الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: مكتبات الجزيئات الصغيرة
-
التحلل المستهدف لبروتينات سطح الخلية من خلال الإندوسيتوز الذي ت triggered بواسطة مركبات الببتيد القابل للاختراق الخلوي والجزيئات الصغيرة Targeted degradation of cell surface proteins through endocytosis triggered by cell-penetrating peptide-small molecule conjugates
2026 | المؤلف: Wanyi He وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم إجراء التحليل باستخدام الكروماتوغرافيا السائلة عالية الأداء العكسية (RP-HPLC) باستخدام نظام Agilent 1260 Infinity المزود بكاشف UV من نوع مصفوفة الصمامات وعمود Agilent Poroshell 120 EC-C18 (4.6 مم × 100 مم، 2.7 ميكرومتر). بدأ تدرج RP-HPLC عند 10% من المذيب B (أسيتونيتريل، CH₃CN) وتم زيادته إلى 100% على مدى 20 دقيقة،…
-
تحديد لقمات مستقبل الأدينوزين A2A النانوية باستخدام التعلم المعزز وتصميم الأدوية القائم على الهيكل Identification of nanomolar adenosine A2A receptor ligands using reinforcement learning and structure-based drug design
2026 | المؤلف: Morgan C. Thomas وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تناقش هذه القسم دمج نماذج اللغة الكيميائية التوليدية (CLMs) مع تصميم الأدوية القائم على الهيكل (SBDD) لتسهيل اكتشاف جزيئات صغيرة جديدة من هياكل البروتين، دون معرفة مسبقة بكيمياء الجزيئات. باستخدام نهج تحسين تسلق التل المعزز، نجح البحث في معالجة عدة أهداف، بما في ذلك تعزيز التوافق بين البروتين والجزيء. تظهر الجزيئات الناتجة de novo كيمياء…
-
تحسين بايزي مجمع من خلال تعظيم احتمال تضمين الأمثل Batched Bayesian Optimization by Maximizing the Probability of Including the Optimum
2026 | المؤلف: Jenna C. Fromer وآخرون | المجلة: Journal of Chemical Information and Modeling | المجال: علم الإدارة وبحوث العمليات (Management Science and Operations Research)في هذا القسم، يقدم المؤلفون استراتيجية جديدة للاكتساب لتحسين بايزي (BO) تهدف إلى تعزيز تصميم الجزيئات من خلال اختيار المركبات عالية الأداء بكفاءة من مكتبات كيميائية واسعة. الطريقة المقترحة، التي تُسمى qPO (احتمالية الأمثل المتعددة النقاط)، تركز على زيادة احتمال احتواء الدفعة المختارة على الأمثل الحقيقي. هذه الطريقة تبسط عملية التحسين من خلال التعبير عن…
-
ضبط المرونة لمكتبات المواد الكيميائية المشفرة بالحمض النووي ذات العرض المزدوج يسهل اكتشاف الروابط الببتيدية الدائرية Flexibility-tuning of dual-display DNA-encoded chemical libraries facilitates cyclic peptide ligand discovery
2026 | المؤلف: Dimitar D. Petrov وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تُعتبر الببتيدات الدائرية فئة واعدة من العلاجات بسبب مزاياها الفريدة مقارنةً بالجزيئات الصغيرة التقليدية والجزيئات الكبيرة. ومع ذلك، لا يزال إنشاء مكتبة متنوعة من الببتيدات الدائرية يمثل تحديًا. توفر المكتبات الكيميائية المشفرة بالحمض النووي (DELs) حلاً محتملاً لتحقيق التنوع الكيميائي، ومع ذلك، تكافح طرق DEL القياسية لاستكشاف التنوع التوافقي للببتيدات الدائرية بشكل فعال. بالمقابل، تسمح…
-
تحدي CACHE #3: استهداف ماكرودومين Nsp3 لفيروس SARS-CoV-2
2026 | المؤلف: Oleksandra Herasymenko وآخرون | المجلة: Journal of Chemical Information and Modeling | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)ركز التقييم النقدي الثالث لتجارب اكتشاف الأدوية الحاسوبية (CACHE) على تحديد جزيئات جديدة تستهدف الماكرودومين 1 من SARS-CoV-2 Nsp3، وهو هدف مهم لعلاج الفيروسات التاجية. ساهم ما مجموعه ثلاثة وعشرون مجموعة بحثية في التحدي، مما أسفر عن 1,739 مرشحًا لجزيئات، مع كون أكثر من 85% منها جديدة كيميائيًا. ومع ذلك، كانت أكثر النتائج الواعدة التي…
