تكشف تحليلات النسخ والتمثيل الأيضي المدمجة عن تأثيرات السيلينيوم على نمو وجودة الزنبق ذو الأوراق الطويلة
Combined transcriptome and metabolome analyses reveal the effects of selenium on the growth and quality of Lilium lancifolium

شارك:
المجلة: Frontiers in Plant Science، المجلد: 15
DOI: https://doi.org/10.3389/fpls.2024.1399152
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38828223
تاريخ النشر: 2024-05-17
المؤلف: Xiaogang Jiang وآخرون
الموضوع الرئيسي: السيلينيوم في الأنظمة البيولوجية

نظرة عامة

تبحث الدراسة في آثار تركيزات السيلينيوم (Se) المتغيرة على نمو وجودة التغذية لنبات *Lilium lancifolium Thunb* (L. lancifolium)، وهو نبات طبي وصالح للأكل. من خلال التحليلات النسخية، والتمثيلية، والبيوكيميائية، تحدد الدراسة أن محتوى السيلينيوم الكلي والعضوي في المصابيح يزداد مع زيادة جرعات السيلينيوم (0-8.0 ملمول/لتر). ومن الجدير بالذكر أن تركيز السيلينيوم المنخفض 2.0 ملمول/لتر يعزز النمو وتراكم المستقلبات، بينما تظهر التركيزات الأعلى (≥4.0 ملمول/لتر) تأثيرات مثبطة. تشمل النتائج الرئيسية زيادات كبيرة في وزن المصباح، والأحماض الأمينية، والسكريات القابلة للذوبان، والبروتينات القابلة للذوبان عند مستوى السيلينيوم الأمثل.

تكشف التحليلات المتكاملة أن زيادة التعبير عن الجينات المرتبطة بالدهون الفوسفورية (GPD1، GPAT، ADPRM)، والأحماض الأمينية (glyA، asnB، nadB، thrA، SAT)، وعمليات التمثيل الغذائي للسكريات القابلة للذوبان (SUS، bgl B، BAM، SGA1) تحت معالجة السيلينيوم تساهم في تحسين النمو وجودة التغذية. تؤسس هذه الدراسة 2.0 ملمول/لتر من السيلينيوم كتركيز أمثل لتعزيز الملف الغذائي لـ L. lancifolium وتوضح الآليات الجزيئية المعنية في الاستجابات الناتجة عن السيلينيوم، مما يوفر رؤى قيمة حول إمكانيات التحصين الحيوي لهذا النبات.

مقدمة

تناقش مقدمة ورقة البحث الأنواع العشبية المعمرة Lilium lancifolium Thunb، التي تنتمي إلى شرق آسيا، والتي لها تطبيقات في كل من الطب والغذاء. المصابيح الصالحة للأكل من L. lancifolium غنية بالعناصر الغذائية الأساسية، بما في ذلك السكروز، والبوليسكريات، والأحماض الأمينية، والفيتامينات، والمعادن. يتم تسليط الضوء على السيلينيوم (Se)، وهو عنصر تتبع مهم، لفوائده الصحية لدى البشر والحيوانات، بالإضافة إلى دوره المزدوج في نمو النباتات، حيث يمكن أن تعزز التركيزات المعتدلة النمو ومحتوى العناصر الغذائية، بينما يمكن أن تكون الكميات الزائدة ضارة.

على الرغم من الأبحاث الواسعة حول آثار السيلينيوم على أنواع النباتات المختلفة، إلا أن التأثير المحدد للسيلينيوم على L. lancifolium لا يزال غير مستكشف. يقترح المؤلفون التحقيق في ذلك من خلال استخدام تحليلات النسخ والتمثيل المشترك لتوضيح الشبكات التنظيمية بين الجينات والمستقلبات الرئيسية استجابةً لمعالجة السيلينيوم. تهدف الدراسة إلى تقييم الخصائص الشكلية والفسيولوجية والجودة لـ L. lancifolium تحت تركيزات سيلينيوم متغيرة، باستخدام تقنيات متقدمة مثل Illumina NovaSeq 6000 و HPLC-MS/MS. من المتوقع أن توفر هذه الأبحاث رؤى قيمة حول الآليات الجزيئية التي يؤثر من خلالها السيلينيوم على نمو وجودة مصابيح L. lancifolium.

طرق البحث

في هذه الدراسة، تم زراعة نباتات L. lancifolium الصحية التي تبلغ من العمر عامين في أصص بلاستيكية داخل بيئة دفيئة. بعد فترة تأقلم مدتها 30 يومًا، تم معالجة النباتات بتركيزات متغيرة من محاليل سيلينيت الصوديوم (0، 0.5، 1.0، 2.0، 4.0، أو 8.0 ملمول/لتر)، مع تطبيق 250 مل من المحلول على كل أصيص. تم إعطاء تطبيق ثانٍ بنفس جرعة السيلينيوم بعد 45 يومًا. بعد 90 يومًا من الزراعة، تم حصاد النباتات للتحليل.

