الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: محاكاة الديناميات الجزيئية
-
تقلبات الحلقة العطرية تكشف عن إعادة تشكيل ديناميات البروتين في البلورات والمجمعات
2026 | المؤلف: Lea Marie Becker وآخرون | المجلة: Nature Chemistry | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه الفقرة تأثير بلورة البروتين على المناظر الطاقية التوافقية، مشددة على أن كل من التفاعلات الجزيئية الداخلية والعوامل البيئية تشكل هذه المناظر. بشكل محدد، تبحث الدراسة في كيفية تأثير الاتصالات الجزيئية في بلورات البروتين والمجمعات، مثل بروتين GB1 في مجمعه مع IgG، على ديناميات البروتين. باستخدام تقنيات وسم النظائر المتقدمة وطرق NMR الكمية، يكشف…
-
المجالات المطوية تفرض تباينًا هيكليًا وديناميات مخففة في المكثفات البيولوجية
2026 | المؤلف: Liguo Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستكشف هذه الدراسة الهيكل الداخلي للتركيزات البيومولكولية التي تتكون من بروتينات متعددة المجالات (MDPs) مقارنة بتلك التي تتكون فقط من المناطق غير المنضبطة بشكل جوهري (IDRs) أو المجالات ذات التعقيد المنخفض (LCDs). باستخدام محاكاة الديناميكا الجزيئية، يكشف المؤلفون أنه بينما تظهر التركيزات التي تحتوي على IDR فقط أشكالًا موسعة بشكل موحد على مدى عشرات الميكروثواني،…
-
توضيح آلي لمبيد نيماتودي نانو تيربينويد لإدارة نيماتودا عقد الجذور، Meloidogyne incognita، التي تصيب الطماطم
2026 | المؤلف: Lakshmanan Arunachalam وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علوم النبات (Plant Science)تبحث هذه الدراسة في تطوير وفعالية تركيبة نانوية قائمة على التربينود (Terpaz®، TNF) كمبيد نيماتودي ضد Meloidogyne incognita، وهو آفة مهمة في إنتاج الخضروات. استخدمت الدراسة منهجية شاملة، بما في ذلك التوصيف الفيزيائي الكيميائي، واختبارات حيوية في المختبر، ورسم جزيئي، وتقييمات ميدانية. أظهرت TNF حجم قطيرات نانوية يبلغ 79.69 نانومتر ومؤشر تباين ضيق (PDI) يبلغ…
-
التعرف الحاسوبي على المركبات الكيميائية النباتية من Terminalia arjuna كمثبطات محتملة لـ 3α-HSD3
2026 | المؤلف: Md. Abdullah Al Mashud وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الوراثة (Genetics)تدرس هذه الدراسة دور إنزيم 3α-Hydroxysteroid dehydrogenase type 3 (3α-HSD3) في خلايا سرطان الثدي الإيجابية لمستقبلات الإستروجين (ER⁺) MCF-7، مع التركيز على إمكانيته كهدف علاجي. هدف الباحثون إلى تحديد مثبطات طبيعية من المكونات النباتية لـ Terminalia arjuna لتعديل تكاثر الخلايا. تم فحص ما مجموعه تسعة مركبات نباتية باستخدام طرق حسابية، بما في ذلك الربط الجزيئي،…
-
التواء الحمض النووي DNA عند تركيزات عالية من أيونات القلوي: دليل ضد شكل C من الحمض النووي DNA في المحلول
2026 | المؤلف: Koen R Storm وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في تأثيرات تركيزات الملح العالية على التواء الحمض النووي، وهي خاصية أساسية تتأثر بالبيئة الأيونية. باستخدام ملاقط مغناطيسية لجزيئات فردية، قاموا بقياس التواء الحمض النووي في محاليل LiCl و NaCl و KCl و CsCl، وكشفوا أن التواء الحمض النووي يزيد في البداية تقريبًا كما هو $\sim [\text{salt}]^{1/2}$ ولكنه يستقر بل…
