الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تكوين الحمض النووي
-
مكثفات RNA الاصطناعية القابلة للبرمجة في خلايا الثدييات
2026 | المؤلف: Shiyi Li وآخرون | المجلة: Nature Nanotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، نقدم نهجًا جديدًا وقابلًا للبرمجة لإنشاء تكثفات RNA داخل خلايا الثدييات الحية باستخدام RNAs أحادية السلسلة قصيرة (ssRNAs) التي تشكل هياكل على شكل نجوم. من خلال استغلال التقدم في تكنولوجيا النانو للـ DNA وRNA، نوضح أن التفاعلات المحددة بالتسلسل لـ RNA يمكن أن تدفع تشكيل هذه التكثفات، مما يسمح بالتحكم الدقيق في…
-
مقارنة بين التقنيات العصبية والتقليدية لهياكل السوليتون والسلوك الديناميكي في نموذج الحمض النووي مزدوج السلسلة
2026 | المؤلف: Sheikh Zain Majid وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الفيزياء الإحصائية وغير الخطية (Statistical and Nonlinear Physics)تستكشف هذه الدراسة الديناميات غير الخطية لموجات نموذج الحمض النووي مزدوج السلسلة، مع التركيز على التفاعلات بين سلسلتين نوكليوتيديتين متكاملتين. باستخدام طريقة رسم المعادلة العامة لريكاتي (GRM) وطريقة الشبكة العصبية المعدلة لرسم المعادلة العامة لريكاتي (GREMM)، يستنتج المؤلفون مجموعة متنوعة من الحلول الدقيقة، بما في ذلك الموجات الزائفة، الموجات المثلثية، الموجات الكسرية، والموجات الهجينة. يوسع…
-
التواء الحمض النووي DNA عند تركيزات عالية من أيونات القلوي: دليل ضد شكل C من الحمض النووي DNA في المحلول
2026 | المؤلف: Koen R Storm وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في تأثيرات تركيزات الملح العالية على التواء الحمض النووي، وهي خاصية أساسية تتأثر بالبيئة الأيونية. باستخدام ملاقط مغناطيسية لجزيئات فردية، قاموا بقياس التواء الحمض النووي في محاليل LiCl و NaCl و KCl و CsCl، وكشفوا أن التواء الحمض النووي يزيد في البداية تقريبًا كما هو $\sim [\text{salt}]^{1/2}$ ولكنه يستقر بل…
-
DRfold2 هو أداة تعتمد على التعلم العميق تمكن من التنبؤ بكفاءة ودقة بهيكل RNA
2026 | المؤلف: Yang Li وآخرون | المجلة: PLoS Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث DRfold2، وهو إطار عمل جديد للتعلم العميق مصمم لتوقع بنية RNA من بيانات التسلسل. يدمج هذا الإطار نموذج لغة مركب RNA مدرب مسبقًا (RCLM) مع وحدة هيكلية لإزالة الضوضاء، مما يمكّن من التوقعات من البداية إلى النهاية. يتفوق DRfold2 بشكل كبير على الطرق الحالية الرائدة في كل من التوبولوجيا العالمية وتوقعات البنية الثانوية…
-
رؤى آلية حول فك الارتباط المدفوع بواسطة PCBP1 لحمض DNA i-motif المختار عند نقطة التفتيش G1/S
2026 | المؤلف: Pallabi Sengupta وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث دور بروتين ربط بولي(rC) 1 (PCBP1) في تنظيم الأشكال i، وهي هياكل DNA رباعية الخيوط توجد في مناطق غنية بالسيتوزين من الجينوم. تحدد الدراسة PCBP1 كبروتين ربط انتقائي للأشكال i يمكنه فك الأشكال i المحددة بناءً على حالات بروتوناتها وقدرات تشكيل الشعر. من خلال تجارب تقصير منهجية، وُجد أن…
-
حل سلامة الهيكل لطي DNA والدوائية في الجسم الحي
2026 | المؤلف: Yang Wang وآخرون | المجلة: Nature Nanotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم الدراسة اختبار الربط القريب لتتبع الهيكل وقياس السلامة (PLASTIQ)، وهو طريقة جديدة لتقييم السلامة الهيكلية لأوريغامي الحمض النووي في الجسم الحي باستخدام 1 ميكرولتر فقط من الدم، مما يحقق حد كشف قدره 0.01 فمتومول. يتيح PLASTIQ مراقبة وقياس ديناميات تحلل أوريغامي الحمض النووي أثناء الدورة الدموية، مع تقييم تأثير PEGylation على هذه العملية في…
-
فك تشفير مجموعات البنية الهيكلية للـ RNA: استكشاف المناظر الطاقية للـ TAR Stemloop
2026 | المؤلف: Konstantin Röder | المجلة: Journal of Chemical Theory and Computation | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التحديات والتقدم في دراسة مجموعات RNA الهيكلية، والتي تعتبر ضرورية لفهم الآليات الخلوية وتطوير التدخلات العلاجية. يبرز المؤلفون الصعوبات الكامنة بسبب تعدد أشكال RNA الهيكلية وطبيعته الديناميكية، مما يتطلب مزيجًا من الطرق الحاسوبية والتجريبية. يقدمون نهجًا جديدًا باستخدام استكشافات المناظر الطاقية عبر أخذ عينات من المسارات المنفصلة، مما يوضح…
-
تحليل المناطق التي تشكل حلقة R يحدد RNU2-2 و RNU5B-1 كجينات اضطرابات النمو العصبي
2025 | المؤلف: Adam Jackson وآخرون | المجلة: Nature Genetics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث هذه القسم من ورقة البحث في دور حلقات R – هياكل هجين من الحمض النووي والحمض النووي الريبي – في الاضطرابات المندلية البشرية، مع التركيز بشكل خاص على قدرتها على تعزيز الطفرات. يحدد المؤلفون وجود فائض من المتغيرات الجديدة في المناطق الجينومية التي تشكل حلقات R، والتي تُسمى “مناطق حلقات R”، ويجدون أن هذه…
-
RNAmigos2: الفحص الافتراضي المعتمد على الهيكل المتسارع للـ RNA باستخدام التعلم العميق للرسوم البيانية
2025 | المؤلف: Juan G. Carvajal-Patiño وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “طرق” في ورقة البحث يوضح تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من المشاركين. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، واستطلاعات، ودراسات رصدية، مما يضمن تقييمًا شاملاً للمتغيرات ذات الاهتمام. تم تحليل البيانات باستخدام برامج إحصائية مناسبة، مع تحديد مستويات الدلالة…
-
الترميز الجيني والتعبير عن الهيكليات السيتوسكلية من RNA الأورغامي في الخلايا الاصطناعية
2025 | المؤلف: Mai P. Tran وآخرون | المجلة: Nature Nanotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يقدم المؤلفون إطارًا مفاهيميًا لبناء خلايا اصطناعية باستخدام طي RNA داخل حويصلات دهنية. على عكس طي DNA، يسمح الترميز الجيني لـ RNA لهذه الخلايا الاصطناعية بإنتاج وحداتها البنائية بشكل مستقل من خلال عمليات نشطة وغير متوازنة. يختلف هذا النهج عن الطرق التقليدية التي تقتصر فقط على احتواء هياكل DNA. إن دمج الوظائف،…