-
تحديد المواقع الكبسولية المعتمدة على الناقل المرتبطة بالقدرة الغازية للإشريكية القولونية
2026 | المؤلف: Rebecca A. Gladstone وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الغدد الصماء (Endocrinology)تسلط الأبحاث الضوء على دور كبسولات البكتيريا المتعددة السكاريد في تعزيز التنوع المستضدي وتسهيل التهرب المناعي، خاصة في عدوى الإشريكية القولونية، بما في ذلك تلك التي تسببها الإشريكية القولونية الممرضة خارج الأمعاء (ExPEC). تتناول الدراسة الفجوة في الطرق الجينية لتصنيف كبسولات الإشريكية القولونية، قاعدة بيانات تصنيفية حاسوبية لمواقع الكبسولة (K) المعتمدة على ناقلات ATP-binding cassette…
-
نمط حياة بكتيريا Acinetobacter baumannii يشمل استعمار المواد النباتية المتحللة في التربة وانتشارها في الهواء
2026 | المؤلف: Gottfried Wilharm وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)تبحث الدراسة في بيئة وتطور *Acinetobacter baumannii*، وهو مُمْرِض مستشفى سالب الجرام معروف بمقاومته السريعة للمضادات الحيوية. تكشف الدراسة أن *A. baumannii* يزدهر في التربة والمواد النباتية المتحللة، ويمكن أن ينتشر من خلال الجسيمات المحمولة جواً. تسهم هذه القدرة على التكيف في مرونته ضد الجفاف والإشعاع والمضادات الحيوية، مما يسهل استقراره في بيئات المستشفيات. من…
-
أربعة أنواع جديدة من Planctomicrobium تم عزلها من الحمأة السائلة أو مياه التسرب من كومة السماد في شمال ألمانيا
2026 | المؤلف: Nicolai Kallscheuer وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم عزل أربعة سلالات غير ملونة، SH527^T، SH661^T، SH664^T، وSH668^T، من مياه الصرف الصحي وتسرب كومة السماد في شمال ألمانيا. أظهرت التحليلات النشوية باستخدام خمسة علامات أن هذه السلالات تقع ضمن جنس *Planctomicrobium*، عائلة *Planctomycetaceae*، وشعبة *Planctomycetota*. جميع السلالات تظهر نموًا هوائيًا غير ذاتي التغذية وتظهر ملفًا محايدًا وحراريًا. من الجدير بالذكر…
-
أنماط التواجد المشترك على مستوى الجينوم تربط العناصر الجينية المتنقلة ومقاومة المضادات الحيوية وأنظمة الدفاع في بكتيريا الزائفة الزنجارية
2026 | المؤلف: Samara T. Choudhury وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في العوامل الجينية التي تسهم في النجاح الممرض لـ *Pseudomonas aeruginosa*، وهو مصدر قلق كبير للصحة العامة بسبب سلالاته المقاومة المتعددة للأدوية واستمراريته في البيئات الطبية. من خلال تحليل مجموعة بيانات تضم 1,045 جينومًا كاملاً، تحدد الدراسة مجموعة متنوعة من العناصر الجينية المتنقلة (MGEs)، بما في ذلك 173 بلازميد، 745 عنصر تكاملي وتزاوج…
-
تعديل الحمض النووي الفوسفورثيواتي بواسطة أنظمة BREX من النوع 4 في الميكروبيوم المعوي البشري
2026 | المؤلف: Yifeng Yuan وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطاقة المتجددة والاستدامة والبيئة (Renewable Energy, Sustainability and the Environment)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التعديل الفريد للحمض النووي الميكروبي المعروف باسم الفوسفورثيوات (PT)، والذي يتميز باستبدال الأكسجين غير الجسري في هيكل الحمض النووي بالكبريت. أجرى المؤلفون تحليلًا شاملاً لـ 13,663 جينومًا من ميكروبات الأمعاء البشرية، كاشفين أن 6.3% تحتوي على جينات مرتبطة بـ PT، تحديدًا من عائلتي جينات dnd و ssp، الموجودة بشكل…
