الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: فضاء كيميائي
-
اكتشاف قائم على الهيكل لمثبطات مجال Mac1 للبروتين غير الهيكلي-3 من SARS-CoV-2 من خلال فحص معزز بتعلم الآلة لمساحة المواد الكيميائية
2026 | المؤلف: Fuqiang Ban وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)في الأبحاث الأخيرة، تم التركيز بشكل كبير على تحديد مثبطات الجزيئات الصغيرة التي تستهدف ماكرودومين 1 (Mac1) من البروتين غير الهيكلي 3 (NSP3) كعوامل مضادة للفيروسات محتملة لـ SARS-CoV-2. تم اختيار Mac1 كهدف لتقييم التجارب لإيجاد الأهداف (CACHE) التحدي #3، حيث طورت فريقنا استراتيجية حسابية تصدرت بين 23 مشاركًا. أدت هذه الطريقة إلى اكتشاف سلسلة…
-
الطبيعة تلتقي بالآلة: نهضة الذكاء الاصطناعي في اكتشاف الأدوية من المنتجات الطبيعية
2026 | المؤلف: Rajesh Muthuraj وآخرون | المجلة: Natural Products and Bioprospecting | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تسلط هذه المراجعة الضوء على الدور الحاسم للمنتجات الطبيعية (NPs) في اكتشاف الأدوية، مشيرة إلى أهميتها التاريخية في تطوير العلاجات مثل باكليتاكسيل وأرتيميسينين. على الرغم من أهميتها، فإن اكتشاف المنتجات الطبيعية قد تراجع بسبب التحديات مثل التعقيد الهيكلي، وانخفاض العائد الحيوي النشط، وهيمنة الكيمياء الاصطناعية. يجادل المؤلفون بأن الذكاء الاصطناعي (AI) يمكن أن يعالج هذه…
-
EMFF-2025: شبكة عصبية عامة للمواد الطاقية مع عناصر C و H و N و O
2025 | المؤلف: Mingjie Wen وآخرون | المجلة: npj Computational Materials | المجال: ميكانيكا المواد (Mechanics of Materials)تناقش هذه الفقرة التحديات المرتبطة باكتشاف وتحسين المواد عالية الطاقة (HEMs)، وخاصة التكاليف الحسابية والدورات البطيئة للطرق التقليدية. يقدم EMFF-2025، وهو نموذج محتمل للشبكات العصبية (NNP) مصمم للمواد عالية الطاقة القائمة على C و H و N و O، والذي يستخدم التعلم الانتقالي لتحقيق دقة على مستوى نظرية الكثافة الوظيفية (DFT) مع الحد الأدنى من…
-
التخليق الانتقائي للديستيريو من السيكلوبوتانات متعددة الاستبدال عبر الفسفرة المائية المتباينة المنضبطة بالتحفيز للسيكلوبوتانات الأسيليّة
2025 | المؤلف: Heng-Xian He وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء اللاعضوية (Inorganic Chemistry)قسم “الطرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون مزيجًا من الأساليب الكمية والنوعية لجمع البيانات. على وجه التحديد، قاموا بإجراء تجارب محكومة لاختبار الفرضيات، مع التأكد من أن المتغيرات تم التلاعب بها وقياسها بشكل منهجي. تم إجراء التحليلات الإحصائية باستخدام أدوات البرمجيات لتقييم دلالة النتائج، مع التركيز على قيم p وفترات…
-
التعلم العميق التوليدي لتصميم أدوية جديدة – ملحمة الفضاء الكيميائي
2025 | المؤلف: Rıza Özçelik وآخرون | المجلة: Journal of Chemical Information and Modeling | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم هذه القسم نظرة عامة على دور التعلم العميق التوليدي في تصميم الأدوية، مع تسليط الضوء على إمكانيته في التنقل عبر الفضاء الكيميائي الواسع وإنشاء جزيئات جديدة بخصائص بيولوجية محددة. يتناول التحديات التي تواجه توليد الجزيئات الصغيرة، وتقييمها، وتحديد أولوياتها، وخاصة الحاجة إلى التوفيق بين المعلومات المتضاربة بشأن التنوع الكيميائي، وقابلية التركيب، والنشاط البيولوجي. يؤكد…
