الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: معلوماتية حيوية
-
العلاج الجيني AAV لضمور العضلات دوشين: التجربة العشوائية المرحلة 3 EMBARK
2024 | المؤلف: Jerry R. Mendell وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تجربة EMBARK المرحلة 3 العشوائية حققت في فعالية وسلامة الديلاندستروجن موكسابارفوفك، وهو علاج جيني لضمور العضلات الدوشيني (DMD)، في الذكور المتنقلين الذين تتراوح أعمارهم بين 4 إلى 8 سنوات. تم توزيع 125 مشاركًا عشوائيًا لتلقي إما جرعة واحدة عن طريق الوريد من الديلاندستروجن موكسابارفوفك (1.33 × 10¹⁴ جينوم ناقل/كغ؛ ن = 63) أو دواء وهمي…
-
GeneCompass: فك شفرة الآليات التنظيمية الجينية العالمية من خلال نموذج أساسي مستند إلى المعرفة عبر الأنواع
2024 | المؤلف: Xiaodong Yang وآخرون | المجلة: Cell Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على تطوير GeneCompass، وهو نموذج أساسي عبر الأنواع مصمم لتعزيز فهمنا لآليات تنظيم الجينات من خلال دمج البيانات من أكثر من 120 مليون ترانسكريبتوم أحادي الخلية من البشر والفئران. غالبًا ما تركز طرق البحث التقليدية على الكائنات الحية النموذجية الفردية، مما يحد من الرؤى حول الآليات التنظيمية العالمية. ومع ذلك، فإن التقدم…
-
نموذج الذكاء الاصطناعي AlphaFold لعلم الأحياء الجزيئي واكتشاف الأدوية: تحقيق معلوماتي مدفوع بالتعلم الآلي
2024 | المؤلف: Song‐Bin Guo وآخرون | المجلة: Molecular Cancer | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)لقد حول نموذج AlphaFold بشكل كبير البحث البيولوجي؛ ومع ذلك، فإن الكمية الهائلة من البيانات غير المهيكلة في هذا المجال تتطلب مزيدًا من التحليل لفهم مشهد البحث بشكل شامل وإبلاغ الاستفسارات المستقبلية. تستخدم هذه التحليل العلمي أساليب المعلومات المدفوعة بالتعلم الآلي لتحديد مجموعات البحث الرئيسية، وتتبع الاتجاهات الناشئة، وتسليط الضوء على المجالات غير المستكشفة. تشير…
-
الروابط بين الميكروبيوم والمواد الأيضية تدفع ديناميات غازات الدفيئة عبر تدرج ذوبان التربة المتجمدة
2024 | المؤلف: Viviana Freire-Zapata وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علوم الغلاف الجوي (Atmospheric Science)يقدم القسم خريطة حرارية توضح مستويات التعبير، المقاسة في النسخ لكل مليون (TPM)، للجينومات المجمعة من الميتاجينوم (MAGs) المرتبطة بشبكات الميكروبات والمواد الأيضية عبر ثلاثة موائل متميزة: بالسا، مستنقع، وفين. تم تنظيم الخريطة الحرارية في فئات وظيفية، كل منها تشمل وظائف متنوعة تتعلق بالـ MAGs ضمن الموائل المعنية. تساعد هذه التصويرية في فهم التنوع الوظيفي…
-
تأثير مستخلصات جذور المحاصيل الغطائية على مسارات الوظائف الميكروبية في التربة الزراعية
2024 | المؤلف: Valerie Seitz وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علوم النبات (Plant Science)تبحث هذه الدراسة في دور المحاصيل الغلافية في تعزيز وظيفة الميكروبيوم التربة من خلال إفراز الجذور للهرمونات النباتية. تم تحليل المحاصيل الغلافية، مثل *Sorghum bicolor* و*Vicia villosa* و*Brassica napus* و*Secale cereal*، لملفاتها الكيميائية المميزة لإفراز الجذور وتأثيراتها على المجتمعات الميكروبية في التربة الزراعية. استخدمت الدراسة مزيجًا من الأساليب الميتابولومية والميتاجينومية المتحللة جينومياً لتتبع استجابات الميكروبات…
