الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: معلوماتية حيوية

حاملو جين APOE ε4 يشاركون تغييرات بروتينية مرتبطة بالمناعة عبر الأمراض التنكسية العصبية
APOE ε4 carriers share immune-related proteomic changes across neurodegenerative diseases

تسلط الأبحاث الضوء على متغير الجين APOE ε4 كأهم عامل خطر وراثي لمرض الزهايمر المتأخر (AD) ودوره المحتمل في أمراض التنكس العصبي الأخرى. باستخدام مجموعة بيانات Global Neurodegeneration Proteomics Consortium SomaScan، التي تشمل 1,346 عينة من السائل الدماغي الشوكي (CSF) و9,924 عينة من البلازما، استخدمت الدراسة تقنيات التعلم الآلي لتحديد بصمة بروتينية مشتركة لـ APOE…
انخفاض في Flavonifractor plautii ومنتجه، الفيتوسفينغوزين، يعرض الأفراد ذوي التركيبة الدهنية للبلغم لاضطرابات الأيض
A decrease in Flavonifractor plautii and its product, phytosphingosine, predisposes individuals with phlegm-dampness constitution to metabolic disorders

يتناول هذا القسم من ورقة البحث العلاقة بين تركيبة البلغم والرطوبة (PDC) كما هو محدد في الطب الصيني التقليدي (TCM) واضطرابات الأيض. يبرز أن الأفراد الذين يعانون من PDC يظهرون تغييرات في التعبير الجيني المرتبط باضطرابات الأيض، حتى عندما تبدو مؤشراتهم الأيضية طبيعية. تحدد الدراسة ميكروبات الأمعاء المتميزة وملفات المستقلبات في الأفراد الذين يعانون من…
دكتور بايو رايت 2.0: دردشة آلية مدعومة بنموذج لغوي كبير لتحليل البروتيوميات الوظيفية للسرطان على نطاق واسع
DrBioRight 2.0: an LLM-powered bioinformatics chatbot for large-scale cancer functional proteomics analysis

تستعرض هذه الفقرة التقدم في البروتيوميات الوظيفية التي تهدف إلى تعزيز فهمنا لآليات السرطان وتسهيل تحديد العلامات الحيوية والأهداف العلاجية الجديدة. أنشأ المؤلفون موردًا شاملاً يستخدم مصفوفات البروتين العكسية (RPPAs)، والتي تدمج البيانات من حوالي 8,000 عينة من المرضى من أطلس جينوم السرطان (TCGA) وحوالي 900 عينة من موسوعة خطوط خلايا السرطان (CCLE). تحتوي مجموعة…
تقنية اختيار ميزات جماعية تكيفية للتنبؤ بالسكري غير المعتمدة على نموذج
An adaptive ensemble feature selection technique for model-agnostic diabetes prediction

تقدم ورقة البحث AdaptDiab، وهي طريقة مبتكرة لاختيار الميزات من خلال مجموعة تهدف إلى تعزيز توقع مرض السكري من خلال نهج غير مرتبط بالنموذج. من خلال دمج تقنيات اختيار الميزات المختلفة، بما في ذلك طرق التصفية مثل ANOVA F-score، ودرجة فيشر، وحدود التباين، يحدد AdaptDiab بشكل فعال مجموعة فرعية مثالية من الميزات. تستخدم الطريقة دالة…
طفرات جينات السائق لسرطان الفم في الاضطرابات الفموية المحتملة الخبيثة: الأهمية السريرية والآثار التشخيصية
Oral cancer driver gene mutations in oral potentially malignant disorders: clinical significance and diagnostic implications

تدرس الدراسة وجود طفرات جينات محركات سرطان الفم (ODGMs) في الاضطرابات المحتملة الخبيثة للفم (OPMDs)، وتحديداً الحزاز الفموي (OLP) واللويحات البيضاء الفموية (OLK)، لتقييم آثارها السريرية وإمكانية التحول الخبيث. تم تحليل 41 حالة OPMD باستخدام تسلسل الجيل التالي الذي يستهدف الجينات الرئيسية المرتبطة بتسرطن الفم، بما في ذلك TP53 وHRAS وPIK3CA. تم تحديد ODGMs في…
استكشاف تعقيدات تفاعلات بكتيريا الجذور المحفزة لنمو النباتات: مراجعة أوميكس
Exploring the intricacies of plant growth promoting rhizobacteria interactions: an omics review

