الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تحليل الخلايا المفردة
-
الالتهاب الجهازي يعيق تكوين النخاع والاستجابة لنوع الإنترفيرون الأول في البشر
2025 | المؤلف: Farid Keramati وآخرون | المجلة: Nature Immunology | المجال: علم المناعة (Immunology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث مراحل الحالات الالتهابية الجهازية، مع التركيز بشكل خاص على المرحلة الحادة المفرطة الالتهاب والمرحلة المتأخرة المثبطة للمناعة، والتي تزيد من القابلية للإصابة بالعدوى الثانوية. استخدم المؤلفون نموذجًا بشريًا محكومًا في الجسم الحي للالتهاب الجهازي الناتج عن الليببوليسكاريد (LPS) للتحقيق في هذه المراحل. من خلال تسلسل RNA أحادي الخلية، حددوا…
-
خرائط البروتيوميات البصرية العميقة لتحديد السمية البروتينية في مرض الكبد الوراثي
2025 | المؤلف: Florian A. Rosenberger وآخرون | المجلة: Nature | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)يتناول قسم ورقة البحث التحديات التي تطرحها أمراض طي البروتين غير الصحيح، وخاصة نقص α1-أنتي تريبسين (AATD)، ويقدم نهجًا جديدًا باستخدام البروتيوميات المكانية مع التعلم الآلي للتحقيق في هذه الحالات في أنسجة الكبد البشرية. من خلال استخدام البروتيوميات البصرية العميقة (DVP) جنبًا إلى جنب مع تحليل الخلايا الفردية، نجح البحث في رسم خرائط الأحداث الجزيئية…
-
إعادة تعريف الجينات المتغيرة العالية بواسطة انحدار LOESS المحسن مع نسبة إيجابية
2025 | المؤلف: Yue Xie وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يناقش المؤلفون التحديات التي تطرحها الأبعاد العالية والندرة في بيانات تسلسل RNA أحادي الخلية، مع التأكيد على أهمية اختيار الميزات لتقليل الأبعاد وتحسين القابلية للتفسير. يقدمون خوارزمية جديدة لاختيار الميزات تستخدم الانحدار السلس المحلي المقدر المحسن (LOESS) لنمذجة العلاقة بين مستويات التعبير الجيني المتوسطة والنسب الإيجابية بشكل فعال، مع تقليل خطر الإفراط…
-
تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة يكشف عن اختلافات جنسية في التركيب تحت الخلوي ونشاط شبكة تنظيم الجينات المرتبطة باللويحات السباتية البشرية
2025 | المؤلف: Katyayani Sukhavasi وآخرون | المجلة: Nature Cardiovascular Research | المجال: علم المناعة (Immunology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث النتائج المستخلصة من دراسة تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة لـ 7,690 خلية من لويحات الشريان السباتي البشري، كاشفًا عن اختلافات ملحوظة بين الجنسين في التركيب تحت الخلوي ونشاط شبكة تنظيم الجينات (GRN) المرتبطة بتضيق الشريان السباتي. بينما لم تختلف الأنواع الرئيسية من الخلايا، بما في ذلك خلايا العضلات…
-
تصفية الخلايا ذات المحتوى الميتوكوندري العالي تستنفد تجمعات الخلايا الخبيثة المتغيرة الأيضية القابلة للحياة في دراسات الخلايا المفردة للسرطان
2025 | المؤلف: Josephine Yates وآخرون | المجلة: Genome biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث ورقة البحث في تداعيات ممارسات التصفية في تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq) للخلايا الخبيثة، مع التركيز بشكل خاص على نسبة عدد RNA الميتوكوندريا (pctMT). قد تستبعد عتبات التصفية التقليدية، التي تم تحديدها من دراسات على الأنسجة الصحية، عن غير قصد الخلايا الخبيثة التي تظهر نسبة أعلى من pctMT الأساسية بسبب خصائصها البيولوجية الفطرية. من…
