تخطى إلى المحتوى
العالِم العربي
  • الصفحة الرئيسية
  • مجالات الأبحاث
  • عن الموقع
  • تواصل معنا
  1. الرئيسية
  2. قائمة الكلمات المفتاحية
  3. محاكاة الديناميات الجزيئية

الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: محاكاة الديناميات الجزيئية




  • تفاعل نقل السيانيد الانتقائي بالاستريو المدعوم بتحفيز إنزيمي ضوئي

    2026 | المؤلف: Xinyu Duan وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)

    تناقش هذه الفقرة أهمية نقل المجموعات الوظيفية في التخليق العضوي، مع التأكيد على قدرتها على تمكين التعديلات الدقيقة للهياكل الجزيئية ومواقع المجموعات الوظيفية. ومع ذلك، تشير إلى توفر منهجيات محدودة توفر تحكمًا دقيقًا في الاستيريو خلال هذه الهجرات. يقدم المؤلفون استراتيجية جديدة تعتمد على الإنزيمات الضوئية لنقل السيانو التي تحقق هذا التحكم الاستيريو بنجاح من…


  • قابلية الخلط بين النواة والغلاف في الكواكب الفرعية نبتونية والكواكب العملاقة

    2026 | المؤلف: Travis Gilmore وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الفلك والفيزياء الفلكية (Astronomy and Astrophysics)

    تناقش هذه الفقرة الخصائص الفريدة وتكوين الكواكب الفرعية نبتونية والكواكب العملاقة، وهي أنواع شائعة من الكواكب الخارجية غير الموجودة في النظام الشمسي. هذه الكواكب، التي تتراوح أقطارها بين الأرض ونبتون، تطرح أسئلة أساسية تتعلق بهيكلها الداخلي. الكواكب العملاقة صخرية في الأساس، بينما يُعتقد أن الكواكب الفرعية نبتونية تحتوي على نواة صخرية محاطة بغلاف غني بالهيدروجين.…


  • التفاعلات المحددة بين مشتقات الفيتامين D3 المفلورة ومستقبل الفيتامين D: ميكانيكا جزيئية وحسابات مدارية جزيئية من البداية

    2026 | المؤلف: Masayuki Yuguchi وآخرون | المجلة: Journal of Molecular Modeling | المجال: علم الأمراض والطب الشرعي (Pathology and Forensic Medicine)

    في هذه الدراسة، قام المؤلفون بالتحقيق في التفاعلات بين مشتقات فيتامين D3 (VD3) المفلورة المختلفة ومستقبل فيتامين D (VDR) لفهم affinities الربط المعززة التي لوحظت في بعض المشتقات. باستخدام ميكانيكا الجزيئات (MM) وحسابات الجزيئات الفرعية الأولية (FMO)، ركزت الأبحاث على الديستيرومرات لمشتقات VD3 بناءً على مراكزها الاستيريو C3 و C13. كشفت النتائج أن طاقات الربط…


  • الأساس الهيكلي لتكوين الغشاء الخارجي بواسطة ناقل TamAB

    2026 | المؤلف: Biao Yang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الوراثة (Genetics)

    تناقش الورقة التفاعلات بين بروتينات TamA و TamB، مع التركيز بشكل خاص على دور مجالات POTRA في TamA في الارتباط بـ TamB. تحدد الدراسة ثلاثة واجهات تفاعل متميزة: الأول يتضمن روابط هيدروجينية وجسور ملحية بين بقايا محددة في مجال POTRA 1 لـ TamA ومجموعة متنوعة من البقايا في TamB؛ الثاني يتضمن تفاعلات بين البقايا في…


  • فك تشفير مجموعات البنية الهيكلية للـ RNA: استكشاف المناظر الطاقية للـ TAR Stemloop

    2026 | المؤلف: Konstantin Röder | المجلة: Journal of Chemical Theory and Computation | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

    يتناول هذا القسم من ورقة البحث التحديات والتقدم في دراسة مجموعات RNA الهيكلية، والتي تعتبر ضرورية لفهم الآليات الخلوية وتطوير التدخلات العلاجية. يبرز المؤلفون الصعوبات الكامنة بسبب تعدد أشكال RNA الهيكلية وطبيعته الديناميكية، مما يتطلب مزيجًا من الطرق الحاسوبية والتجريبية. يقدمون نهجًا جديدًا باستخدام استكشافات المناظر الطاقية عبر أخذ عينات من المسارات المنفصلة، مما يوضح…