يوفر هذا القسم نظرة عامة على دور بكتيريا تعزيز نمو النباتات (PGPR) في منطقة الجذور، مع التأكيد على أهميتها في تحفيز نمو النباتات وتعزيز مقاومتها لمختلف الضغوط. يسلط الضوء على التفاعلات التعاونية بين أنواع PGPR، والتي تعتبر حاسمة لوظائفها المثلى. على الرغم من الأهمية المعترف بها لهذه التفاعلات، لا تزال الآليات والديناميات، لا سيما على…
الرابط بين صرير الأسنان أثناء النوم والإجهاد التأكسدي استنادًا إلى دراسة بوليسومنوغرافية
The link between sleep bruxism and oxidative stress based on a polysomnographic study

تبحث الدراسة في العلاقة بين الإجهاد التأكسدي وصريف الأسنان أثناء النوم (SB)، وهو نشاط عضلي مضغ مرتبط بالنوم شائع. شملت الدراسة 80 بالغًا خضعوا لتخطيط النوم الكامل طوال الليل وتحليل الدم اللاحق لتقييم حالة مضادات الأكسدة. تم تصنيف المشاركين بناءً على مؤشر حلقة صريف الأسنان (BEI)، مع تحديد قيم القطع المثلى من خلال منحنيات خصائص…
اختلال توازن ميكروبيوم الفم: العلاقة بين الميكروبات وحدوث تسوس الأسنان
Imbalance of oral microbiome homeostasis: the relationship between microbiota and the occurrence of dental caries

تبحث الدراسة في دور اختلال الميكروبيوم الفموي في بدء تسوس الأسنان، وخاصة في سياق نظام غذائي يحتوي على السكروز. يُعتبر *Streptococcus mutans*، الذي يُنظر إليه تقليديًا على أنه العامل المسبب الرئيسي في تسوس الأسنان، الآن مفهوماً ضمن إطار أوسع من عدم التوازن الميكروبي. استخدمت الدراسة تسلسل جين 16S rRNA لتحليل اللعاب واللويحات السنية من مجموعتين…
تشخيص فعال لمرض السكري باستخدام طريقة تجميع محسّنة
Efficient diagnosis of diabetes mellitus using an improved ensemble method

تتناول الأبحاث القضية الملحة لمرض السكري، وخاصة في الدول النامية، حيث تساهم بشكل كبير في معدلات الوفيات. على الرغم من إمكانيات التعلم الآلي (ML) للكشف المبكر والعلاج، إلا أن الدراسات السابقة واجهت صعوبات في دقة التصنيف المنخفضة بسبب تحديات مثل الإفراط في التخصيص وضوضاء البيانات. تعزز هذه الدراسة دقة التصنيف من خلال استخدام تقنيات التعلم…
تحليل البروتوجينوم المتكامل يحدد الإندوتروفين المشتق من COL6A3 كوسيط لتأثير السمنة على مرض الشريان التاجي
Integrative proteogenomic analysis identifies COL6A3-derived endotrophin as a mediator of the effect of obesity on coronary artery disease

تبحث هذه الدراسة في الوسطاء للعلاقة بين السمنة وأمراض القلب الأيضية، وتحديداً مرض الشريان التاجي، والسكتة الدماغية، ومرض السكري من النوع 2. باستخدام مزيج من التعديل العشوائي المندلي على مستوى البروتينات، والتوافق المكاني، وعلم الجينوميات، وتسلسل RNA أحادي الخلية، تحدد الدراسة خمسة وسطاء رئيسيين، مع التركيز بشكل خاص على الكولاجين من النوع VI α3 (COL6A3).…