الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ديناميات الجزيئات
-
عزل وتوصيف وتقييم بيولوجي للفطريات الداخلية من نبات البردي: رؤى تجريبية وحاسوبية
2026 | المؤلف: Dina M. Eskander وآخرون | المجلة: Frontiers in Molecular Biosciences | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تبحث هذه الدراسة في المستقلبات الحيوية النشطة المستمدة من الفطر الداخلي Aspergillus sp. (HAG1)، المعزول من Phragmites australis. باستخدام طرق التعريف المورفولوجي والجزيئي، نجحت الدراسة في عزل ثلاثة مستقلبات: حمض الفاكانك (C1)، بيبيريسين (C2)، وغواياكيلغليسرول (C3)، حيث تم الإبلاغ عن C3 لأول مرة كمركب مستمد من الفطر الداخلي من هذا النوع النباتي. أظهرت جميع المستقلبات…
-
تدهور الموصلية الحرارية الناتج عن الإشعاع في LiAlO2 و LiAl5O8 المدروس بواسطة الديناميات الجزيئية
2026 | المؤلف: Ankit Roy وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: كيمياء المواد (Materials Chemistry)تبحث هذه الدراسة في تأثيرات العيوب النقطية الناتجة عن الإشعاع على خصائص النقل الحراري لمواد السيراميك الليثيوم، تحديدًا LiAlO₂ و LiAl₅O₈، والتي لها صلة بالتطبيقات في البيئات النووية مثل قضبان الامتصاص القابلة للاحتراق المنتجة للتريتيوم (TPBARs). تشير النتائج إلى أن LiAlO₂ يعاني من انخفاض كبير في الموصلية الحرارية، مع انخفاض يصل إلى 75% مع زيادة…
-
التوصيف الكيميائي للمركبات المستخلصة من أنونا موريكاتا المستهدفة لـ COX-2 في سرطان الثدي
2026 | المؤلف: Vitalis Mbayo وآخرون | المجلة: Discover Chemistry. | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تتناول ورقة البحث القضية الملحة لسرطان الثدي (BC)، الذي لا يزال أكثر الأورام الخبيثة تشخيصًا على مستوى العالم، مما يساهم بشكل كبير في الاعتلال والوفيات. تحدد الدراسة Annona muricata كمصدر واعد لمركبات البوليفينول ذات الألفة الحسابية القوية لـ COX-2، وهو وسيط حاسم في تقدم سرطان الثدي. باستخدام سير عمل متكامل يشمل الفحص الافتراضي عالي الإنتاجية،…
-
أكسدة الهيدروجين على أقطاب Pt(111) المغطاة بالجرافين
2026 | المؤلف: Katinka Boterman وآخرون | المجلة: Electrochimica Acta | المجال: الطاقة المتجددة والاستدامة والبيئة (Renewable Energy, Sustainability and the Environment)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في دور الطلاءات الجرافينية على النشاط الكهروكيميائي والاستقرار لتفاعل أكسدة الهيدروجين (HOR) على أسطح Pt(111). قاموا بتغيير كثافة العيوب في طبقة الجرافين بشكل منهجي، مستخدمين مطيافية الامتزاز الكهروكيميائية لقياس مقاومة نفاذ البروتون. تكشف النتائج أن نشاط HOR الكبير يتحقق فقط بعد كثافة عيوب حرجة، مما يشير إلى أن الهياكل العيبية…
-
فك تشفير مجموعات البنية الهيكلية للـ RNA: استكشاف المناظر الطاقية للـ TAR Stemloop
2026 | المؤلف: Konstantin Röder | المجلة: Journal of Chemical Theory and Computation | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التحديات والتقدم في دراسة مجموعات RNA الهيكلية، والتي تعتبر ضرورية لفهم الآليات الخلوية وتطوير التدخلات العلاجية. يبرز المؤلفون الصعوبات الكامنة بسبب تعدد أشكال RNA الهيكلية وطبيعته الديناميكية، مما يتطلب مزيجًا من الطرق الحاسوبية والتجريبية. يقدمون نهجًا جديدًا باستخدام استكشافات المناظر الطاقية عبر أخذ عينات من المسارات المنفصلة، مما يوضح…
-
