الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: نظام بيولوجي
-
نموذج انتشار مزدوج يمكّن من توليد الجزيئات ثلاثية الأبعاد وتحسين الرصاص بناءً على جيوب الهدف
2024 | المؤلف: Lei Huang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)ت outlines ورقة البحث المبادئ الأساسية لنموذج الانتشار، الذي يعمل من خلال سلسلتين مترابطتين من ماركوف: عملية الانتشار وعملية العكس (إزالة الضوضاء). تقوم عملية الانتشار بإدخال ضوضاء غاوسية بشكل منهجي إلى البيانات على مدى سلسلة من الخطوات الزمنية، مما يحول توزيع البيانات الحقيقي إلى توزيع ضوضاء محدد مسبقًا. يتم التحكم في هذا التحويل من خلال…
-
نموذج عصبي حيوي مع أغشية مزدوجة
2024 | المؤلف: Yanni Li وآخرون | المجلة: Nonlinear Dynamics | المجال: الفيزياء الإحصائية وغير الخطية (Statistical and Nonlinear Physics)في هذا البحث، يستقصي المؤلفون الفروق الكهربية الفسيولوجية بين البيئات داخل الخلوية وخارج الخلوية، مع التأكيد على أهمية تنوع الطاقة السعوية في أنماط إطلاق الأعصاب. غالبًا ما تتجاهل نماذج الخلايا العصبية الحتمية التقليدية المرونة الديناميكية لأغشية الخلايا تحت المؤثرات الخارجية، حيث تعتمد عادةً على متغير سعوي واحد لتقييم إمكانيات الأغشية. لمعالجة هذه القيود، يقدم البحث…
-
إلكترونيات شبكية مدمجة مع وظائف متعددة متقاربة لتتبع ديناميات الإثارة والانقباض متعددة الأوضاع في الأنسجة الدقيقة القلبية
2024 | المؤلف: Hongyan Gao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)قسم “الطرق” في ورقة البحث يحدد تصميم التجارب والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تم اختيار المشاركين من خلال طريقة أخذ عينات طبقية لضمان تمثيل عينة، وتم إجراء التجارب في ظروف خاضعة للرقابة لتقليل المتغيرات الخارجية. شمل جمع البيانات…
-
معايرة النماذج المعتمدة على الوكلاء لنمو الأورام أحادية الطور وثنائية الطور باستخدام حساب بايزي التقريبي
2024 | المؤلف: Xiaoyu Wang وآخرون | المجلة: Journal of Mathematical Biology | المجال: النمذجة والمحاكاة (Modeling and Simulation)تناقش هذه الفقرة استخدام نماذج قائمة على الوكلاء (ABMs) في فهم تطور الأورام، مع تسليط الضوء بشكل خاص على نموذج الخلايا المستند إلى فوروينوي (VCBM). يستخدم هذا النموذج تقسيم فوروينوي لتمثيل أشكال الخلايا الفردية ويقوم بمحاكاة تكاثر الخلايا السرطانية وحركتها. مع الاعتراف بالنمو الثنائي المراحل الذي لوحظ في الأورام، يقوم المؤلفون بتوسيع VCBM ليشمل مرحلتين…
-
DynamicBind: التنبؤ بهيكل معقد البروتين-الليغاند المحدد بواسطة ليغاند باستخدام نموذج توليدي عميق متساوي
2024 | المؤلف: Wei Lu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تحدد هذه القسم قيود الطرق التقليدية في التنبؤ بتفاعلات البروتين-الليغاند، وخاصة المعالجة الصارمة للبروتينات في دراسات الربط وكثافة الحوسبة لمحاكاة الديناميات الجزيئية. مع إدراك أهمية ديناميات البروتين لفهم الوظيفة والمساعدة في اكتشاف الأدوية، يقدم المؤلفون DynamicBind، وهو نهج جديد للتعلم العميق يستخدم شبكات الانتشار الهندسية المتكافئة. هذه الطريقة تبني مشهد طاقة سلس يسهل الانتقالات الفعالة…
-
التنبؤ بديناميات الميكروبيوم في منطقة الجذور باستخدام نموذج ميزانية الطاقة المستند إلى الجينوم والسمات
2024 | المؤلف: Gianna L. Marschmann وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم التربة (Soil Science)قسم “الطرق” يوضح الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يوضح معايير اختيار المشاركين، والتدخلات أو العلاجات المحددة التي تم إدارتها، والأدوات أو الأجهزة المستخدمة لجمع البيانات. يتم وصف التحليلات الإحصائية، بما في ذلك النماذج المطبقة لتقييم النتائج والعتبات الدلالية المحددة لاختبار الفرضيات. بالإضافة إلى ذلك، قد يتضمن القسم معلومات حول حسابات حجم العينة لضمان قوة…
-
القياس المباشر لتدرجات الجاذب الديناميكية يكشف عن انهيار نموذج الكيمياء الجاذبية باتلاك-كيلر-سيجل
2024 | المؤلف: Trung V. Phan وآخرون | المجلة: Proceedings of the National Academy of Sciences | المجال: النمذجة والمحاكاة (Modeling and Simulation)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في ديناميات البكتيريا الكيميائية، مع التركيز بشكل خاص على كيفية تنقل هذه الكائنات عبر التدرجات الكيميائية بينما تقوم في الوقت نفسه بتغيير بيئتها من خلال استهلاك وإفراز المواد الجاذبة. باستخدام مستشعر فلوري للأسبرتات، يقيسون تدرجات المواد الكيميائية الجاذبة التي تنتجها تجمعات البكتيريا خلال الهجرة الجماعية. تكشف نتائجهم أن نموذج باتلاك-كيلر-سيغيل…
-
نموذج ذري وجزيئي كبير لجدار الخلية الثانوية لـ Populus مستند إلى الرنين المغناطيسي النووي في الحالة الصلبة
2024 | المؤلف: Bennett Addison وآخرون | المجلة: Science Advances | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم تكوين وتعقيد الهيكل للجدران الخلوية الثانوية للنباتات (SCWs)، والتي تتكون أساسًا من السليلوز، والهميسليلوز، واللجنين. على الرغم من أهميتها، لا تزال التفاعلات الجزيئية المحددة والعمارة العليا للجدران الخلوية الثانوية غير مفهومة جيدًا. يستخدم المؤلفون الرنين المغناطيسي النووي في الحالة الصلبة (ssNMR) للحصول على رؤى حول التكوين الهيكلي والتفاعلات لهذه البوليمرات الحيوية في…
-
التنبؤ بالقيود الغذائية الميكروبية من إطار عمل قائم على النسبة المولية
2024 | المؤلف: Yongxing Cui وآخرون | المجلة: The Innovation Geoscience | المجال: علم التربة (Soil Science)تقدم هذه القسم إطارًا عتبيًا مصممًا للتنبؤ بقيود العناصر الغذائية الميكروبية في التربة. يتم التحقق من العتبات النظرية التي تم تحديدها ضمن هذا الإطار مقابل العتبات التجريبية المستمدة من مجموعة بيانات عالمية. ومن الجدير بالذكر أن الدراسة تحدد أن زاوية متجه 45° في نموذج المتجهات الإيكوانزيمية تميل إلى المبالغة في تقدير قيود الفوسفور الميكروبي. في…