الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: معلوماتية حيوية
-
المشهد البروتيني الحاسوبي للميكروبات والمضيف في سرطان الفم يكشف عن مسارات وظيفية واستقلابية رئيسية بين فوسوبكتيريوم نوكليتوم وتقدم السرطان
2025 | المؤلف: Camila Paz Muñoz-Grez وآخرون | المجلة: International Journal of Oral Science | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تستقصي هذه الدراسة دور مسببات الأمراض اللثوية، وتحديداً *Fusobacterium nucleatum* (F. nucleatum)، في تقدم سرطان الخلايا الحرشفية الفموية (OSCC). باستخدام البروتيوميات الحاسوبية، قام الباحثون بتحليل السركتوم لعينات خزعة من مرضى OSCC وأشخاص أصحاء من خلال مطيافية الكتلة. وجدوا زيادة ملحوظة في تنظيم البروتينات المضيفة المتعلقة باستجابة الليببوليسكاريد (LPS)، وهجرة/التصاق الخلايا، واستقلاب الأحماض الأمينية في بروتيوم…
-
مستشعر حمى الحليب الحساس للأطومولار باستخدام هياكل استشعار متعددة مطبوعة بتقنية ثلاثية الأبعاد
2025 | المؤلف: Matin Ataei Kachouei وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الهندسة الحيوية (Bioengineering)قسم “الطرق” في ورقة البحث يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في سؤال البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب مختبرية محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لملاحظة آثارها على النتائج ذات الاهتمام. شمل جمع البيانات استخدام أدوات وبروتوكولات موحدة…
-
اكتشاف الأدوية وتوقع الآلية باستخدام الشبكات العصبية البيانية القابلة للتفسير
2025 | المؤلف: Conghao Wang وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم البحث إطار عمل XGDP (توقع استجابة الأدوية القائم على الرسوم البيانية القابلة للتفسير)، الذي يعزز توقع استجابة الأدوية مع توضيح آليات العمل بين الأدوية وأهدافها. تركز الطرق التقليدية بشكل أساسي على التنبؤ بدقة بمستويات استجابة الأدوية ولكنها غالبًا ما تتجاهل آليات التفاعل الأساسية. يستخدم XGDP الرسوم البيانية الجزيئية لتمثيل الأدوية، مع الحفاظ على المعلومات…
-
التغيرات البروتينية عند العلاج بالسيماغلوتيد لدى الأفراد الذين يعانون من السمنة
2025 | المؤلف: Lasse Maretty وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث تأثير السيماغلوتيد، وهو دواء للسمنة ومرض السكري من النوع 2، على البروتينات الدائرة، استنادًا إلى عينات مصل تم جمعها من تجربتين سريريتين من المرحلة الثالثة: STEP 1 (n = 1,311) و STEP 2 (n = 645). وجدت الدراسة أن السيماغلوتيد يؤثر على مجموعة واسعة من العمليات البيولوجية، بما في…
-
تعزز البلعميات SPP1+ تقدم سرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والعنق من خلال إفراز TNF-α وIL-1β
2024 | المؤلف: Chun Liu وآخرون | المجلة: Journal of Experimental & Clinical Cancer Research | المجال: علم المناعة (Immunology)تدرس الدراسة دور ماكروفاجات SPP1 + (SPP1 + Macs) في تقدم سرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والعنق (HNSCC)، وهو مرض يتميز ببيئة ميكروية معقدة للورم (TIME). باستخدام تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq) على أنسجة ورمية وطبيعية من خمسة مرضى مصابين بـ HNSCC، حدد الباحثون ماكروفاجات SPP1 + الخاصة بالورم، والتي وُجد أنها ترتبط إيجابياً بتوقعات…
-