-
تقييم الإمكانات المضادة للالتهابات للأتورفاستاتين المستهدف لـ TNF-α وIL-6 وIL-1β باستخدام أساليب متكاملة في المختبر وفي السليكو
2026 | المؤلف: Krishna Swaroop وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تستعرض هذه القسم دراسة تبحث في الإمكانات المضادة للالتهابات للأتورفاستاتين، وهو دواء يستخدم عادة لإدارة الكوليسترول، من خلال استهداف السيتوكينات المؤيدة للالتهابات مثل عامل نخر الورم ألفا (TNF-α)، وإنترلوكين-1 بيتا (IL-1β)، وإنترلوكين-6 (IL-6). يبرز الخلفية دور هذه السيتوكينات في الأمراض الالتهابية المزمنة، مما يبرز الحاجة إلى علاجات مضادة للالتهابات فعالة. استخدمت الدراسة ربط الجزيئات لتقييم…
-
رؤى آلية حول فك الارتباط المدفوع بواسطة PCBP1 لحمض DNA i-motif المختار عند نقطة التفتيش G1/S
2026 | المؤلف: Pallabi Sengupta وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث دور بروتين ربط بولي(rC) 1 (PCBP1) في تنظيم الأشكال i، وهي هياكل DNA رباعية الخيوط توجد في مناطق غنية بالسيتوزين من الجينوم. تحدد الدراسة PCBP1 كبروتين ربط انتقائي للأشكال i يمكنه فك الأشكال i المحددة بناءً على حالات بروتوناتها وقدرات تشكيل الشعر. من خلال تجارب تقصير منهجية، وُجد أن…
-
تفاعل نقل السيانيد الانتقائي بالاستريو المدعوم بتحفيز إنزيمي ضوئي
2026 | المؤلف: Xinyu Duan وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)تناقش هذه الفقرة أهمية نقل المجموعات الوظيفية في التخليق العضوي، مع التأكيد على قدرتها على تمكين التعديلات الدقيقة للهياكل الجزيئية ومواقع المجموعات الوظيفية. ومع ذلك، تشير إلى توفر منهجيات محدودة توفر تحكمًا دقيقًا في الاستيريو خلال هذه الهجرات. يقدم المؤلفون استراتيجية جديدة تعتمد على الإنزيمات الضوئية لنقل السيانو التي تحقق هذا التحكم الاستيريو بنجاح من…
-
نشر نهج الفحص الافتراضي عالي الإنتاجية (HTVS) لتحديد مثبطات جديدة لإنزيم اللاكتات ديهيدروجيناز (LDH) ذات خصائص مضادة للسرطان
2026 | المؤلف: Yaxun Huang وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)في هذه الدراسة، استخدم المؤلفون نهج الفحص الافتراضي عالي الإنتاجية (HTVS) لاكتشاف مثبطات جديدة لإنزيم لاكتات ديهيدروجيناز (LDH)، وهو إنزيم مرتبط بتمثيل الخلايا السرطانية. من خلال تطوير نموذج دوائي استنادًا إلى 28 مثبطًا معروفًا لـ LDH، قاموا بفحص مكتبة من 500,000 ركيزة، مما أدى في النهاية إلى تحديد خمسة مرشحين واعدين. خضعت هذه المرشحات لمزيد…
-
قابلية الخلط بين النواة والغلاف في الكواكب الفرعية نبتونية والكواكب العملاقة
2026 | المؤلف: Travis Gilmore وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الفلك والفيزياء الفلكية (Astronomy and Astrophysics)تناقش هذه الفقرة الخصائص الفريدة وتكوين الكواكب الفرعية نبتونية والكواكب العملاقة، وهي أنواع شائعة من الكواكب الخارجية غير الموجودة في النظام الشمسي. هذه الكواكب، التي تتراوح أقطارها بين الأرض ونبتون، تطرح أسئلة أساسية تتعلق بهيكلها الداخلي. الكواكب العملاقة صخرية في الأساس، بينما يُعتقد أن الكواكب الفرعية نبتونية تحتوي على نواة صخرية محاطة بغلاف غني بالهيدروجين.…