الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ديناميات الجزيئات
-
إمكانيات بين الذرات الطاردة المحسوبة على ثلاثة مستويات من النظرية
2025 | المؤلف: K. Nordlund وآخرون | المجلة: Physical review. A/Physical review, A | المجال: الجيوفيزياء (Geophysics)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في الإمكانيات بين الذرات الطاردة التي تعتبر حاسمة لفهم قوة التوقف النووي وتشتت الذرات خلال أحداث الإشعاع keV و MeV. يستخدمون نموذج Ziegler-Biersack-Littmark (ZBL) ضمن نظرية الكثافة الوظيفية بدون مدارات (OF-DFT) ويقارنون توقعاته مع طرق الكيمياء الكمومية الأكثر تقدمًا، وتحديدًا نظرية الاضطراب من الدرجة الثانية لمولر-بليست (MP2) ونظرية الكثافة الوظيفية…
-
محاكاة الديناميات الجزيئية للبروتين-الليغاند (PL-MDS)، وتحليلات ADMET، ودراسات النشاط الحيوي للمواد الكيميائية النباتية من الألوة فيرا: جهد اكتشاف أدوية جديدة مضادة للسكري باستخدام الحاسوب
2025 | المؤلف: Babatunde Temitope Ogunyemi وآخرون | المجلة: Discover Chemistry. | المجال: علوم النبات (Plant Science)تتناول الأبحاث القضية الصحية العالمية الملحة لمرض السكري، مع تسليط الضوء على الزيادة المتزايدة في الانتشار والقيود المفروضة على العلاجات الحالية. لتحديد عوامل مضادة للسكري جديدة، تستخدم الدراسة نهج تصميم الأدوية المعتمد على الكمبيوتر (CADD)، وتحديداً ربط الجزيئات، لتقييم القدرة المثبطة لـ 103 مركب نباتي معزول من الألوة فيرا ضد مستقبل الألفا-أميلاز (PDB ID: 3BAJ).…
-
الديناميات الجزيئية المدفوعة بالتعلم الآلي تكشف عن تحول الطور الكتلي الذي يقود تخليق الأمونيا على هيدريد الباريوم
2025 | المؤلف: Axel Tosello Gardini وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: كيمياء المواد (Materials Chemistry)يقدم هذا القسم تحولًا في فهم التحفيز الصناعي غير المتجانس، حيث ينتقل من نموذج ثابت إلى نموذج يركز على الطبيعة الديناميكية للعوامل المحفزة. باستخدام محاكاة الديناميات الجزيئية المدفوعة بالتعلم الآلي، يبحث المؤلفون في عملية تخليق الأمونيا التي يحفزها هيدريد الباريوم (BaH₂). تشير نتائجهم إلى أن BaH₂ يعمل كعامل محفز فعال فقط عندما يتعرض لعملية حلقة…
-
استكشاف في السيليكو لمشتقات الزانثون الطبيعية كمثبطات محتملة لتكاثر فيروس كورونا المسبب لمتلازمة التنفس الحاد الشديد 2 (SARS-CoV-2) ودخول الخلايا
2025 | المؤلف: Vincent A. Obakachi وآخرون | المجلة: Journal of Computer-Aided Molecular Design | المجال: علم السموم (Toxicology)لقد أبرزت جائحة COVID-19 ضرورة وجود علاجات مضادة للفيروسات فعالة، خاصة ضد المتغيرات المقاومة للقاحات الناشئة. تستكشف هذه الدراسة مشتقات الزانثون الطبيعية كعوامل مثبطة محتملة لمستقبل ACE2، الذي يسهل دخول SARS-CoV-2 إلى خلايا الإنسان. حدد تحليل حسابي لـ 91 مركب زانثون من *Swertia chirayita* مرشحين، XAN71 و XAN72، اللذان أظهرا تقارب ارتباط متفوق يبلغ -70.97…
-
الديناميات الجزيئية المعدلة والديناميكا الحرارية في ثقب دودي قابل للعبور في جاذبية النحل
2025 | المؤلف: A. A. Araújo Filho وآخرون | المجلة: The European Physical Journal C | المجال: الفيزياء الإحصائية وغير الخطية (Statistical and Nonlinear Physics)في هذه الدراسة، نحقق في آثار حقل الجاذبية ضمن حل جاذبية النحلة الطنانة، مع التركيز على ثقب دودي قابل للعبور وتأثيراته على أوضاع الجسيمات عديمة الكتلة. تشمل النتائج الرئيسية حساب معامل الانكسار $n(r)$، سرعة المجموعة $v_g$، تأخير الزمن $t(d)$، المسافات المعدلة $D_{\text{modified}}$، والجهد بين الجسيمات $V(r)$. من الجدير بالذكر أن هندسة الثقب الدودي تسهل تفاعلات…