-
التصميم العكسي للأطر المعدنية العضوية باستخدام أساليب الحلم العميق
2025 | المؤلف: Conor Cleeton وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء اللاعضوية (Inorganic Chemistry)يتناول هذا القسم من ورقة البحث إمكانية استكشاف الفضاء الكيميائي للأطر العضوية المعدنية (MOFs) لتقدم علم المواد. تُعرف MOFs بهندستها المعمارية القابلة للتعديل، مما يسمح بتخصيص كبير لوظائفها. ومع ذلك، فإن تحديد الهياكل المثلى لـ MOF يمثل تحديًا بسبب طرق الفحص الحسابي التقليدية ذات الإنتاجية العالية (HTCS)، التي غالبًا ما تظهر تحيزًا تجاه المواد التي…
-
استكشاف وتوسيع الفضاء الكيميائي الطبيعي للديترينات البكتيرية
2025 | المؤلف: Xiuting Wei وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم استخدام تقنيات مختلفة من الرنين المغناطيسي النووي (NMR)، بما في ذلك \( ^1H \)، \( ^{13}C \)، وطرق NMR ثنائية الأبعاد مثل \( ^1H-^{13}C \) HSQC، \( ^1H-^1H \) COSY، \( ^1H-^{13}C \) HMBC، و\( ^1H-^1H \) NOESY، لتحليل العينات المذابة في CDCl\(_3\) أو C\(_6\)D\(_6\). تم معايرة جميع الانزياحات الكيميائية ضد…
-
الهندسة المتسارعة للإنزيمات بواسطة التعبير الخالي من الخلايا الموجه بتعلم الآلة
2025 | المؤلف: Grant M. Landwehr وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم ورقة البحث منصة جديدة موجهة بواسطة التعلم الآلي (ML) تهدف إلى التغلب على قيود هندسة الإنزيم التقليدية، خاصة في توليد مجموعات بيانات واسعة من علاقات التسلسل-الوظيفة للتصميم التنبؤي. تدمج هذه المنصة تجميع الحمض النووي الخالي من الخلايا، والتعبير الجيني الخالي من الخلايا، والاختبارات الوظيفية لرسم خرائط فعالة لمشاهد اللياقة عبر مساحة تسلسل البروتين، مما…
-
تحسين بايزي مغلق الحلقة المتسلسل كدليل لاكتشاف تركيبات المحفزات الضوئية المعدنية العضوية
2024 | المؤلف: Xiaobo Li وآخرون | المجلة: Nature Chemistry | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)في هذه الدراسة، تم استخدام استراتيجية تحسين بايزي التجريبية (BO)، بالاشتراك مع موصوفات جزيئية، لتحديد محفزات ضوئية عضوية واعدة (OPCs) من مكتبة افتراضية تضم 560 جزيئًا مرشحًا. استكشفت عملية البحث الأولية في BO مجموعة فرعية محدودة من الفضاء الكيميائي، حيث تم تقييم 55 من أصل 560 OPCs، بينما قامت عملية التحسين اللاحقة بتقييم 107 من…
-
توليد مركبات متعددة الأهداف من جديد باستخدام الكيمياء التوليدية العميقة
2024 | المؤلف: Brenton P. Munson وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تناقش هذه الفقرة تطوير POLYGON، وهو نهج جديد في علم الأدوية المتعددة الذي يستفيد من التعلم المعزز التوليدي لتصميم مركبات قادرة على تثبيط أهداف بروتينية متعددة. يعمل POLYGON عن طريق تضمين الفضاء الكيميائي وأخذ عينات منه بشكل تكراري لتوليد هياكل جزيئية جديدة، والتي يتم تقييمها بناءً على تأثيراتها التثبيطية المتوقعة على هدفين بروتينين، وخصائص شبيهة…