الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الرابطة الهيدروجينية
-
تحسين تصميم روابط البروتين باستخدام RFdiffusion المستهدف بالتزاوج β
2026 | المؤلف: Isaac Sappington وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الأشعة والطب النووي والتصوير الطبي (Radiology, Nuclear Medicine and Imaging)تقدم البحث نهجًا جديدًا لتصميم هياكل البروتين التي ترتبط بفعالية بمواقع البروتين المستهدفة المحبة للماء، مع التركيز بشكل خاص على حواف خيوط البيتا. من خلال تكييف RFdiffusion، نجح المؤلفون في توليد تصميمات تشكل صفائح بيتا ممتدة متطابقة هندسيًا، حيث تكمل المجموعات القطبية على البروتينات المستهدفة مجموعات الروابط الهيدروجينية على الروابط المصممة. تم تطبيق هذه الطريقة…
-
استهداف المنظمات الجينية: اكتشاف حاسوبي لمثبطات طبيعية ضد إنزيم إزالة الميثيل من الهيستون KDM4C
2026 | المؤلف: Mukesh Kumar وآخرون | المجلة: PLoS ONE | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على دور KDM4C، وهو ديميثيلاز الهيستون، كمنظم إبيجينيتيكي مهم في أنواع مختلفة من السرطان، بما في ذلك سرطان الثدي، وسرطان البروستاتا، وسرطان القولون والمستقيم، وسرطان الكبد. تستخدم الدراسة نهج اكتشاف الأدوية القائم على الهيكل لتحديد مثبطات بوليفينولية طبيعية لـ KDM4C، مستفيدة من الفحص الافتراضي عالي الإنتاجية، والتوصيل الجزيئي، ومحاكاة الديناميات الجزيئية (MD)،…
-
جهاز استشعار فلوري مساعد بالرودامين ب لتقييم دكسيسيكلين هايكلايت بشكل حساس وانتقائي في مياه الصرف الصحي
2026 | المؤلف: Rashmi Jairiya وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث جهاز استشعار فلووريسنت جديد للكشف عن الدوكسيسيكلين (DOX)، مستفيدًا من رودامين B (RhB) ككاشف فلووريسنت يظهر تلاشيًا عند التفاعل مع DOX. أدت تحسينات المعلمات الرئيسية، بما في ذلك نوع العازل، تركيز RhB، تركيز الأبتامير، ومدة الحضانة، إلى ظروف مثلى باستخدام عازل Tris HCl، 4 ميكرومولار RhB، 25 نانومولار apt40، ومدة حضانة قدرها 11…
-
الثابت العازل والتوصيلية للماء المحصور
2025 | المؤلف: Bing‐Zhong Wang وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الهندسة الطبية الحيوية (Biomedical Engineering)في هذه الدراسة، استخدم المؤلفون المجهر الكهربائي الماسح (SDM) للتحقيق في الخصائص الكهربائية في المستوى للماء المحصور نانو داخل قنوات نانوية، تتميز بارتفاعات متغيرة وعرض ثابت يبلغ حوالي 200 نانومتر. يسمح الإعداد التجريبي، المفصل في قسم الطرق، بفحص سلوك الماء تحت حبس جزيئي شديد، مما يكشف عن تغييرات كبيرة في خصائصه الكهربائية مع بروز الهيكل…
-
إعادة النظر في مجال القوة FoldX، نسخة محسّنة
2025 | المؤلف: Javier Delgado وآخرون | المجلة: Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يصف المؤلفون تطوير نسخة محسنة من مجال القوة FoldX، مدفوعين بالحاجة إلى تحسين الدقة في التنبؤ بطفرات استقرار البروتين. قاموا بتجميع قاعدة بيانات شاملة، وهي مجموعة بيانات استقرار FoldX (FSD)، تتكون من 5556 طفرات، تم تحديد 2484 منها على أنها طفرات ذات ثقة عالية بناءً على هياكل الأشعة السينية غير المتكررة بدقة…
-
تحقيقات حسابية لمثبطات محتملة لبروتين الغلاف E8 لفيروس جدري القرود من خلال الربط الجزيئي ومحاكاة الديناميات الجزيئية