-
رؤى على المستوى الجزيئي حول الطبقة الكهربائية المزدوجة عند واجهات أكسيد-إلكتروليت
2024 | المؤلف: Chunyi Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء الكهربية (Electrochemistry)قسم “الطرق” يوضح الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يتناول اختيار المشاركين، وتصميم التجارب، والتقنيات المحددة المستخدمة لجمع البيانات وتحليلها. استخدم الباحثون مزيجًا من الطرق الكمية والنوعية لضمان فهم شامل للظواهر قيد التحقيق. تم إجراء التحليلات الإحصائية باستخدام برامج مناسبة، مع تحديد مستويات الدلالة عند p < 0.05. استخدمت الدراسة نماذج رياضية متنوعة لتفسير البيانات،…
-
اكتساب تزييت جزيئي متداول من خلال الالتفاف الذاتي لورقة الجرافيت النانوية عند درجات حرارة منخفضة
2024 | المؤلف: P. Y. Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الفيزياء الذرية والجزيئية والبصريات (Atomic and Molecular Physics, and Optics)في هذه الدراسة، تم إنتاج عينات من الجرافيت باستخدام هدف جرافيت (رمز المنتج: 1.1 C.4 N.017، رقم المنتج: 16-1506) تم الحصول عليه من شركة دونغقوان أولاي لاستهداف الطلاء المحدودة. شملت التحضيرات الضغط البارد لمسحوق الجرافيت عالي النقاء (99.99%). بالإضافة إلى ذلك، تم الحصول على عينات من الجرافيت البيروليتي من معهد أبحاث المعادن في الأكاديمية الصينية…
-
آليات تعزيز اختراق الأدوية من خلال تفاعل الجلايكول البروبيلي مع أغشية الدهون الجلدية
2024 | المؤلف: Jade Mistry وآخرون | المجلة: The Journal of Physical Chemistry B | المجال: العلوم الصيدلانية (Pharmaceutical Science)تبحث هذه الدراسة في دور بروبيلين غليكول (PG) كمعزز كيميائي للاختراق في التركيبات الموضعية، وتحديداً تأثيراته على طبقات الدهون في البشرة (SC). باستخدام محاكاة الديناميات الجزيئية (MD)، تفحص الدراسة تركيزات PG تتراوح من 0-100% w/w وتستخدم مجالات قوة جميع الذرات وذرات موحدة. تكشف النتائج أن PG يتواجد بشكل رئيسي في مناطق رأس المجموعة المحبة للماء…
-
الديناميات البيومولكولية مع مجالات القوة الكمومية المدربة بواسطة التعلم الآلي على شظايا كيميائية متنوعة
2024 | المؤلف: Oliver T. Unke وآخرون | المجلة: Science Advances | المجال: كيمياء المواد (Materials Chemistry)تناقش هذه الفقرة التقدم في محاكاة الديناميكا الجزيئية (MD)، وخاصة التحديات المرتبطة بتحقيق نتائج دقيقة للأنظمة الكبيرة. تعتمد محاكاة MD التقليدية غالبًا على الحسابات الكمومية، والتي تكون مكلفة حسابيًا، بينما تفتقر مجالات القوة التجريبية، على الرغم من كونها أكثر كفاءة، إلى الموثوقية. يقدم إدخال مجالات القوة المستفادة من التعلم الآلي (MLFFs) بديلاً واعدًا، حيث يوفر…
-
تجميد كهربائي للماء السائل في ظروف محيطية
2024 | المؤلف: Giuseppe Cassone وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الفيزياء الذرية والجزيئية والبصريات (Atomic and Molecular Physics, and Optics)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في تأثيرات المجالات الكهربائية الخارجية على الماء، مع التركيز بشكل خاص على ظاهرة التجمد الكهربائي. باستخدام محاكاة الديناميكا الجزيئية الطويلة من البداية في ظروف محيطة، يستكشفون كيف يستجيب الماء للمجالات الكهربائية في نطاق 0.10 إلى 0.15 فولت/Å. تكشف النتائج أن هذه المجالات يمكن أن تحفز الانتقال إلى مرحلة غير متبلورة…