الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
زراعة الميكروبات المستهدفة الموجهة بواسطة الميتاجينوم
2025 | المؤلف: Jeremy Armetta وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على أنواع مختلفة مصنفة تحت ترتيب Clostridiales، وبشكل خاص تلك التي تم تحديدها على أنها “أنواع غير مؤكدة”، مما يشير إلى عدم اليقين في تصنيفها الضريبي. تسرد عدة إدخالات مع بيانات وصفية مرتبطة، بما في ذلك الإشارات إلى سلالات أو أنواع محددة، مثل “mO TU v25 125 16” و “mO…
-
تحديد التفاعلات الخاصة بالبروتيوفورم لاستهداف الأدوية في بيئة الإشارات الخلوية الأصلية
2025 | المؤلف: Corinne A. Lutomski وآخرون | المجلة: Nature Chemistry | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، بحث المؤلفون في الإطلاق المنضبط للبروتينات من الحويصلات الدهنية باستخدام الفوتونات تحت الحمراء داخل مطياف الكتلة. لقد لاحظوا طيف الكتلة المميز عند قوى إخراج ليزر مختلفة، مع ثلاثة توزيعات بروتينية سائدة عند القدرة المنخفضة (~2.4 واط) وظهور توزيع حالة شحنة جديدة عند القدرة الأعلى (~4.8 واط). تشير هذه القمة الأخيرة، التي تم…
-
سوليو: منصة سحابية لمراقبة مسببات الأمراض الجينومية في الوقت الحقيقي
2025 | المؤلف: Timo Saratto وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على التحديات والتقدم في المراقبة الجينومية، لا سيما في سياق الصحة العامة والجراثيم المرتبطة بالرعاية الصحية. على الرغم من التحسينات في المعلوماتية الحيوية، لا تزال القضايا المتعلقة بالبنية التحتية والخبرة والأمان قائمة، مما يعيق المراقبة المستمرة التي تدمج بيانات التسلسل الجديدة مع التحليلات الحالية. علاوة على ذلك، تفشل العديد من…
-
تخصيص الإنزيمات الصناعية لاستقرار الحرارة وتطور النشاط من خلال استراتيجية iCASE المعتمدة على التعلم الآلي
2025 | المؤلف: Nan Zheng وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يتم تقديم الأهمية الإحصائية لمختلف الطفرات من خلال قيم p الخاصة بها، مما يشير إلى احتمال ملاحظة النتائج تحت فرضية العدم. ومن الجدير بالذكر أن الطفرات مثل H47L و M49E و M49L تظهر قيم p ذات دلالة إحصائية عالية (على سبيل المثال، $p < 0.001$)، مما يشير إلى ارتباط قوي مع النمط…
-
UniAMP: تعزيز توقع AMP باستخدام الشبكات العصبية العميقة مع المعلومات المستنتجة للببتيدات
2025 | المؤلف: Zixin Chen وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تتناول ورقة البحث القضية الملحة لمقاومة المضادات الحيوية (AMR) في العدوى البكتيرية، مع التركيز بشكل خاص على البكتيريا سالبة الجرام مثل Enterobacteriaceae المقاومة للكاربينيم (CRE) وأعضاء مجموعة ESKAPE. يقدم المؤلفون إطار عمل جديد يسمى UniAMP، مصمم للتنبؤ المنهجي بالببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs) كحل محتمل لمكافحة AMR، الذي تفاقم بسبب سوء استخدام المضادات الحيوية في كل…
-
بروتيوميات اللعاب والميتابروتيوميات تحدد بصمات جزيئية وتصنيفية مميزة لمرض السكري من النوع الثاني
2025 | المؤلف: Diana Samodova وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تستقصي هذه الدراسة البروتينات اللعابية والبروتينات الميتابروتينية لدى الأفراد الذين تم تشخيصهم حديثًا بمرض السكري من النوع الثاني (T2D) مقارنةً بالأشخاص الأصحاء. باستخدام تقنيات مطيافية الكتلة المتقدمة (MS)، حدد الباحثون أكثر من 4500 بروتين بشري وبكتيري من عينات اللعاب لـ 15 مريضًا بمرض السكري من النوع الثاني و15 شخصًا صحيًا متطابقين في العمر ومؤشر كتلة…
-
إعداد وتطبيق بروتين اندماج متعدد الأبيتوبي بناءً على المعلوماتية الحيوية وتقنية البروتيوميات المعتمدة على العلامات الكتلية المتسلسلة
2025 | المؤلف: Qi Wu وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تتناول ورقة البحث التحديات في تشخيص داء البروسيلات، وهو مرض حيواني مهم، بسبب قيود الطرق الحالية مثل الفحوصات المصلية وزراعة البكتيريا. لتعزيز دقة التشخيص، استخدم المؤلفون تحليل البروتينات باستخدام علامة الكتلة المتسلسلة (TMT) على كل من سلالة بروسيلة أبورتوس البرية DT21 وسلالة اللقاح B. abortus A19. حدد هذا التحليل 152 بروتينًا بمستويات تعبير عالية في…
-
أثر الفحص السكاني لمتلازمة لينش: رؤى من بيانات “الجميع منا”
2025 | المؤلف: Jiheum Park وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأمراض والطب الشرعي (Pathology and Forensic Medicine)قسم “الطرق” في ورقة البحث يحدد تصميم التجارب والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في سؤال البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب مختبرية محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة تأثيراتها على النتائج ذات الأهمية. شملت جمع البيانات استخدام أدوات موحدة لضمان…
-
نظام CRISPR-Cas9 يحمي E. coli من اكتساب جينات مقاومة المضادات الحيوية
2025 | المؤلف: Danna Lee وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)مقاومة المضادات الحيوية (AMR) هي قضية صحية عالمية حرجة، مما يستلزم تطوير استراتيجيات علاجية جديدة للعدوى البكتيرية. تعتبر البروبيوتيك المهندسة، وخاصة تلك التي تستخدم تقنية CRISPR-Cas9، طريقًا واعدًا لمواجهة هذا التحدي. تصف الدراسة المذكورة في هذا القسم إنشاء نظام CRISPR-Cas9 مصمم لمنع نقل الجينات الأفقي (HGT) لجينات AMR في البكتيريا. من خلال استهداف ثمانية جينات…
-
التقييم السريري للكشف عن بصمة الإيبي باستخدام تسلسل القراءة الطويلة في الاضطرابات التنموية
2025 | المؤلف: Mathilde Geysens وآخرون | المجلة: Genome Medicine | المجال: علم الوراثة (Genetics)تبحث الدراسة في إمكانية تسلسل الجينوم الكامل طويل القراءة (lrWGS) لاكتشاف التغيرات الميثيلية الخاصة بالأمراض على مستوى الجينوم، والمعروفة باسم الإبيساينتشر، في الاضطرابات التنموية (DD). شملت الدراسة تسلسل الجينوم الكامل باستخدام تقنية النانو بورا لـ 40 ضابطًا و20 مريضًا تم تأكيد أو الاشتباه في ارتباطهم بالإبيساينتشر، تغطي 13 مرضًا متميزًا. كشفت النتائج أن أنماط الميثيلوم…