الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوم، البكتيري
-
أطلس عالمي ومحركات مقاومة المضادات الحيوية في السالمونيلا خلال الفترة من 1900 إلى 2023
2025 | المؤلف: Yanan Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علوم الأغذية (Food Science)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التحليل العالمي لمقاومة المضادات الحيوية (AMR) في السالمونيلا، استنادًا إلى مجموعة بيانات شاملة تضم 208,233 جينوم تم جمعها من 148 دولة بين عامي 1900 و2023. تكشف الدراسة عن تباين جغرافي كبير في مستويات AMR، تأثرًا بعوامل مثل الموقع، المصدر، والسيروفار. ومن الجدير بالذكر أن مستويات AMR قد زادت عبر…
-
علم الأوبئة الجينومية والديناميكا النشئية لعزلات Acinetobacter baumannii في مجرى الدم في الصين
2025 | المؤلف: Qixia Luo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)في السنوات الأخيرة، أصبح Acinetobacter baumannii مسببًا رئيسيًا للعدوى المكتسبة من المستشفيات على مستوى العالم، وخاصة المرتبطة بعدوى مجرى الدم (BSIs) التي تظهر معدلات وفيات تتجاوز 60%. قامت هذه الدراسة بتحليل 1506 عزلة فريدة من A. baumannii المسببة لـ BSI من 76 مستشفى في جميع أنحاء الصين على مدى عقد من الزمن (2011-2021)، كاشفة عن…
-
تباين مستوى السلالة بين Lactobacillus crispatus وLactobacillus iners كما تم تحديده بواسطة الميتاجينوميات المقارنة
2025 | المؤلف: Sai Ravi Chandra Nori وآخرون | المجلة: npj Biofilms and Microbiomes | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة الميكروبيوم المهبلي للنساء الحوامل في أيرلندا، مع التركيز على نظامه البيئي ذو التنوع المنخفض الذي يهيمن عليه بشكل أساسي أنواع اللاكتوباسيلس، وخاصة اللاكتوباسيلس كريسباتوس واللاكتوباسيلس إينيرس. باستخدام تسلسل الشوتغن لتحليل 354 ميتاجينوم مهبلي، تحدد الأبحاث أنواعًا فرعية مختلفة وتؤكد على أهمية التباين على مستوى السلالة في فهم آليات الاستعمار وتفاعلات المضيف والميكروب. تشمل…
-
يسهل إنتاج البكتيريوسين ظهور Enterococcus faecium المقاوم للفانكومايسين في المستشفيات
2025 | المؤلف: Emma G. Mills وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: الأمراض المعدية (Infectious Diseases)قسم “الطرق” يحدد تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، حيث نفذوا سلسلة من التجارب المضبوطة لجمع البيانات حول المتغيرات المحددة. تضمنت المنهجيات الرئيسية تحليلات إحصائية، مثل نماذج الانحدار واختبار الفرضيات، لتقييم العلاقات بين المتغيرات المستقلة والتابعة. شمل جمع البيانات عملية أخذ عينات منهجية، مما يضمن أن حجم العينة كان كافيًا…
-
التوافق الجيني والترابط البيئي يدفعان انتشار جينات مقاومة المضادات الحيوية
2025 | المؤلف: David Lund وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)تسلط الأبحاث الضوء على القضية الحرجة لجينات مقاومة المضادات الحيوية المتنقلة (ARGs) التي تنتشر من خلال النقل الجيني الأفقي (HGT)، مما يشكل تهديدًا كبيرًا للصحة العامة العالمية. تهدف الدراسة إلى توضيح العوامل الجينية والبيئية التي تسهل نقل ARG بنجاح، باستخدام نهج تطوري لتحليل حوالي 1 مليون جينوم بكتيري. تم تكملة هذا التحليل بأكثر من 20,000…
-
ساهمت كليبسيلا الرئوية عالية الفوعة المحددة جينومياً في زيادة الوفيات المبكرة
2025 | المؤلف: Yunfei Tang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)قسم “طرق” يوضح الأساليب التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يتناول اختيار المشاركين، وتصميم التجارب، والتقنيات الإحصائية المستخدمة في تحليل البيانات. يتم وصف منهجيات محددة، مثل التجارب المضبوطة أو الدراسات الملاحظة، جنبًا إلى جنب مع أي أدوات أو أجهزة مستخدمة للقياس. بالإضافة إلى ذلك، قد يتضمن القسم معلومات حول طرق أخذ العينات، ومعايير الإدراج والاستبعاد للمشاركين،…
-
التحليل الجينومي لعزلات بروسيلة ميلتينسيس المستعادة من البشر في جنوب تونس على مدى 35 عامًا بين 1988 و2022
2025 | المؤلف: Boutheina Ksibi وآخرون | المجلة: BMC Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة الخصائص الجينومية لـ 24 سلالة من *Brucella melitensis* المعزولة من عدوى بشرية في جنوب تونس على مدى 35 عامًا. باستخدام تسلسل الجينوم الكامل (WGS)، كانت الأبحاث تهدف إلى تحليل العلاقات الكلونية، وعوامل مقاومة المضادات الحيوية، وعوامل الضراوة لهذه السلالات. أظهرت النتائج استقرارًا جينيًا عاليًا، حيث تم تصنيف جميع العزلات على أنها *B.…
-
إعادة تسلسل الجينوم والتحليل المقارن لستربتوكوكوس موتانس في البالغين ذوي مخاطر تسوس عالية ومنخفضة
2025 | المؤلف: Merve Yıldırım Üçüncü وآخرون | المجلة: Scientific Data | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تستكشف هذه الدراسة الخصائص الجينومية لـ *Streptococcus mutans*، وهو عامل ميكروبي رئيسي في تسوس الأسنان، لتحديد الميزات الجينية المرتبطة بمخاطر التسوس المتفاوتة بين البالغين. شملت الأبحاث تسلسل الجينوم الكامل لـ 25 عينة من *S. mutans* من 13 فردًا لديهم نشاط تسوس أسنان مرتفع و12 فردًا خاليًا من التسوس. كشفت تحليل الجينوم الشامل عن إجمالي 2904…
-
هندسة كائن حي معاد ترميزه جينومياً مع كود توقف واحد
2025 | المؤلف: Michael W. Grome وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، يقدم المؤلفون أوكر، وهو كائن مُعاد ترميزه جينياً (GRO) يقوم بنجاح بضغط وظائف الكودونات الزائدة إلى كودون واحد، مما يحرر كودونين أساسيين للتوقف لإعادة التعيين. على وجه التحديد، قاموا باستبدال 1,195 حالة من كودون التوقف TGA وهندسة عوامل الترجمة لتقليل التعرف على UGA الأصلي، مما يسمح بالإدماج الدقيق لحمضين أمينيين غير قياسيين…
-
استطلاع عالمي للميتابولوميات وتحليلات جينومية متعمقة لـ Ruminococcus gnavus تكشف عن اختلافات عبر أنماط حياة المضيف وحالة الصحة
2025 | المؤلف: Sam Nooij وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تبحث هذه الدراسة في بكتيريا الأمعاء Ruminococcus gnavus، التي تتواجد بشكل شائع في أكثر من 90% من الأفراد الأصحاء ولكنها مرتبطة أيضًا بالأمراض الالتهابية المزمنة، وخاصة مرض كرون. قامت الدراسة بتحليل 12,791 ميتاجينوم معوي، مؤكدة الروابط المعروفة مع الأمراض الأيضية ومرض الأمعاء الالتهابي، بينما كشفت عن انتشار أعلى لـ R. gnavus في السكان الغربيين ووفرة…