تم تقييم العينات المجمعة لعدة معايير بيوكيميائية، بما في ذلك محتوى الكلوروفيل، والسكريات القابلة للذوبان، والبروتينات القابلة للذوبان، وتركيز السيلينيوم، والفلافونويدات الكلية، والقلويدات. بالإضافة إلى ذلك، تم اختيار عينات المصابيح من كل من مجموعة التحكم (0 ملمول/لتر) ومجموعة المعالجة (2.0 ملمول/لتر) لمزيد من التحليلات النسخية والتمثيلية، مع ثلاث تكرارات لكل حالة. كانت هذه المقاربة الشاملة تهدف إلى توضيح آثار السيلينيوم على الملفات الفسيولوجية والبيوكيميائية لـ L. lancifolium.

النتائج

يقدم قسم “النتائج” من ورقة البحث النتائج المستمدة من التجارب والتحليلات التي تم إجراؤها. تشمل النتائج الرئيسية تحديد علاقات كبيرة بين المتغيرات المدروسة، مع تحليل إحصائي يشير إلى قيمة p أقل من 0.05، مما يشير إلى دليل قوي ضد الفرضية الصفرية. بالإضافة إلى ذلك، تظهر النتائج اتجاهًا واضحًا في البيانات، مما يدعم الفرضيات المقترحة ويشير إلى أن التدخل كان له تأثير قابل للقياس على النتائج.

علاوة على ذلك، توضح التمثيلات الرسومية، مثل المخططات والرسوم البيانية، العلاقات والاتجاهات الملاحظة، مما يوفر تأكيدًا بصريًا للنتائج الكمية. يختتم القسم بمناقشة تداعيات هذه النتائج، مع التأكيد على أهميتها في المجال الأوسع للدراسة والتطبيقات المحتملة في الممارسة. بشكل عام، تدعم النتائج أهداف البحث وتساهم برؤى قيمة في المعرفة الحالية.

المناقشة

في هذه الدراسة، تم التحقيق في آثار السيلينيوم (Se) على الخصائص الفسيولوجية والبيوكيميائية لـ *L. lancifolium*، مما يكشف عن تأثير مزدوج للسيلينيوم على نمو النبات وجودة التغذية. زاد تركيز معتدل من 2.0 ملمول/لتر من السيلينيوم بشكل كبير من ارتفاع النبات، ووزن المصباح، ومحتوى البروتين القابل للذوبان، حيث زاد الأخير بنسبة 72% مقارنةً بالتحكم. ومع ذلك، فإن التركيزات الأعلى (≥4.0 ملمول/لتر) منعت النمو وتسببت في الاصفرار، مما يشير إلى أنه بينما يمكن أن يعزز السيلينيوم النمو وتراكم العناصر الغذائية، فإن المستويات الزائدة تكون ضارة. كما وجدت الدراسة أن *L. lancifolium* حولت السيلينيوم غير العضوي بشكل فعال إلى سيلينيوم عضوي، حيث وصل محتوى السيلينيوم العضوي إلى 3.9 ملغ/كغ من الوزن الجاف، مما يشير إلى إمكانيته كمصدر غذائي لمعالجة نقص السيلينيوم لدى البشر.

علاوة على ذلك، كشفت التحليلات النسخية والتمثيلية عن تغييرات كبيرة في التعبير الجيني وملفات المستقلبات استجابةً لمعالجة السيلينيوم. تم تحديد ما مجموعه 4,389 جينًا معبرًا عنه بشكل مختلف (DEGs)، مع زيادة ملحوظة في المسارات الأيضية المتعلقة بعمليات الأحماض الأمينية والدهون الفوسفورية. سلط دمج البيانات النسخية والتمثيلية الضوء على الشبكات التنظيمية المعنية في تخليق العناصر الغذائية، لا سيما في المسارات الخاصة بالدهون الفوسفورية، والأحماض الأمينية، والسكريات القابلة للذوبان. تؤكد هذه النتائج على إمكانيات *L. lancifolium* كغذاء وظيفي غني بالسيلينيوم العضوي، مما قد يعزز قيمته الغذائية بينما يعالج نقص السيلينيوم في الأنظمة الغذائية البشرية.

Journal: Frontiers in Plant Science, Volume: 15
DOI: https://doi.org/10.3389/fpls.2024.1399152
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38828223
Publication Date: 2024-05-17
Author(s): Xiaogang Jiang et al.
Primary Topic: Selenium in Biological Systems

Overview

The research investigates the effects of varying selenium (Se) concentrations on the growth and nutritional quality of *Lilium lancifolium Thunb* (L. lancifolium), a significant medicinal and edible plant. Through transcriptomic, metabolomic, and biochemical analyses, the study identifies that total and organic Se content in the bulbs increases with higher Se dosages (0-8.0 mmol/L). Notably, a low Se concentration of 2.0 mmol/L enhances growth and metabolite accumulation, while higher concentrations (≥4.0 mmol/L) exhibit inhibitory effects. Key findings include significant increases in bulb weight, amino acids, soluble sugars, and soluble proteins at the optimal Se level.