-
الليبتوسبيرا والليبتوسبيروز: مراجعة لتصنيفات الأنواع، الجينومات، الهياكل الشكلية، مقاومات المضادات الحيوية، طرق الانتقال، والتجليات السريرية
2026 | المؤلف: Lesley Maurice Bilung وآخرون | المجلة: Current Microbiology | المجال: علم الطفيليات (Parasitology)تقدم هذه القسم نظرة عامة عن داء الليبتوسبيروز، وهو مرض حيواني مهم تسببه أنواع الليبتوسبيرا، مما يؤدي إلى أكثر من مليون حالة وحوالي 60,000 وفاة سنويًا. تطورت التصنيفات التقليدية لليبتوسبيرا إلى مجموعات مرضية، ومتوسطة، وسابروفتيك بسبب التصنيف الجزيئي، مما يكشف عن علاقات تطورية معقدة بين العديد من الأنواع. تكون عبء المرض ملحوظًا بشكل خاص في…
-
إزالة النيتروجين هي سمة مجتمعية مع مسارات جزئية تهيمن عبر الجينومات والبيئات الميكروبية
2025 | المؤلف: Grace Pold وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التلوث (Pollution)قسم “الطرق” في ورقة البحث يوضح الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة مزيجًا من الأساليب الكمية والنوعية، بما في ذلك التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. تم تنفيذ منهجيات محددة، مثل التجارب المسيطر عليها، الاستطلاعات، أو المحاكاة، لضمان موثوقية وصلاحية النتائج. تم تحليل البيانات باستخدام برامج إحصائية مناسبة، مع…
-
إصدار GTDB 10: تصنيف كامل ومنهجي لـ 715,230 جينوم بكتيري و17,245 جينوم أثري
2025 | المؤلف: Donovan H. Parks وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قاعدة بيانات تصنيف الجينوم (GTDB) تقدم تصنيفًا متسقًا من الناحية النشوء والتطور ومعدلًا موحدًا للجينومات بدائية النواة، باستخدام بيانات من قاعدة بيانات تجميع NCBI. اعتبارًا من الإصدار 10 (R10-RS226)، تشمل GTDB 715,230 جينومًا بكتيريًا و17,245 جينومًا أثريًا، منظمة في 136,646 مجموعة من الأنواع البكتيرية و6,968 مجموعة من الأنواع الأثرية. تشير النتائج إلى انخفاض معدل اكتشاف…
-
أدلة تطورية على التوسع الوطني لسلالات Brucella melitensis تدفع إعادة ظهور وباء حمى البروسيلات البشرية في جيانغسو، الصين
2025 | المؤلف: Weixiang Wang وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تستكشف الدراسة عودة داء البروسيلات البشري في مقاطعة جيانغسو، مع التركيز على مصادر وديناميات انتقال سلالات بروسيلة ميلتينسيس. باستخدام البيوتيب التقليدي، وتحليل تسلسل الجينوم الكامل، وتحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات الفردية (WGS-SNP)، ونمط تسلسل الجينوم الأساسي (cgMLST)، قام الباحثون بتحليل 89 عينة، مؤكدين جميعها كـ B. melitensis—16 كنوع حيوي 1 و73 كنوع حيوي 3. أظهرت السلالات…
-
الجينات المقاومة للمضادات الحيوية في التربة العالمية مرتبطة بزيادة المخاطر والترابط مع مقاومة البشر
2025 | المؤلف: Yuxiang Zhao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التلوث (Pollution)تسلط هذه القسم من ورقة البحث الضوء على الدور الحاسم للتربة كمستودع لجينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) وتأثيراتها على صحة الإنسان ضمن إطار الصحة الواحدة. تحلل الدراسة مجموعة بيانات كبيرة تتكون من 3,965 عينة ميتاجينومية من موائل مختلفة، بما في ذلك التربة والبراز والمياه العادمة، إلى جانب 8,388 جينوم لعزلات *Escherichia coli*. تشير النتائج إلى…