2024 | المؤلف: Rohit Das وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الفيروسات (Virology)تدرس الدراسة العوامل العلاجية المحتملة ضد فيروس جدري القرود (MPXV) من خلال ربط أدوية تجارية مختلفة ومركبات مشتقة من النباتات ببروتين الغلاف E8، الذي يعد أساسياً لارتباط MPXV ومرضه. تم نمذجة هيكل البروتين بناءً على بروتين D8L لفيروس اللقاح. من بين المركبات التي تم تحليلها، أظهر البونيكالاجين قدرة ربط متفوقة تبلغ -9.1 كيلو كالوري/مول مقارنةً…
-
دراسة استقرار التعليق النانوي المدعوم بالبولي فينيل الكحول للتغلب على تحدي ضعف ذوبان الأدوية باستخدام محاكاة الديناميكا الجزيئية
2024 | المؤلف: Sedigheh Abdollahi وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: العلوم الصيدلانية (Pharmaceutical Science)تخلص الأبحاث إلى أن النانو معلقات التي تستخدم بولي فينيل الكحول (PVA) كمثبت تعزز بشكل فعال من قابلية الذوبان والتوافر البيولوجي للأدوية ذات الذوبان الضعيف في الماء، وخاصة الفلروبروفين، البيزافيبريت، الميكونازول، والفينيتيون. توضح محاكاة الديناميات الجزيئية سلوك هذه النانو معلقات، مما يظهر فعالية PVA كمثبت، خاصة من خلال التفاعلات الكبيرة مع الفلروبروفين والبيزافيبريت. تسلط الدراسة…
-
تصميم تجريبي ومساعد بالتعلم الآلي لمذيبات eutectic العميقة المقبولة صيدلانيًا لتحسين ذوبانية مثبطات COX غير الانتقائية إيبوبروفين وكيتوبروفين
2024 | المؤلف: Piotr Cysewski وآخرون | المجلة: Molecules | المجال: التحفيز (Catalysis)تستكشف هذه الدراسة استخدام المذيبات اليوتيكتية العميقة (DESs) لتعزيز ذوبانية مثبطات COX الإيبوبروفين والكيبتروفين. من خلال دمج اثنين من مستقبلات روابط الهيدروجين، كلوريد الكولين والبيتاين، مع ستة مانحين لروابط الهيدروجين (الإيثيلين غليكول، الدي إيثيلين غليكول، الثلاثي إيثيلين غليكول، الغليسيرول، 1،2-بروبانديول، و1،3-بيوتانديول) بنسب مولية مختلفة، تم تحسين ما مجموعه ستة وثلاثين تركيبة DES. تشير النتائج إلى…
-
آليات تعزيز اختراق الأدوية من خلال تفاعل الجلايكول البروبيلي مع أغشية الدهون الجلدية
2024 | المؤلف: Jade Mistry وآخرون | المجلة: The Journal of Physical Chemistry B | المجال: العلوم الصيدلانية (Pharmaceutical Science)تبحث هذه الدراسة في دور بروبيلين غليكول (PG) كمعزز كيميائي للاختراق في التركيبات الموضعية، وتحديداً تأثيراته على طبقات الدهون في البشرة (SC). باستخدام محاكاة الديناميات الجزيئية (MD)، تفحص الدراسة تركيزات PG تتراوح من 0-100% w/w وتستخدم مجالات قوة جميع الذرات وذرات موحدة. تكشف النتائج أن PG يتواجد بشكل رئيسي في مناطق رأس المجموعة المحبة للماء…
-
جلد أيوني ذاتي الامتثال من خلال الاستفادة من ارتباط الروابط الهيدروجينية الهرمية
2024 | المؤلف: Huating Ye وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الهندسة الطبية الحيوية (Biomedical Engineering)في هذا القسم، يوضح المؤلفون المواد المستخدمة في أبحاثهم، مع التركيز على مجموعة متنوعة من المونومرات الأكريلات والمركبات الكيميائية الأخرى. تشمل الأكريلات أكريلات البيوتيل (BA)، أكريلات الميثيل (MA)، أكريلات الإيثيل (EA)، أكريلات الإيزوبيوتيل (iBA)، وأكريلات 2-ميثوكسي إيثيل (MEA)، جميعها مستمدة من TCI (شنغهاي) بنقاء حوالي 99%. بالإضافة إلى ذلك، تم الحصول على حمض الميثاكريليك (MAA)،…