The integrated analysis reveals that the upregulation of genes associated with glycerophospholipid (GPD1, GPAT, ADPRM), amino acid (glyA, asnB, nadB, thrA, SAT), and soluble sugar metabolism (SUS, bgl B, BAM, SGA1) under Se treatment contributes to improved growth and nutritional quality. This study establishes 2.0 mmol/L Se as the optimal concentration for enhancing the nutritional profile of L. lancifolium and elucidates the molecular mechanisms involved in the Se-induced responses, thereby providing valuable insights into the biofortification potential of this plant.

Introduction

The introduction of the research paper discusses the perennial herbaceous species Lilium lancifolium Thunb, native to East Asia, which has applications in both medicine and food. The edible bulbs of L. lancifolium are rich in essential nutrients, including sucrose, polysaccharides, amino acids, vitamins, and minerals. Selenium (Se), an important trace element, is highlighted for its health benefits in humans and animals, as well as its dual role in plant growth, where moderate concentrations can enhance growth and nutrient content, while excessive amounts can be detrimental.

Despite extensive research on the effects of Se on various plant species, the specific impact of Se on L. lancifolium remains unexplored. The authors propose to investigate this by employing combined transcriptome and metabolome analyses to elucidate the regulatory networks between genes and key metabolites in response to Se treatment. The study aims to assess the morphological, physiological, and quality traits of L. lancifolium under varying Se concentrations, utilizing advanced technologies such as the Illumina NovaSeq 6000 and HPLC-MS/MS. This research is expected to provide valuable insights into the molecular mechanisms by which Se influences the growth and quality of L. lancifolium bulbs.

Methods

In this study, healthy two-year-old L. lancifolium plants were cultivated in plastic pots within a greenhouse environment. Following a 30-day acclimatization period, the plants were treated with varying concentrations of sodium selenite solutions (0, 0.5, 1.0, 2.0, 4.0, or 8.0 mmol/L), with 250 mL of the solution applied to each pot. A second application of the same selenium dosage was administered after 45 days. After a total of 90 days post-transplanting, the plants were harvested for analysis.

The collected samples were evaluated for several biochemical parameters, including chlorophyll content, soluble sugar, soluble protein, selenium concentration, total flavonoids, and alkaloids. Additionally, bulb samples from both the control (0 mmol/L) and the treatment group (2.0 mmol/L) were selected for further transcriptomic and metabolomic analyses, with three replicates for each condition. This comprehensive approach aimed to elucidate the effects of selenium on the physiological and biochemical profiles of L. lancifolium.

Results

The “Results” section of the research paper presents the findings derived from the conducted experiments and analyses. Key outcomes include the identification of significant correlations between the variables studied, with statistical analyses indicating a p-value of less than 0.05, suggesting strong evidence against the null hypothesis. Additionally, the results demonstrate a clear trend in the data, supporting the proposed hypotheses and indicating that the intervention had a measurable impact on the outcomes.

Furthermore, graphical representations, such as plots and charts, illustrate the relationships and trends observed, providing a visual confirmation of the quantitative results. The section concludes with a discussion of the implications of these findings, emphasizing their relevance to the broader field of study and potential applications in practice. Overall, the results substantiate the research objectives and contribute valuable insights to the existing body of knowledge.

Discussion

In this study, the effects of selenium (Se) on the physiological and biochemical traits of *L. lancifolium* were investigated, revealing a dual impact of Se on plant growth and nutritional quality. A moderate concentration of 2.0 mmol/L Se significantly enhanced plant height, bulb weight, and soluble protein content, with the latter increasing by 72% compared to the control. However, higher concentrations (≥4.0 mmol/L) inhibited growth and caused chlorosis, indicating that while Se can promote growth and nutrient accumulation, excessive levels are detrimental. The study also found that *L. lancifolium* effectively transformed inorganic Se into organic Se, with the organic Se content reaching 3.9 mg/kg dry weight, suggesting its potential as a dietary source to address selenium deficiencies in humans.

Furthermore, the transcriptomic and metabolomic analyses revealed significant changes in gene expression and metabolite profiles in response to Se treatment. A total of 4,389 differentially expressed genes (DEGs) were identified, with notable enrichment in metabolic pathways related to amino acid and glycerophospholipid metabolism. The integration of transcriptomic and metabolomic data highlighted the regulatory networks involved in nutrient biosynthesis, particularly in the pathways for glycerophospholipids, amino acids, and soluble sugars. These findings underscore the potential of *L. lancifolium* as a functional food enriched with organic Se, which may enhance its nutritional value while addressing selenium deficiency in human diets.

شارك: