تخطى إلى المحتوى
العالِم العربي
  • الصفحة الرئيسية
  • مجالات الأبحاث
  • أحدث الأبحاث
  • عن الموقع
  • تواصل معنا
  1. الرئيسية
  2. قائمة الكلمات المفتاحية
  3. تكوين البروتين

الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تكوين البروتين




  • استكشاف حالات الانتقال لتغيرات الشكل البروتيني عبر الكشف عن التوزيع الخارجي في الفضاء الكامن الكروي

    2025 | المؤلف: Bojun Liu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)

    إن تحديد الحالات الانتقالية أمر أساسي لفهم التغيرات الشكلية للبروتينات التي تعتبر محورية في عمليات بيولوجية متنوعة. نماذج حالة ماركوف (MSMs)، المستمدة من محاكاة الديناميات الجزيئية (MD)، تلتقط هذه الديناميات بفعالية من خلال تحديد الانتقالات بين الحالات الشكلية شبه المستقرة. ومع ذلك، تواجه MSMs صعوبة في تحديد حالات الانتقال، حيث تصنف أشكال MD إلى حالات…


  • DPFunc: التنبؤ بدقة بوظيفة البروتين عبر التعلم العميق مع معلومات الهيكل الموجهة بالمجال

    2025 | المؤلف: Wenkang Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

    يقدم هذا القسم نظرة عامة على نهج جديد قائم على التعلم العميق، DPFunc، مصمم لتوقع وظائف البروتينات مع معالجة قضايا القابلية للتفسير الموجودة في الطرق الحسابية الحالية. تكمن أهمية التنبؤ بدقة بوظائف البروتينات في إمكانيته لتعزيز فهمنا للآليات البيولوجية والمساعدة في علاج الأمراض المعقدة. يستفيد DPFunc من معلومات الهيكل الموجهة من المجال لتحديد المناطق الحرجة…


  • BFVD – مستودع كبير لهياكل البروتينات الفيروسية المتوقعة

    2024 | المؤلف: Rachel Seongeun Kim وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم البيئة (Ecology)

    قاعدة بيانات هيكل البروتين AlphaFold (AFDB) هي مستودع شامل لهياكل البروتين المتوقعة، لكنها تفتقر إلى تغطية التسلسلات الفيروسية، مما يحد من البحث في علم الفيروسات. لسد هذه الفجوة، طور الباحثون قاعدة بيانات الفيروسات الكبيرة الرائعة (BFVD)، التي تحتوي على 351,242 هيكل بروتين تم التنبؤ به باستخدام ColabFold على ممثلي التسلسلات الفيروسية من مجموعات UniRef30. من…


  • نموذج خشن لبروتينات غير مرتبة ومتعددة المجالات

    2024 | المؤلف: Fan Cao وآخرون | المجلة: Protein Science | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

    في هذا القسم، يناقش المؤلفون التحديات المرتبطة بتوصيف التجمعات الشكلية للبروتينات متعددة المجالات بسبب تعقيدها وديناميكياتها. يقدمون نموذجًا خشنًا يعزز من كفاءة ودقة محاكاة هذه البروتينات في المحلول. تسلط الدراسة الضوء على أهمية موضع مواقع التفاعل داخل المجالات المطوية، كاشفة أن وضع هذه المواقع في مواقع ذرات Cα يؤدي إلى تفاعلات مفرطة بين المجالات. بالمقابل،…


  • توقعات AlphaFold للأشكال المتغيرة مدفوعة بتذكر الهيكل

    2024 | المؤلف: Devlina Chakravarty وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

    تبحث الدراسة في القدرات التنبؤية لـ AlphaFold (AF)، وخاصة في سياق بروتينات تغيير الطي، التي يمكن أن تتبنى أشكال هيكلية متعددة. تكشف الدراسة أن AF هو متنبئ ضعيف لتغيير الطي، حيث حقق معدل نجاح يبلغ 35% فقط للبروتينات التي من المحتمل أن تكون مدرجة في مجموعات التدريب الخاصة به. ومن الجدير بالذكر أن نجاحات النموذج…


