الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تسلسل الحمض النووي
-
تطبيق تسلسل الجيل التالي الميتاجينومي في تشخيص الأمراض المعدية
2024 | المؤلف: Yu Zhao وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الكيمياء الحيوية السريرية (Clinical Biochemistry)تسلسل الجيل التالي الميتاجينومي (mNGS) يحدث ثورة في تشخيص الأمراض المعدية من خلال تمكين الكشف غير المتحيز عن وتوصيف الجينومات الميكروبية مباشرة من العينات السريرية. تستعرض هذه المراجعة المبادئ الأساسية، وسير العمل في التسلسل، والمنصات المرتبطة بـ mNGS، مع التأكيد على منهجية التسلسل العشوائي التي تسمح بالتعرف المتزامن على البكتيريا والفيروسات والفطريات والطفيليات دون معرفة…
-
أداء اختبار تسلسل الجيل التالي الميتاجينومي السريري على مدى سبع سنوات لتشخيص التهابات الجهاز العصبي المركزي
2024 | المؤلف: Patrick Benoit وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأوبئة (Epidemiology)قسم “الطرق” يوضح تصميم التجارب والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، حيث تم استخدام التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة تأثيراتها على النتائج المعنية. تم جمع البيانات باستخدام أدوات موحدة لضمان الموثوقية والصلاحية. علاوة على ذلك، شملت التحليلات…
-
تحليل تسلسل الجينوم الكامل لأنواع البروسيلة المعزولة من المجترات في مناطق مختلفة من تركيا
2024 | المؤلف: Songül Ötkün وآخرون | المجلة: BMC Infectious Diseases | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تستكشف هذه الدراسة التنوع الجيني لعزلات بروسلا من مناطق مختلفة في تركيا، مع التركيز على آثارها على الصحة العامة والطب البيطري. تم تحديد 23 عزلة، بما في ذلك 21 من المجترات و2 من البشر، وتم تصنيفها باستخدام طرق الميكروبيولوجيا التقليدية، تلتها تسلسل الجينوم الكامل. أظهر التحليل النشوي القائم على تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) أن…
-
قراءة متعددة الممرات لجزيء واحد عبر المسام النانوية لسلاسل البروتين الطويلة
2024 | المؤلف: Keisuke Motone وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الهندسة الطبية الحيوية (Biomedical Engineering)تقدم هذه الدراسة طريقة جديدة لتسلسل جزيئات البروتين الفردية في شكلها الأصلي الكامل باستخدام مجموعة حساسات نانوية تجارية. تعتمد الطريقة على ClpX unfoldase لنقل البروتينات عبر مسام CsgG، مما يكشف أن ClpX ينقل الركائز بخطوات من اثنين من الأحماض الأمينية. يسمح هذا الآلية بالكشف عن أحماض أمينية فردية في خيوط بروتين اصطناعية يمكن أن تكون…
-
vSNP: خط أنابيب SNP لتوليد مصفوفات SNP الشفافة وأشجار النشوء والتطور من مجموعات بيانات تسلسل الجينوم الكامل
2024 | المؤلف: Jessica Hicks وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تعتبر أنبوب vSNP أداة متخصصة تم تطويرها على مدار العقد الماضي لمعالجة التحديات الفريدة التي تواجهها المختبرات التشخيصية أثناء التحقيقات في تفشي الأمراض. تسهل تسلسل الجينوم الكامل بسرعة وتضمن التحقق من دقة التسلسل والتحقق منها عبر مختلف مسببات الأمراض. ينتج الأنبوب مخرجات سهلة الاستخدام، بما في ذلك مصفوفات SNP والأشجار النشوء والتطور، والتي تم تصميمها…
-
تمكين التعلم المنقول من تحديد أنواع متعددة من تعديلات RNA باستخدام تسلسل RNA المباشر عبر المسام النانوية
2024 | المؤلف: You Wu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه القسم تطوير TandemMod، وهو إطار عمل للتعلم العميق مصمم لتحديد تعديلات RNA المتعددة من بيانات تسلسل RNA المباشر باستخدام تقنية النانو (DRS). على الرغم من إمكانيات DRS في تحليل تعديلات RNA، فإن الكشف المتزامن عن تعديلات مختلفة في عينة واحدة كان تحديًا. يعالج TandemMod هذه المشكلة من خلال استخدام مجموعات بيانات epitranscriptome المستخلصة…
-
تقنيات تسلسل الحمض النووي عبر المسام وتطبيقاتها في بروتيوميات الجزيئات الفردية
2024 | المؤلف: Adam Dorey وآخرون | المجلة: Nature Chemistry | المجال: الهندسة الطبية الحيوية (Biomedical Engineering)تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في تسلسل الأحماض النووية باستخدام تقنية النانوثقب، مع تسليط الضوء على مزاياها مثل سرعة القراءة العالية، الدقة العالية، التكلفة المنخفضة، وقابلية النقل. تتيح هذه الطريقة الخالية من العلامات تسلسل الجزيئات الفردية، مما يمثل إنجازًا كبيرًا في هذا المجال. علاوة على ذلك، يتم مناقشة إمكانيات النانوثقوب لتسلسل البوليببتيدات، مع…
-
تطبيق تسلسل الجيل التالي لتحديد مسببات الأمراض المختلفة
2024 | المؤلف: Aljuboori M. Nafea وآخرون | المجلة: Frontiers in Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على أهمية تسلسل الجيل التالي (NGS) في الكشف عن مسببات الأمراض وتحديدها، مع التركيز على مزاياه مقارنة بالطرق التقليدية مثل مطيافية الكتلة والاختبارات الكيميائية الحيوية. يتم تسليط الضوء على NGS كتقنية عالية الإنتاجية قادرة على توليد بيانات تسلسل واسعة، مما يسهل تحديد مجموعة واسعة من مسببات الأمراض، بما في ذلك…
-
فك الميتاجينوميات من خلال تسلسل القراءة الطويلة: مراجعة شاملة
2024 | المؤلف: Chan Kyung Kim وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في أبحاث المجتمع الميكروبي، مع تسليط الضوء بشكل خاص على الانتقال من تسلسل 16S rRNA وميتاجينوميات الشوتغن إلى تسلسل القراءة الطويلة (LRS). توفر LRS، التي تسهلها بشكل أساسي تقنيات من Pacific Biotechnologies (PacBio) وOxford Nanopore Technologies (ONT)، مزايا كبيرة مقارنة بتسلسل القراءة القصيرة (SRS) من خلال إنتاج قراءات…