-
جزيء صغير من ligand VDAC يثبط ERAD ويحفز موت خلايا السرطان الانتقائي من خلال تعطيل توازن الكالسيوم
2026 | المؤلف: Wenjing Yan وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الخلوي (Cell Biology)تناقش هذه القسم دور التحلل المرتبط بالشبكة الإندوبلازمية (ERAD) كآلية حيوية للتحكم في جودة البروتينات التي تؤثر أيضًا على استقلاب الدهون وتوازن الكالسيوم. يرتبط عدم تنظيم ERAD واستجابة البروتين غير المطوي بعدة أمراض، بما في ذلك السرطان واضطرابات الأعصاب التنكسية. تحدد الأبحاث معدلات جزيئية صغيرة لـ ERAD من خلال الفحص عالي المحتوى، واكتشاف NCATS-SM0225، وهو…
-
اكتشاف مثبطات صغيرة قائمة على الثياديازول لتفاعل سبايك SARS-CoV-2-ACE2 من خلال التنبؤ الحاسوبي المتكامل والتحقق التجريبي
2026 | المؤلف: Zakkia Gul وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الأمراض المعدية (Infectious Diseases)في هذه الدراسة، تم تحديد خمسة جزيئات صغيرة مشتقة من هياكل 1،3،4-ثياديازول كمثبطات محتملة لتفاعل بروتين السنبلة SARS-CoV-2 مع مستقبل ACE2 البشري، وهي خطوة حاسمة لدخول الفيروس. كشفت الفحص الافتراضي القائم على الهيكل والتحقق التجريبي أن جميع المركبات ترتبط داخل مجال ارتباط المستقبل لبروتين السنبلة، مما يعطل فعليًا ارتباط ACE2. أظهرت محاكاة الديناميات الجزيئية ارتباطًا…
-
التعلم العميق التوليدي لتصميم أدوية جديدة – ملحمة الفضاء الكيميائي
2025 | المؤلف: Rıza Özçelik وآخرون | المجلة: Journal of Chemical Information and Modeling | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم هذه القسم نظرة عامة على دور التعلم العميق التوليدي في تصميم الأدوية، مع تسليط الضوء على إمكانيته في التنقل عبر الفضاء الكيميائي الواسع وإنشاء جزيئات جديدة بخصائص بيولوجية محددة. يتناول التحديات التي تواجه توليد الجزيئات الصغيرة، وتقييمها، وتحديد أولوياتها، وخاصة الحاجة إلى التوفيق بين المعلومات المتضاربة بشأن التنوع الكيميائي، وقابلية التركيب، والنشاط البيولوجي. يؤكد…
-
إذابة الجسيمات الناتجة عن الإجهاد بواسطة تعديل الأكسدة والاختزال تفيد نماذج ALS
2025 | المؤلف: Hiroyuki Uechi وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: طب الأعصاب (Neurology)تناقش هذه الفقرة دور بروتينات حبيبات الإجهاد في الأمراض التنكسية العصبية، وخاصة التصلب الجانبي الضموري (ALS)، وتبرز إمكانيات الليبواميد كعامل علاجي. تحدد الأبحاث الليبواميد كجزيء صغير يمنع بشكل فعال تكثف بروتينات حبيبات الإجهاد في السيتوبلازم، والذي يرتبط بمرض الباثولوجيا. يكشف تحليل البروتينات الحرارية أن الليبواميد يثبت البروتينات التي تحتوي على مجالات غير مرتبة بشكل جوهري،…
-
الاستهداف الدوائي لـ BMAL1 يعدل المسارات اليومية والمناعية
2025 | المؤلف: Hua Pu وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: الأنظمة الصماء والذاتية (Endocrine and Autonomic Systems)تركز البحث على بروتينات الهيليكس-حلقة-هيليكس الأساسية PER-ARNT-SIM (bHLH-PAS) BMAL1 وCLOCK، التي تشكل عامل النسخ الرئيسي الذي ينظم الإيقاعات اليومية. يقدم الدراسة جزيءًا صغيرًا، وهو المنظم اليومي الأساسي (CCM)، المصمم لاستهداف مجال PASB من BMAL1. يتسبب هذا التفاعل في توسيع المجال، مما يؤدي إلى تغييرات شكلية تعدل وظيفة BMAL1 كعامل نسخ. تؤكد التحليلات الكيميائية والهيكلية انتقائية…