الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ديناميات الجزيئات
-
DynamicBind: التنبؤ بهيكل معقد البروتين-الليغاند المحدد بواسطة ليغاند باستخدام نموذج توليدي عميق متساوي
2024 | المؤلف: Wei Lu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تحدد هذه القسم قيود الطرق التقليدية في التنبؤ بتفاعلات البروتين-الليغاند، وخاصة المعالجة الصارمة للبروتينات في دراسات الربط وكثافة الحوسبة لمحاكاة الديناميات الجزيئية. مع إدراك أهمية ديناميات البروتين لفهم الوظيفة والمساعدة في اكتشاف الأدوية، يقدم المؤلفون DynamicBind، وهو نهج جديد للتعلم العميق يستخدم شبكات الانتشار الهندسية المتكافئة. هذه الطريقة تبني مشهد طاقة سلس يسهل الانتقالات الفعالة…
-
نموذج ذري وجزيئي كبير لجدار الخلية الثانوية لـ Populus مستند إلى الرنين المغناطيسي النووي في الحالة الصلبة
2024 | المؤلف: Bennett Addison وآخرون | المجلة: Science Advances | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم تكوين وتعقيد الهيكل للجدران الخلوية الثانوية للنباتات (SCWs)، والتي تتكون أساسًا من السليلوز، والهميسليلوز، واللجنين. على الرغم من أهميتها، لا تزال التفاعلات الجزيئية المحددة والعمارة العليا للجدران الخلوية الثانوية غير مفهومة جيدًا. يستخدم المؤلفون الرنين المغناطيسي النووي في الحالة الصلبة (ssNMR) للحصول على رؤى حول التكوين الهيكلي والتفاعلات لهذه البوليمرات الحيوية في…