الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
إعادة اكتشاف حجب نظام البلعميات أحادية النواة لتوصيل الأدوية باستخدام الجزيئات النانوية
2024 | المؤلف: Ivan V. Zelepukin وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: المواد الحيوية (Biomaterials)تحدد قسم النقاش في ورقة البحث تطور واستراتيجيات مختلفة لحجب نظام البلعميات الأحادية النواة (MPS)، والذي تم تصنيفه تاريخياً بناءً على تأثيره على الجهاز المناعي. تضمنت الطرق الأولية استنفاد البلعميات بالكامل باستخدام مركبات سامة مثل كلودرانات الليبوسوم وكلوريد الغادولينيوم، مما أدى إلى حجب طويل الأمد لوظيفة MPS. وقد تحولت الأساليب الأكثر حداثة نحو استراتيجيات أقل…
-
منصة جالاكسي للتحليلات البيانية القابلة للوصول، القابلة للتكرار، والتعاونية: تحديث 2024
2024 | المؤلف: Linelle Ann L Abueg وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: نظم المعلومات والإدارة (Information Systems and Management)يسهل مشروع جالاكسي، المتاح عالميًا من خلال خدمات مجانية الاستخدام، البحث المدفوع من قبل المستخدمين من خلال توفير منصة مستقرة مع أدوات ومجموعات بيانات متنوعة، بالإضافة إلى التدريب والدعم لتحليل البيانات المعقدة. لقد حسنت التحسينات الأخيرة، التي تم توجيهها بواسطة مبادئ تصميم تجربة المستخدم (UXD)، من إمكانية الوصول واكتشاف الأدوات، لا سيما من خلال نطاقات…
-
كتالوج عميق للتنوع الجيني للبروتينات في 983,578 فردًا
2024 | المؤلف: Kathie Sun وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه الدراسة كتالوجًا شاملاً لمتغيرات البروتين البشري المشفرة المشتقة من تسلسل الإكسوم لـ 983,578 فردًا، تشمل مجموعة متنوعة من الأنساب. تُعرف هذه المجموعة البيانية باسم مركز جينيات ريجينيرون مليون إكسوم (RGC-ME)، وتتضمن أكثر من 10.4 مليون متغير من نوع الميسنس و1.1 مليون متغير متوقع لفقدان الوظيفة (pLOF). من الجدير بالذكر أن الدراسة تحدد متغيرات…
-
التقدمات الحديثة والتحديات الحالية في كروماتوغرافيا التفاعل المحب للماء لتحليل الأوليغونوكليوتيدات العلاجية
2024 | المؤلف: Honorine Lardeux وآخرون | المجلة: TrAC Trends in Analytical Chemistry | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش المراجعة التقدمات الكبيرة في استخدام كروماتوغرافيا التفاعل المحب للماء المرتبطة بمطيافية الكتلة (HILIC-MS) لتحليل الأوليغونيوكليوتيدات العلاجية (ONs). منذ عام 2018، وافقت إدارة الغذاء والدواء الأمريكية على 14 دواءً من الأدوية الأوليغونيوكليوتيدية، مما يبرز الحاجة الملحة لطرق تحليلية قوية. بينما تظل كروماتوغرافيا السائل العكسي مع تزاوج الأيونات (IP-RPLC) هي المعيار الذهبي، ظهرت HILIC كبديل قابل…
-
تمكين التعلم المنقول من تحديد أنواع متعددة من تعديلات RNA باستخدام تسلسل RNA المباشر عبر المسام النانوية
2024 | المؤلف: You Wu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه القسم تطوير TandemMod، وهو إطار عمل للتعلم العميق مصمم لتحديد تعديلات RNA المتعددة من بيانات تسلسل RNA المباشر باستخدام تقنية النانو (DRS). على الرغم من إمكانيات DRS في تحليل تعديلات RNA، فإن الكشف المتزامن عن تعديلات مختلفة في عينة واحدة كان تحديًا. يعالج TandemMod هذه المشكلة من خلال استخدام مجموعات بيانات epitranscriptome المستخلصة…