رؤى نظرية حول التفاعلية، والخصائص الطوبولوجية، وتفاعل كيناز OSR1 للأدوية المضادة لارتفاع ضغط الدم: دراسة قائمة على DFT والتثبيت
2026 | المؤلف: Niranjana Devi Rajendran وآخرون | المجلة: Discover Chemistry. | المجال: الكيمياء الفيزيائية والنظرية (Physical and Theoretical Chemistry)تبحث هذه الدراسة في الخصائص الهيكلية والإلكترونية لدوائين مضادين لارتفاع ضغط الدم، هيدروكلوروثيازيد (HCTZ) وهيدروفلوميثيازيد (HFTZ)، باستخدام نظرية الكثافة الوظيفية (DFT) مع الوظيفة الهجينة B3LYP-D3(BJ)/6-311++ G(d,p). تستخدم الدراسة تحليل سطح هيرشفيلد ومخططات بصمة الأصابع لتحديد التفاعلات بين الجزيئات، بينما توضح وظيفة تحديد موضع الإلكترون (ELF) هياكل القشرة الذرية والأزواج الوحيدة، خاصة حول المراكز السالبة الشحنة.…
-
إنشاء أدوية الأورام المعتمدة من إدارة الغذاء والدواء كمثبط لـ GPR176 من خلال نمذجة التماثل، والربط الجزيئي، وMMGBSA، وDFT، ومحاكاة الديناميكا الجزيئية
2026 | المؤلف: Felix Oluwasegun Ishabiyi وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)بروتين GPR176، وهو بروتين غشائي خلوي مرتبط بمختلف الأمراض البشرية، وخاصة السرطانات، تم تحديده كعامل مهم في تكوين الأورام بسبب زيادة تعبيره. تبحث هذه الدراسة في إمكانية إعادة استخدام الأدوية المعتمدة من إدارة الغذاء والدواء الأمريكية كمثبطات لـ GPR176، مستفيدة من أدوات المعلوماتية الحيوية الهيكلية لتقييم فعاليتها. من خلال نمذجة التشابه لتحديد الهيكل ثلاثي الأبعاد…
-
اكتشاف مثبطات صغيرة قائمة على الثياديازول لتفاعل سبايك SARS-CoV-2-ACE2 من خلال التنبؤ الحاسوبي المتكامل والتحقق التجريبي
2026 | المؤلف: Zakkia Gul وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الأمراض المعدية (Infectious Diseases)في هذه الدراسة، تم تحديد خمسة جزيئات صغيرة مشتقة من هياكل 1،3،4-ثياديازول كمثبطات محتملة لتفاعل بروتين السنبلة SARS-CoV-2 مع مستقبل ACE2 البشري، وهي خطوة حاسمة لدخول الفيروس. كشفت الفحص الافتراضي القائم على الهيكل والتحقق التجريبي أن جميع المركبات ترتبط داخل مجال ارتباط المستقبل لبروتين السنبلة، مما يعطل فعليًا ارتباط ACE2. أظهرت محاكاة الديناميات الجزيئية ارتباطًا…
-
ToPolyAgent: وكلاء الذكاء الاصطناعي لمحاكاة البوليمرات الطوبولوجية ذات الحبيبات الكبيرة
2026 | المؤلف: Lijie Ding وآخرون | المجلة: Digital Discovery | المجال: الهندسة الميكانيكية (Mechanical Engineering)تقدم البحث ToPolyAgent، وهو إطار عمل ذكاء اصطناعي متعدد الوكلاء مصمم لمحاكاة الديناميات الجزيئية ذات الحبيبات الخشنة (MD) للبوليمرات الطوبولوجية باستخدام تعليمات اللغة الطبيعية. من خلال دمج نماذج اللغة الكبيرة (LLMs) مع أدوات حسابية متخصصة، يسهل ToPolyAgent سير العمل التفاعلي والذاتي لمحاكاة هياكل البوليمر المختلفة، بما في ذلك البوليمرات الخطية، والحلقية، والفرشاة، والنجمة، والديندرايمرات. يتكون…
-
التسلسل الناشئ في الحالات المحلية لسلاسل الكوانتم العضوية
2026 | المؤلف: L. L. Lage وآخرون | المجلة: Nanoscale | المجال: الكيمياء الفيزيائية والنظرية (Physical and Theoretical Chemistry)تبحث الدراسة في الخصائص الإلكترونية وخصائص النقل لسلاسل الكم العضوية (OQCs)، وهي فئة جديدة من الهياكل النانوية القائمة على الكربون تتميز بهيكلها شبه أحادي البعد. باستخدام ديناميات الجزيئات والاسترخاء ونظرية الوظائف الكثافة (DFT)، تؤسس الدراسة الاستقرار الهيكلي لهذه السلاسل. نموذج الربط الضيق مع معلمة قفز تتناقص بشكل أسي يلتقط بدقة الخصائص الإلكترونية، كاشفًا عن فجوة…