  • هيكل الناقل البشري للدوبامين في تعقيد مع الكوكايين

    2024 | المؤلف: Jeppe C. Nielsen وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)

    يلعب ناقل الدوبامين (DAT) دورًا حيويًا في تنظيم إشارات الدوبامين ويعتبر هدفًا رئيسيًا للخصائص الإدمانية للكوكايين. كعضو في عائلة ناقلات النواقل العصبية: ناقل الصوديوم، يستخدم DAT تدرج أيون الصوديوم (Na\(^+\)) لنقل الدوبامين ضد تدرجه الكيميائي. يتم التحكم في آلية النقل بواسطة أبواب داخلية وخارجية تنظم وصول الركيزة إلى موقع الربط المركزي. على الرغم من أهميته،…


  • آلية النقل ثنائية الجزيئات لناقل فيتامين C البشري SVCT1

    2024 | المؤلف: Takaaki A. Kobayashi وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)

    قسم “طرق” يوضح الأساليب التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يتناول تصميم التجارب، بما في ذلك اختيار المواد، إعداد العينات، والبروتوكولات المحددة المتبعة لضمان إمكانية التكرار. كما يتم وصف الأساليب الإحصائية المستخدمة في تحليل البيانات، مع تسليط الضوء على التقنيات المستخدمة لتقييم الأهمية والمعايير المستخدمة في تفسير النتائج. بالإضافة إلى ذلك، قد يتضمن القسم معلومات حول…


  • بروتين C-reactive: التركيب، الوظيفة، التنظيم، والدور في الأمراض السريرية

    2024 | المؤلف: Haihong Zhou وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: علم المناعة (Immunology)

    بروتين C-reactive (CRP) هو بروتين بلازما محفوظ بشكل كبير ضمن عائلة البنتراكسين، ويُعرف بهيكله الخماسي وارتباطه بالعوامل المعتمدة على الكالسيوم، وخاصة الفوسفو كولين (PC). يعمل كأحد البروتينات الرئيسية في المرحلة الحادة، حيث ترتفع تركيزاته في البلازما بشكل كبير خلال الاستجابات الالتهابية، مما يجعله علامة سريرية قيمة لتقييم شدة الالتهاب. بينما يمكن أن يظهر CRP البشري…


  • الأساس الهيكلي لتعديل TRPV1 بواسطة الدهون الحيوية الذاتية

    2024 | المؤلف: William R. Arnold وآخرون | المجلة: Nature Structural & Molecular Biology | المجال: الأنظمة الحسية (Sensory Systems)

    تشير هذه الفقرة إلى أن الآلية الأساسية التي تؤثر على الظاهرة المرصودة هي طرد الدهون الفوسفورية (PI) ، بدلاً من تقلبات درجة الحرارة. تشير هذه النتيجة إلى أن ديناميات طرد الدهون تلعب دورًا حاسمًا في العملية قيد التحقيق، مما يبرز أهمية تركيبة الدهون في الوظائف الخلوية أو المتعلقة بالغشاء. قد يوفر الاستكشاف الإضافي لهذه الآلية…


  • RING 4.0: شبكات تفاعل بقايا أسرع مع أنواع تفاعل جديدة عبر أكثر من 35,000 هيكل كيميائي مختلف

    2024 | المؤلف: Alessio Del Conte وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

    يتناول القسم التقدم في إطار شبكة تفاعل البقايا (RIN)، مع التركيز بشكل خاص على إصدار RING 4.0، وهو خادم ويب مصمم لتحليل التفاعلات غير التساهمية والتساهمية في هياكل البروتين. يقدم RING 4.0 تحسينات كبيرة، بما في ذلك تحديد سبعة أنواع من التفاعلات، مثل الروابط الهيدروجينية π، وروابط الهالوجين، ومواقع تنسيق أيونات المعادن. يستخدم البرنامج الآن…


←السابق
1 2 3 4 5
التالي→

حقوق النشر © 2026 العالِم العربي. جميع الحقوق محفوظة. موقع العالِم العربي غير مسؤول عن محتوى المواقع الخارجية.