-
تحليلات النسخ الجيني أحادي الخلية والمكانية تكشف عن إعادة تشكيل بيئة الورم بعد العلاج الكيميائي المناعي المساعد في سرطان الرئة غير صغير الخلايا
2025 | المؤلف: Xiaolu Cui وآخرون | المجلة: Molecular Cancer | المجال: علم الأورام (Oncology)تدرس الدراسة آثار العلاج الكيميائي المناعي المساعد على سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC)، وهو الشكل الأكثر شيوعًا من سرطان الرئة، من خلال تحليل عينات الأنسجة من 12 مريضًا. باستخدام تسلسل RNA أحادي الخلية وتسلسل النسخ الجيني المكاني، تحدد الأبحاث المكونات الخلوية الرئيسية وأنماط الاتصال داخل بيئة الورم الدقيقة التي قد تؤثر على حساسية العلاج.…
-
scAMZI: مشفر تلقائي عميق قائم على الانتباه مع طبقة مضخمة للصفر لتجميع بيانات scRNA-seq
2025 | المؤلف: Lin Yuan وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث نموذج تعلم عميق جديد، scAMZI، مصمم لتجميع بيانات تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq). يدمج هذا النموذج وحدة انتباه بسيطة (SimAM)، ومشفّر تلقائي، ونموذج سالب ثنائي متضخم بالصفر (ZINB)، بالإضافة إلى طبقة متضخمة بالصفر (ZI) للتعامل بفعالية مع التحديات المرتبطة ببيانات scRNA-seq، مثل أحداث التسرب والحاجة إلى دمج مرن للميزات الخلوية والعلاقات بين الخلايا.…
-
تحليل الخلايا الفردية للبطانة الرحمية البشرية في متلازمة المبيض المتعدد الكيسات
2025 | المؤلف: G. Eriksson وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم المناعة (Immunology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث تأثير متلازمة المبيض المتعدد الكيسات (PCOS) على قابلية بطانة الرحم واستعدادات المخاطر المرتبطة، بما في ذلك الإجهاض وسرطان بطانة الرحم. تقدم الدراسة أطلسًا خلويًا مفصلًا لبطانة الرحم خلال المرحلة التكاثرية لدى النساء المصابات بمتلازمة المبيض المتعدد الكيسات، والتي تتميز بالسمنة، وزيادة الأندروجينات، ومقاومة الأنسولين، مقارنةً بمجموعة ضابطة متطابقة في…
-
تكامل الميتابولوميات على مستوى الخلية الواحدة والتوصيف الظاهري يكشف عن تباين استقلابي في الأكسدة الخلوية والشيخوخة
2025 | المؤلف: Ziyi Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على الفهم الناشئ للتنوع في التغيرات الظاهرية والنسخية على مستوى الخلية الواحدة استجابةً للإجهاد التأكسدي والشيخوخة. على الرغم من الأهمية المعترف بها لعملية الأيض الخلوي، إلا أن هناك نقصًا في الاستكشاف الشامل لتنوع الميتابولوم وعلاقته بالحالات التأكسدية والشيخوخة. يقدم المؤلفون تقنية جديدة، وهي التصوير الحي للخلية الواحدة مع مطياف الكتلة (SCLIMS)، والتي…
-
تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة وعلم النسخ المكاني يكشفان عن التباين والتواصل بين الخلايا للألياف المرتبطة بالسرطان في سرطان المعدة
2025 | المؤلف: Xijie Zhang وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستكشف هذه الدراسة تباين الألياف المرتبطة بالسرطان (CAFs) داخل البيئة الدقيقة للورم (TME) في سرطان المعدة، مع التركيز على أدوارها في تقدم الورم والتواصل بين الخلايا مع الخلايا الظهارية الخبيثة (ECs). باستخدام بيانات تسلسل الخلايا الفردية من 24 عينة سرطان معدة، حدد الباحثون تسع فئات خلوية متميزة وستة تحت مجموعات من الألياف: الألياف الالتهابية (iCAFs)،…