الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الميتاجينوميات
-
النمذجة الأيضية تكشف عن تراجع التفاعلات الأيضية المرتبطة بالشيخوخة بين المضيف والميكروبيوم في الفئران
2025 | المؤلف: Lena Best وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في التفاعل بين الشيخوخة والميكروبيوم المعوي، باستخدام الميتاجينوميات، والترانسكريبتوميات، والميتابولوميات من الفئران المسنّة جنبًا إلى جنب مع النمذجة الأيضية. تعيد الدراسة بناء نماذج أيضية متكاملة للميكروبات المضيفة والمعوية، كاشفة عن اعتماد معقد لعملية الأيض المضيف على كل من التفاعلات الميكروبية المعروفة والجديدة. من الجدير بالذكر أن الميكروبيوم المتقدم في السن يظهر انخفاضًا كبيرًا…
-
تحليل ميتاجينومي مقارن للميكروبيوم الفموي في مرضى COVID-19 والأفراد الأصحاء
2025 | المؤلف: Piyush Bhanu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تبحث الدراسة في تأثير COVID-19، الناجم عن SARS-CoV-2، على الميكروبيوم الفموي، كاشفة عن تغييرات كبيرة في التنوع والتركيبة الميكروبية بين الأفراد المصابين مقارنةً بالضوابط الصحية. أظهرت تسلسلات الميتاجينوم تقليلاً في التنوع الميكروبي، يتميز بانخفاض التنوع ألفا وملفات تنوع بيتا مميزة، إلى جانب زيادة انتشار مسببات الأمراض الانتهازية. حدد تحليل الميكروبيوم الأساسي أنواعًا فريدة قد تكون…
-
تباين مستوى السلالة بين Lactobacillus crispatus وLactobacillus iners كما تم تحديده بواسطة الميتاجينوميات المقارنة
2025 | المؤلف: Sai Ravi Chandra Nori وآخرون | المجلة: npj Biofilms and Microbiomes | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة الميكروبيوم المهبلي للنساء الحوامل في أيرلندا، مع التركيز على نظامه البيئي ذو التنوع المنخفض الذي يهيمن عليه بشكل أساسي أنواع اللاكتوباسيلس، وخاصة اللاكتوباسيلس كريسباتوس واللاكتوباسيلس إينيرس. باستخدام تسلسل الشوتغن لتحليل 354 ميتاجينوم مهبلي، تحدد الأبحاث أنواعًا فرعية مختلفة وتؤكد على أهمية التباين على مستوى السلالة في فهم آليات الاستعمار وتفاعلات المضيف والميكروب. تشمل…
-
التوافق الجيني والترابط البيئي يدفعان انتشار جينات مقاومة المضادات الحيوية
2025 | المؤلف: David Lund وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)تسلط الأبحاث الضوء على القضية الحرجة لجينات مقاومة المضادات الحيوية المتنقلة (ARGs) التي تنتشر من خلال النقل الجيني الأفقي (HGT)، مما يشكل تهديدًا كبيرًا للصحة العامة العالمية. تهدف الدراسة إلى توضيح العوامل الجينية والبيئية التي تسهل نقل ARG بنجاح، باستخدام نهج تطوري لتحليل حوالي 1 مليون جينوم بكتيري. تم تكملة هذا التحليل بأكثر من 20,000…
-
ميزات مميزة لميكروبيوم الأمعاء تميز عدوى فاسيولا هيباتيكا وتنبئ بنتائج علاج التريكلا بندازول لدى المرضى البيروفيين
2025 | المؤلف: Giljae Lee وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة العلاقة بين عدوى *Fasciola hepatica* والميكروبيوم المعوي، مع التركيز على تداعياتها على فعالية علاج التريكلا بندازول (TCBZ). باستخدام تسلسل الجينوم الميتاجينومي، قام الباحثون بتحليل عينات من 30 فردًا مصابًا و60 فردًا غير مصاب متطابقين في العمر والجنس في بيرو. تكشف النتائج أن أنواعًا ميكروبية معينة، مثل زيادة وفرة الأنواع من الأجناس *Negativibacillus*…