-
تأثير توفر الفوسفور على الميكروبيوم التربة المثبط للأمراض من خلال تفاعلات النبات والميكروبات
2024 | المؤلف: Yifan Cao وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علوم النبات (Plant Science)تبحث هذه الدراسة في دور توفر الفوسفور في إدارة الأمراض المنقولة بالتربة، وخاصة الذبول البكتيري الناجم عن *Ralstonia solanacearum*، في محاصيل الطماطم. أظهر تجربة ميدانية استمرت ست سنوات أن الفوسفور ضروري للتحكم في هذا المرض، حيث أكدت التجارب اللاحقة في البيوت الزجاجية أن مستويات الفوسفور الكافية تعزز القدرة على قمع المرض لميكروبيوم الجذور، دون التأثير…
-
خلايا جذعية مضادة للبكتيريا من الرباط اللثوي تعزز تجديد اللثة وتنظم الميكروبيوم الفموي
2024 | المؤلف: Jiayi You وآخرون | المجلة: Stem Cell Research & Therapy | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تدرس الدراسة دور خلايا جذعية الرباط اللثوي (PDLSCs) في تعزيز تجديد الأنسجة اللثوية وخصائصها المحتملة المضادة للبكتيريا، والتي قد تؤثر على الميكروبات الفموية. تم عزل خلايا PDLSCs البشرية من الأسنان المستخرجة وتم حقنها في الفئران التي تعاني من عيوب في الفينسترا اللثوية، مع استخدام حقن محلول ملحي كتحكم. تم تحليل الميكروبات الفموية باستخدام تسلسل 16S…
-
استكشاف إمكانيات البيبيرين في علاج متلازمة المبيض المتعدد الكيسات من خلال الربط الحاسوبي
2024 | المؤلف: Rahul Francis وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تبحث الدراسة في إمكانيات البيبيرين، وهو قلويد من الفلفل الأسود، كعامل علاجي لمتلازمة المبيض المتعدد الكيسات (PCOS)، وهي حالة معقدة تتميز باضطرابات هرمونية واستقلابية لدى النساء في سن الإنجاب. من خلال دراسات الربط الحاسوبية، قام المؤلفون بتحليل تفاعلات ارتباط البيبيرين مع الأهداف الجزيئية الرئيسية المعنية في مسببات PCOS، مع التركيز بشكل خاص على فرط الأندروجينية…
-
ملف ميتابولومي للشيخوخة البيولوجية في 250,341 فردًا من بنك المملكة المتحدة الحيوي
2024 | المؤلف: Shiyu Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في الملف المعقد للميتابولوم المرتبط بالشيخوخة من خلال تحليل 325 علامة حيوية للتصوير بالرنين المغناطيسي النووي (NMR) من مجموعة كبيرة تضم 250,341 مشاركًا من بنك المملكة المتحدة. تحدد الدراسة 54 علامة حيوية مرتبطة بالشيخوخة مرتبطة بالوفيات من جميع الأسباب وتستخدم دراسات الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) باستخدام بيانات تسلسل الجينوم الكامل من 95,372…
-
منصة فحص افتراضية معززة بالذكاء الاصطناعي لاكتشاف الأدوية
2024 | المؤلف: Guangfeng Zhou وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)يقدم القسم نظرة عامة على طريقة جديدة تعتمد على الهيكل لفحص المركبات الافتراضية، RosettaVS، التي تم تطويرها لتعزيز دقة التنبؤ بوضعيات الربط وقوى الارتباط في اكتشاف الأدوية المبكر. تعالج هذه الطريقة قيود الأساليب الحالية من خلال نمذجة مرونة المستقبل بشكل فعال، مما يساهم في أدائها المتفوق على معايير مختلفة. يقدم المؤلفون منصة مفتوحة المصدر تستفيد…
