الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوم
-
DFAST_QC: أداة تقييم الجودة والتعرف الضريبي للجينومات بدائية النواة
2025 | المؤلف: Mohamed Elmanzalawi وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)توضح هذه القسم تطوير وقدرات DFAST_QC، وهي أداة جديدة مصممة لتعزيز التصنيف الضريبي ومراقبة الجودة للجينومات بدائية النواة. يعد التصنيف الضريبي الدقيق أمرًا حيويًا للبحث البيولوجي، ومع ذلك، غالبًا ما تتطلب أدوات التحقق من الجينوم الحالية موارد حاسوبية واسعة ووقتًا طويلاً، مما يحد من إمكانية الوصول إليها للمشاريع واسعة النطاق. تتناول DFAST_QC هذه التحديات من…
-
التجميع من جديد لجينوم الميتوكوندريا لنبات الجذور العرقية وتحديد نوعين من تكوينات إعادة التركيب المتماثلة الناتجة عن تسلسلات متكررة
2025 | المؤلف: Guang Yu Zhou وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)في هذه الدراسة، تم تجميع وتوضيح الجينومات الميتوكوندرية والكلوروبلاستية لنبات *Glycyrrhiza glabra*، وهو نبات طبي بارز، بنجاح باستخدام تقنيات تسلسل القراءة القصيرة (Illumina) والطويلة (Oxford Nanopore). وُجد أن الجينوم الميتوكوندري له هيكل دائري يمتد على 421,293 قاعدة مع محتوى GC يبلغ 45.1%، ويحتوي على 56 جينًا موضحًا. كانت إحدى النتائج المهمة هي تحديد 514 تسلسلًا…
-
معايير للمراقبة الجينومية للصحة الواحدة لبكتيريا الإشريكية القولونية من أستراليا
2025 | المؤلف: A. Watt وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الغدد الصماء (Endocrinology)تسلط هذه الفقرة من ورقة البحث الضوء على الدور الحاسم للجينوميات في فهم انتقال مسببات الأمراض ضمن إطار الصحة الواحدة، مع التركيز بشكل خاص على الإشريكية القولونية. جمعت الدراسة مجموعة بيانات شاملة تتكون من 5,471 تسلسل جينومي للإشريكية القولونية من مصادر متنوعة في أستراليا، بما في ذلك البشر، والحيوانات البرية والماشية، والحيوانات الأليفة، والعينات البيئية،…
-
هندسة عقلانية للنوكليازات ذات المناعة الدنيا للعلاج الجيني
2025 | المؤلف: Rumya Raghavan وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “الطرق” يوضح الأساليب التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يتناول تصميم التجارب، بما في ذلك اختيار المواد، إعداد العينات، والبروتوكولات المحددة المتبعة لضمان القابلية للتكرار. كما يتم وصف الأساليب الإحصائية المستخدمة في تحليل البيانات، مع تسليط الضوء على التقنيات المستخدمة لتقييم الأهمية والمعايير المستخدمة لتفسير النتائج. بالإضافة إلى ذلك، قد يتضمن القسم معلومات عن النماذج…
-
الجينوم العملاق لزهرة الزنبق يوفر رؤى حول التهجين في زهور الزنبق المزروعة
2025 | المؤلف: Yuwei Liang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة شاملة على الأبحاث الجينومية التي أجريت على نوعين من زهور الزنبق ذات الأهمية الاقتصادية: *Lilium sargentiae* و *Gloriosa superba*. تم تسلسل الجينومات المرجعية لهذه الأنواع، مما كشف عن حجم جينومي كبير يبلغ 35.66 غيغابايت لـ *L. sargentiae* و 5.09 غيغابايت لـ *G. superba*. من الجدير بالذكر أن الجينوم الكبير لـ *L.…
-
اندماج الريتروترانس بوزون المتمركز حول المركز عبر الكروماتين CENH3 في الأرابيدوبسيس
2025 | المؤلف: Sayuri Tsukahara وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علوم النبات (Plant Science)تسلط الأبحاث الضوء على الطبيعة الديناميكية للسنتروميرات عبر الكائنات الحية المختلفة، مع التركيز بشكل خاص على دور تسلسلات التكرار السريعة التطور، مثل التكرارات المتتالية (TRs) والعناصر القابلة للتحويل (TEs)، في هيكل ووظيفة السنترومير. تكشف الدراسة أن العناصر القابلة للتحويل العكسية، وبالتحديد عناصر التكرار الطويل (LTR) Ty3 وTy1، تظهر دورانًا سريعًا داخل TRs السنتروميرية لأنواع الأرابيدوبسيس.…
-
الجينومات البشرية الحديثة المبكرة تحدد توقيت اختلاط النياندرتال
2024 | المؤلف: Arev Pelin Sümer وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الأنثروبولوجيا (Anthropology)تشير القسم المعنون “نظرة عامة” إلى أن المخطوطة ستخضع لعملية تحرير وتدقيق قبل نشرها النهائي. ويؤكد على أن هذه المرحلة الإنتاجية قد تكشف عن أخطاء قد تؤثر على محتوى الورقة. بالإضافة إلى ذلك، يشير إلى أن جميع الإخلاءات القانونية المرتبطة بالنشر ستظل سارية طوال هذه العملية. وهذا يبرز أهمية الدقة وإمكانية التعديلات قبل إصدار الورقة…
-
تقييم نماذج اللغة الكبيرة لاكتشاف وظيفة مجموعة الجينات
2024 | المؤلف: Mengzhou Hu وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يقوم المؤلفون بتقييم فعالية خمسة نماذج لغوية كبيرة (LLMs) في تحديد الوظائف الشائعة ضمن مجموعات الجينات، وهو جانب حاسم من علم الجينوم الوظيفي الذي غالبًا ما يعاني من قواعد بيانات غير مكتملة لوظائف الجينات. تركز الدراسة على مجموعات الجينات المنسقة من علم الجينات، كاشفة أن GPT-4 يقترح بنجاح وظائف تتماشى مع الأسماء…
-
تطبيق تسلسل الجيل التالي الميتاجينومي في تشخيص الأمراض المعدية
2024 | المؤلف: Yu Zhao وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الكيمياء الحيوية السريرية (Clinical Biochemistry)تسلسل الجيل التالي الميتاجينومي (mNGS) يحدث ثورة في تشخيص الأمراض المعدية من خلال تمكين الكشف غير المتحيز عن وتوصيف الجينومات الميكروبية مباشرة من العينات السريرية. تستعرض هذه المراجعة المبادئ الأساسية، وسير العمل في التسلسل، والمنصات المرتبطة بـ mNGS، مع التأكيد على منهجية التسلسل العشوائي التي تسمح بالتعرف المتزامن على البكتيريا والفيروسات والفطريات والطفيليات دون معرفة…
-
سلالات متعددة من بروسيلة المالطية تدفع وباء البروسيلات البشرية في مقاطعة شانشي، الصين: دليل من تحليل تسلسل الجينوم الكامل
2024 | المؤلف: Cuihong An وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس الدراسة الديناميات الوبائية لحمى مالطا البشرية الناتجة عن *Brucella melitensis* في مقاطعة شانشي، الصين، باستخدام التصنيف الحيوي التقليدي وتسلسل الجينوم الكامل للبوليمورفisms أحادية النوكليوتيد (SNPs) لتحليل 189 سلالة. كشفت النتائج أن 189 سلالة تم تصنيفها على أنها *B. melitensis*، مع 14 في البيوفار 1، و145 في البيوفار 3، و30 كمتغيرات، موزعة عبر جميع المدن…