البروبيوتيك والبارابروبيوتيك في تربية الأحياء المائية: استراتيجية مستدامة لتعزيز نمو الأسماك وصحتها والوقاية من الأمراض – مراجعة
2024 | المؤلف: Muhammad Fachri وآخرون | المجلة: Frontiers in Marine Science | المجال: علم المناعة (Immunology)تستعرض هذه المراجعة الاهتمام المتزايد في البروبيوتيك والبارابروبيوتيك كبدائل للمضادات الحيوية في تربية الأحياء المائية، مع التأكيد على قدرتها على تعزيز صحة الأسماك والوقاية من الأمراض في ظل توسع الصناعة. لقد أظهرت البروبيوتيك، بما في ذلك سلالات مثل *Arthrobacter*، *Bacillus*، *Lactobacillus*، *Bifidobacterium*، و*Clostridium*، فوائد في تعزيز النمو، مقاومة الأمراض، تقليل الإجهاد، وإدارة جودة المياه. ومع…
-
نموذج متعدد المقاييس للمراقبة المناعية في النقائل الدقيقة يوفر رؤى حول التوائم الرقمية لمرضى السرطان
2024 | المؤلف: Heber L. Rocha وآخرون | المجلة: npj Systems Biology and Applications | المجال: النمذجة والمحاكاة (Modeling and Simulation)تبحث الدراسة في الدور الحاسم للمراقبة المناعية في انتشار السرطان، الذي يعد سببًا رئيسيًا للوفيات بين المرضى. لاستكشاف هذه الظاهرة، طور المؤلفون نموذجًا رياضيًا متعدد المقاييس يحاكي التفاعلات بين الجهاز المناعي وتقدم الميكروانتقالات في الأنسجة الظهارية. باستخدام الحوسبة عالية الإنتاجية، أنشأوا أكثر من 100,000 مسار افتراضي للمرضى، مما نجح في التقاط مجموعة من النتائج من…
-
تفسر فسيولوجيا الأمعاء والبيئة التباينات في تركيب الميكروبيوم المعوي البشري والتمثيل الغذائي
2024 | المؤلف: Nicola Procházková وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستكشف الدراسة العلاقة المعقدة بين فسيولوجيا الأمعاء والعوامل البيئية وتركيب وعمليات الأيض في الميكروبيوم المعوي البشري. أُجريت كدراسة رصدية على مدى تسعة أيام مع 61 بالغًا صحيًا، استخدمت الأبحاث أساليب متعددة الأوميات لتقييم التغيرات اليومية في الميكروبيوم المعوي وعمليات الأيض. تشير النتائج الرئيسية إلى تقلبات كبيرة داخل الأفراد في تركيب الميكروبيوم مرتبطة بتغيرات في رطوبة…
-
الفسيولوجيا، التعبير الجيني، والسلوك كمؤشرات محتملة للإجهاد التأكسدي في الخنازير الصغيرة
2024 | المؤلف: Raúl David Guevara وآخرون | المجلة: BMC Veterinary Research | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)هدفت الدراسة إلى إنشاء نموذج خنزير للتحقيق في الإجهاد التأكسدي مع تقليل الآثار السلبية على رفاهية الخنازير الصغيرة. تم إجراء أربعة تجارب (A، B، C، وD) باستخدام جرعات مختلفة من الليبوساكاريد (LPS) لتحفيز تحدي مناعي وتقييم استجابة الإجهاد التأكسدي في الخنازير الصغيرة من أعمار مختلفة. تضمنت التجارب إعطاء جرعات LPS تبلغ 25 ميكروغرام/كغ من وزن…
-
تحديد الأهداف الجزيئية لهيبيريكوم بيرفوراتوم في الدم لاضطراب الاكتئاب الشديد: دراسة دوائية باستخدام التعلم الآلي
2024 | المؤلف: Zewen Xu وآخرون | المجلة: Chinese Medicine | المجال: الطب النفسي البيولوجي (Biological Psychiatry)تدرس هذه الدراسة الآليات الجزيئية التي تستهدف بها Hypericum perforatum (HP)، وهو عشب تقليدي معروف بتأثيراته المضادة للاكتئاب، الاضطراب الاكتئابي الكبير (MDD). باستخدام تحليل التعبير التفاضلي وتحليل شبكة التعبير الجيني المشترك الموزون (WGCNA) على بيانات تعبير mRNA في الدم من مرضى MDD والأشخاص الأصحاء، حدد الباحثون 933 هدفًا محتملاً لـ MDD. من خلال تقاطع هذه…