-
يرتبط الميكروبيوم في الكرش بتطور الكيتوزية بعد الولادة في الأبقار الحلوب: دراسة حالة-تحكم متداخلة مستقبلية
2025 | المؤلف: Fanlin Kong وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم المحاصيل والزراعة (Agronomy and Crop Science)تدرس هذه الدراسة ديناميات الميكروبيوم في الكرش في الأبقار الحلوب التي تعاني من الكيتوز، وهي حالة تؤثر على حوالي ثلث الأبقار الحلوب بعد الولادة وتؤثر على عملية التمثيل الغذائي للطاقة. باستخدام نهج متعدد الأوميات، قامت الأبحاث بتحليل 810 عينات من محتوى الكرش و789 عينة من المصل من كل من الأبقار المصابة بالكيتوز والأبقار الصحية، التي…
-
دراسة سريرية عشوائية مزدوجة التعمية حول تأثير معجون الأسنان المحتوي على سترات الزنك ثلاثي الهيدرات على بيئة ووظيفة الميكروبيوم اللويحي الفموي
2025 | المؤلف: Suzi Adams وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تدرس الدراسة تأثير معجون الأسنان المحتوي على سترات الزنك ثلاثي الهيدرات على الميكروبيوم الفموي، مع التركيز على تركيبه والتغيرات الوظيفية على مدى 6 أسابيع. قام 115 مشاركًا بتنظيف أسنانهم مرتين يوميًا باستخدام إما معجون الأسنان بالزنك أو معجون الأسنان الفلوري كتحكم. كشفت التحليلات الميتاكسونية عن تحولات كبيرة في المجتمعات البكتيرية، مع زيادات ملحوظة في الأنواع…
-
التحديات في التقاط الميكروبيوم الفطري من بيانات الميتاجينوم الشامل: نقص البرمجيات وقواعد البيانات
2025 | المؤلف: Ekaterina Avershina وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة الحالة الحالية لأدوات المعلوماتية الحيوية لتوصيف الميكروبيوم الفطري، وهو المكون الفطري للميكروبيوم المعوي، باستخدام بيانات ميتاجينومية محاكاة. قام المؤلفون بتقييم سبعة أدوات لتعيين التصنيف التسلسلي للفطريات، باستثناء أداة واحدة قديمة تتطلب تعديلات كبيرة. قاموا بإنشاء 18 مجتمعًا وهميًا بتنوع في غنى الأنواع ووفرتها، تضم ما يصل إلى 165 نوعًا من الفطريات من شُعبتي…
-
VITAP: أداة عالية الدقة لتصنيف الفيروسات DNA وRNA بناءً على بيانات ميتا-أوميكية
2025 | المؤلف: Kaiyang Zheng وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم البيئة (Ecology)تقدم هذه القسم خط أنابيب تصنيف الفيروسات (VITAP)، وهو أداة جديدة مصممة لتعزيز تصنيف تسلسلات الفيروسات من الحمض النووي والحمض النووي الريبي. يدمج VITAP طرق قائمة على المحاذاة مع نظرية الرسوم البيانية لتحقيق دقة عالية في التصنيف الضريبي، مقدماً مستويات ثقة لكل وحدة تصنيفية. يقوم بتحديث قاعدة بياناته تلقائياً بما يتماشى مع اللجنة الدولية لتصنيف…
-
الأرز المستأنس يغير الميكروبيوم في منطقة الجذور، مما يقلل من تثبيت النيتروجين ويزيد من انبعاثات أكسيد النيتروس
2025 | المؤلف: Jingjing Chang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم التربة (Soil Science)تبحث هذه الدراسة في الفروق الوظيفية في الميكروبيومات في منطقة الجذور للأرز البري والمستأنس، مع التركيز بشكل خاص على جينات دورة النيتروجين (N). باستخدام الميتاجينوميات العشوائية وPCR في الوقت الحقيقي، وجدت الدراسة أن الميكروبيومات للأرز البري تحتوي على وفرة أعلى من جينات تثبيت النيتروجين مقارنة بتلك المرتبطة بالأرز المستأنس. تشير التحقق التجريبي من خلال زراعة…