-
تقدم البحث في الشكل والآلية لموت الخلايا المبرمج
2024 | المؤلف: Yao Chen وآخرون | المجلة: Cell Death and Disease | المجال: علم الأوبئة (Epidemiology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على موت الخلايا المبرمج (PCD)، مع تسليط الضوء على أهميته في نمو وتطور وشيخوخة وعمليات الأمراض في الكائنات الحية. يتميز PCD بأنه شكل من أشكال موت الخلايا يتم التحكم فيه وراثيًا، وهو مستقل ومنظم، ويتم تنظيمه من خلال تنشيط وتعبير جينات معينة. كشفت التقدمات الحديثة في البحث عن آليات متنوعة…
-
تعلم الآلة البيانية لتحليل متعدد الأوميات المتكامل
2024 | المؤلف: Nektarios A. Valous وآخرون | المجلة: British Journal of Cancer | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على دور تجارب المولتي أوميكس في البحث الطبي الحيوي، مع التأكيد على فائدتها في تحديد العلامات الحيوية لاستجابة العلاج وتوضيح الآليات الخلوية. يسلط الضوء على تطوير طرق دمج البيانات المختلفة، لا سيما تمثيل الرسم البياني غير المتجانس لبيانات المولتي أوميكس، مما يعزز القدرة على تمييز الأنماط المعقدة للتحليلات التنبؤية والاستكشافية.…
-
مراجعة لعملية اللاكتات-لاكتيل في الأورام: إمكانياتها في العلاج المناعي
2024 | المؤلف: Jinhui Zha وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: علم المناعة (Immunology)تتناول ورقة البحث الفهم المتطور لحمض اللاكتيك، الذي كان يُنظر إليه تقليديًا كمنتج ثانوي للتمثيل الغذائي، كلاعب مهم في بيولوجيا السرطان. تبرز الدور الذي يلعبه اللاكتات في نمو الأورام، والهجرة، والغزو، وخاصة من خلال التعديلات ما بعد الترجمة المعروفة باسم اللاكتيل، والتي تتضمن ارتباط مجموعات اللاكتويل بمخلفات الليسين في البروتينات. هذه التعديل حاسم لتنظيم التعبير…
-
السنسورين من العصر الأردوفيشي الأدنى يكشف عن تنوع وتطور اليوديكليسرات المبكر
2024 | المؤلف: Lorenzo Lustri وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المستحاثات (Paleontology)يتناول قسم ورقة البحث مجموعة Euchelicerata، التي تشمل مجموعة متنوعة من المفصليات مثل سرطان البحر الحدوة، والعقارب، والعناكب، بالإضافة إلى مجموعات منقرضة مثل اليوربتيريد. على الرغم من التقدم في فهم العلاقات بين مجموعة euchelicerates من خلال اكتشافات الحفريات، لا تزال أصولها وتطورها المبكر غير واضحة، خاصة بسبب السجل الأحفوري المحدود لمجموعات أخواتها الكامبرية والسنجابيات. يقدم…
-
تحسين توقع البقاء غير المعلمي باستخدام نموذج كوكس، وغابة البقاء العشوائية، وشبكة الأعصاب العميقة DeepHit
2024 | المؤلف: Naseem Asghar وآخرون | المجلة: BMC Medical Informatics and Decision Making | المجال: الإحصاء والاحتمالات (Statistics and Probability)في هذه الدراسة، يتناول المؤلفون التحديات التي تطرحها بيانات المعلومات الحيوية عالية الأبعاد في تحليل البقاء، لا سيما في سياق بيانات الوقت حتى الحدث مثل الوقت حتى الفشل أو الموت. يقترحون نهجًا هجينًا جديدًا لاختيار الميزات يدمج بين أربع تقنيات لاختيار المتغيرات – LASSO، RSF-vs، SCAD، وCoxBoost – لتعزيز دقة توقعات البقاء. من خلال استخدام…