  • تصميم موجه بالهيكل لمتغير جديد ومستقر وقابل للذوبان من Cecropin A للتطبيقات العلاجية المضادة للميكروبات

    2025 | المؤلف: Samaneh Hashemi وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)

    تركز البحث على هندسة Cecropin A، وهو ببتيد مضاد للميكروبات، للتغلب على قيوده في الاستقرار، القابلية للذوبان، والتوافر البيولوجي. النسخة المهندسة، المشار إليها باسم Pep A، تتضمن ببتيد استهداف (MTP) في الطرف N، وتسلسل EAK16-II الذي يتجمع ذاتيًا في الطرف C، ووصل EAAAK صلب. أدت هذه التعديلات إلى تحسين الخصائص الفيزيائية والكيميائية، بما في ذلك…


  • تقييم الديناميكا الدوائية، السمية، والتفاعل الجزيئي للمواد الفينولية المستخلصة من الزنجبيل لتثبيط البروتياز الرئيسي لفيروس SARS-CoV-2

    2025 | المؤلف: Mehdi Yoosefian وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)

    تدرس هذه الدراسة الإمكانيات المضادة للفيروسات للمركبات الفينولية المستمدة من الزنجبيل (Zingiber officinale)، وتحديداً الزنجبيلول، بارادول، وشوجول، ضد البروتياز الرئيسي (Mpro) لفيروس SARS-CoV-2، وهو إنزيم رئيسي في تكاثر الفيروس. باستخدام نهج حسابي متعدد المستويات، استخدمت الأبحاث نظرية الكثافة الوظيفية (DFT) لتقييم الخصائص الكيميائية لهذه المركبات، مما كشف عن شوجول كأكثرها تفاعلاً مع أقل صلابة كيميائية…


  • دور الميكروبلاستيك كناقلات للملوثات المضادة للبكتيريا من خلال نهج المحاكاة الجزيئية

    2025 | المؤلف: Sedigheh Abdollahi وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: التلوث (Pollution)

    تدرس هذه الدراسة آليات الامتزاز لثلاثة مضادات حيوية—سيبروفلوكساسين، أموكسيسيلين، وتتراسيكلين—على الميكروبلاستيك غير القابل للتحلل، وبالتحديد بولي بروبيلين (PP) وبولي ستيرين (PS)، باستخدام محاكاة الديناميات الجزيئية (MD). تسلط الأبحاث الضوء على أن شيخوخة الميكروبلاستيك، التي تم محاكاتها من خلال إدخال مجموعات وظيفية مؤكسدة ومحبة للماء، تعزز بشكل كبير كفاءة الامتزاز لهذه المضادات الحيوية. على سبيل المثال،…


  • التنقل في مشاهد البروتين باستخدام نموذج خشن قابل للنقل تم تعلمه بواسطة الآلة

    2025 | المؤلف: Nicholas E. Charron وآخرون | المجلة: Nature Chemistry | المجال: كيمياء المواد (Materials Chemistry)

    في هذه الدراسة، قام المؤلفون بتطوير مجموعة بيانات تتضمن محاكاة للمذيبات الصريحة لجميع الذرات لـ 50 مجالًا من CATH، والتي تمثل بروتينات صغيرة ذات هياكل مطوية متنوعة، إلى جانب حوالي 1,200 ثنائي من أحادي وثنائي الببتيدات. قاموا بتسجيل القوى الفورية المؤثرة على ذرات البروتين وأجروا تجميعًا أساسيًا للقوى على تمثيل هيكل عظمي خشن (CG) للبروتينات.…


  • هيكل الكربون السائل موضح بواسطة حيود الأشعة السينية في الموقع

    2025 | المؤلف: D. Kraus وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الجيوفيزياء (Geophysics)

    في هذا القسم، يصف المؤلفون المنهجية المستخدمة في تجارب ضغط الصدمة المدفوعة بالليزر لتحديد الضغط في عينات الكربون. باستخدام نبضات مضاعفة التردد من ليزر DiPOLE 100-X، بطول موجي يبلغ 515 نانومتر وقطر بقعة ملساء يبلغ حوالي 250 ميكرومتر، تعرضت العينات لضغط الصدمة. تضمنت الإعدادات التجريبية حيود الأشعة السينية (XRD) المسجلة بواسطة كواشف لوحة مسطحة Varex…


1 2 3
التالي→

حقوق النشر © 2026 العالِم العربي. جميع الحقوق محفوظة. موقع العالِم العربي غير مسؤول عن محتوى المواقع الخارجية.