الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوم، البكتيري
-
نمو الميكروبات في أنماط الحياة التنافسية يعزز زيادة الجينات المقاومة للمضادات الحيوية في ميكروبات التربة: رؤى مستندة إلى الصفات الجينية
2025 | المؤلف: Zishu Liu وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: التلوث (Pollution)تبحث الدراسة في ديناميات جينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) داخل المجتمعات الميكروبية في التربة تحت تركيزات متغيرة من المضاد الحيوي أوكسي تتراسيكلين (OTC). باستخدام زراعة الميكروكوزم وعلم الجينوميات الميتاجينية، تكشف الدراسة أن وفرة وغنى ARGs تظهر علاقة غير أحادية مع تركيز المضاد الحيوي، حيث تصل إلى ذروتها عند مستويات متوسطة (0.1 و 0.5 ملغ/ل). ومن…
-
DFAST_QC: أداة تقييم الجودة والتعرف الضريبي للجينومات بدائية النواة
2025 | المؤلف: Mohamed Elmanzalawi وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)توضح هذه القسم تطوير وقدرات DFAST_QC، وهي أداة جديدة مصممة لتعزيز التصنيف الضريبي ومراقبة الجودة للجينومات بدائية النواة. يعد التصنيف الضريبي الدقيق أمرًا حيويًا للبحث البيولوجي، ومع ذلك، غالبًا ما تتطلب أدوات التحقق من الجينوم الحالية موارد حاسوبية واسعة ووقتًا طويلاً، مما يحد من إمكانية الوصول إليها للمشاريع واسعة النطاق. تتناول DFAST_QC هذه التحديات من…
-
معايير للمراقبة الجينومية للصحة الواحدة لبكتيريا الإشريكية القولونية من أستراليا
2025 | المؤلف: A. Watt وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الغدد الصماء (Endocrinology)تسلط هذه الفقرة من ورقة البحث الضوء على الدور الحاسم للجينوميات في فهم انتقال مسببات الأمراض ضمن إطار الصحة الواحدة، مع التركيز بشكل خاص على الإشريكية القولونية. جمعت الدراسة مجموعة بيانات شاملة تتكون من 5,471 تسلسل جينومي للإشريكية القولونية من مصادر متنوعة في أستراليا، بما في ذلك البشر، والحيوانات البرية والماشية، والحيوانات الأليفة، والعينات البيئية،…
-
سلالات متعددة من بروسيلة المالطية تدفع وباء البروسيلات البشرية في مقاطعة شانشي، الصين: دليل من تحليل تسلسل الجينوم الكامل
2024 | المؤلف: Cuihong An وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس الدراسة الديناميات الوبائية لحمى مالطا البشرية الناتجة عن *Brucella melitensis* في مقاطعة شانشي، الصين، باستخدام التصنيف الحيوي التقليدي وتسلسل الجينوم الكامل للبوليمورفisms أحادية النوكليوتيد (SNPs) لتحليل 189 سلالة. كشفت النتائج أن 189 سلالة تم تصنيفها على أنها *B. melitensis*، مع 14 في البيوفار 1، و145 في البيوفار 3، و30 كمتغيرات، موزعة عبر جميع المدن…
-
الجينات المقاومة للمضادات الحيوية المشفرة بواسطة البروفيج تزداد في البيئات المتأثرة بالبشر
2024 | المؤلف: Hanpeng Liao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم البيئة (Ecology)تبحث الدراسة في التوزيع العالمي لجينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) التي تتوسطها الفاجات، وخاصة فيما يتعلق بتأثيرات البشر عبر موائل متنوعة. من خلال تحليل مجموعة بيانات شاملة تضم 38,605 جينوم بكتيري، و1,432 ميتاجينوم، و1,186 ميتا ترانسكريبتوم من 12 بيئة متنوعة، تكشف الدراسة عن زيادة كبيرة في وفرة وتنوع ونشاط جينات ARGs المشفرة بواسطة الفاجات في…
-
تحليل تسلسل الجينوم الكامل لبكتيريا بروسيلا من البشر والحيوانات الأليفة والحياة البرية في جنوب أفريقيا
2024 | المؤلف: Koketso Desiree Mazwi وآخرون | المجلة: The Journal of Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تبحث هذه الدراسة في التركيب الجينومي السكاني لبكتيريا Brucella spp.، وبشكل خاص Brucella abortus وB. melitensis، في جنوب أفريقيا، حيث تشكل البروسيلوز مخاطر صحية كبيرة على البشر والحيوانات الأليفة والحياة البرية. قامت الدراسة بتسلسل الجينومات الكاملة لـ 19 عينة استرجاعية وحللتها باستخدام هوية النوكليوتيد المتوسطة (ANI) والبانجينوميات وطرق تعدد الأشكال النوكليوتيدية الفردية للجينوم الكامل (wgSNP).…
-
التحليل النشوي والجينوميات المقارنة لسلالات بروسيلة أبورتوس وبروسيلة ميلتينسيس في مصر
2024 | المؤلف: Alyaa Elrashedy وآخرون | المجلة: Journal of Molecular Evolution | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة الخصائص الجينومية لثمانية سلالات من *Brucella abortus* وثمانية عشر سلالة من *Brucella melitensis* من مصر، مقارنتها بلقاحات RB51 وREV1. باستخدام مجموعة أدوات RAST، تم توضيح الجينومات، كاشفة عن أطوال تبلغ 3,250,377 زوج قاعدي لـ *B. abortus* و3,285,803 زوج قاعدي لـ *B. melitensis*، مع عدد مشابه من الجينات المرشحة المحددة في سلالات *B.…
-
مقاومة مضادات الميكروبات لنيسرية السيلان في أوروبا في عام 2020 مقارنة بعام 2013 و2018: دراسة رصد جينومي استعادية
2024 | المؤلف: Daniel Golparian وآخرون | المجلة: The Lancet Microbe | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة السكان السيلاني في المنطقة الاقتصادية الأوروبية (EEA) في عام 2020، مع التركيز على مقاومة المضادات الحيوية (AMR) وبيانات المرضى. باستخدام بيانات من برنامج المراقبة الأوروبية لمقاومة المضادات الحيوية للسيلان (Euro-GASP)، قام الباحثون بتحليل 1,932 عينة سيلانية من 21 دولة في المنطقة الاقتصادية الأوروبية، مقارنة النتائج مع بيانات من 2013 و2018. تم استخدام تسلسل…
-
استكشاف باسيلاس سوبتيليس: علم البيئة، التطبيقات البيوتكنولوجية، وآفاق المستقبل
2024 | المؤلف: Adenike A. Akinsemolu وآخرون | المجلة: Journal of Basic Microbiology | المجال: علم البيئة (Ecology)تسلط ورقة البحث الضوء على تطور *Bacillus subtilis* (B. subtilis) من اكتشافه الأول بواسطة كريستيان غوتفريد إيرهينبرغ إلى مكانته ككائن نموذجي محوري في علم الأحياء الدقيقة. تؤكد المراجعة على الخصائص الجينية والفيزيولوجية والبيوكيميائية المعقدة لـ B. subtilis، المعززة بتقنيات حديثة مثل CRISPR والأساليب الحاسوبية. تمتد تطبيقاته عبر التكنولوجيا الحيوية والزراعة والطب، بما في ذلك الأدوار…