الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
اختيار الميزات المدفوع بواسطة SGA وتصنيف الغابات العشوائية لتحسين تشخيص سرطان الثدي: دراسة مقارنة
2025 | المؤلف: Abrar Yaqoob وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الذكاء الاصطناعي (Artificial Intelligence)في هذه الدراسة، يقدم المؤلفون منهجية جديدة لتصنيف سرطان الثدي تجمع بين خوارزمية تحسين النورس (SGA) لاختيار الميزات ومصنف الغابة العشوائية (RF). يمثل هذا النهج أول تطبيق لـ SGA في اختيار الجينات لتشخيص سرطان الثدي، مما يمكّن من استكشاف منهجي لمساحة الميزات لتحديد أكثر مجموعات الجينات معلوماتية. لا تعزز دمج SGA مع RF دقة التصنيف…
-
الصيدلة الشبكية التكاملي، والترانسكريبتوميات، والبروتيوميات تكشف عن الأساس المادي وآلية صيغة شين تشينغ وي تشانغ ضد سرطان المعدة
2025 | المؤلف: Yi Wang وآخرون | المجلة: Chinese Medicine | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تبحث الدراسة في فعالية وآليات عمل صيغة شين تشينغ وي تشانغ (SQWCF)، وهي وصفة عشبية تقليدية لسرطان المعدة (GC)، المعروف بتشخيصه السيء وخيارات العلاج المحدودة. باستخدام نموذج ورم زراعة تحت الجلد لسرطان المعدة البشري، استخدمت الدراسة نهجًا متعدد الجوانب شمل مطيافية الكتلة، وعلم الأدوية الشبكي، وتحليل الأومكس، والمعلوماتية الحيوية لتحديد المكونات الرئيسية والأهداف لـ SQWCF.…
-
تحديد N6-methyladenine باستخدام التعلم العميق ودمج الميزات التمييزية
2025 | المؤلف: Salman Khan وآخرون | المجلة: BMC Medical Genomics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم ورقة البحث Deep-N6mA، وهو نموذج جديد للشبكات العصبية العميقة (DNN) مصمم للتعرف الدقيق على مواقع N6-methyladenine (6 m A) في تسلسلات الحمض النووي، والتي تعتبر حاسمة للتنظيم الجيني والتعبير الجيني. يستخدم النموذج نهج استخراج ميزات هجين يدمج ميزات مختلفة قائمة على التسلسل، بما في ذلك k-mer، وDinucleotide-based Cross Covariance (DCC)، وTrinucleotide-based Auto Covariance (TAC)،…
-
تسلسل الأمبليكون الحساس والوحدوي لتنوع ومقاومة المتصورة المنجلية لأغراض البحث والصحة العامة
2025 | المؤلف: Andrés Aranda-Díaz وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الصحة العامة والبيئية وصحة العمل (Public Health, Environmental and Occupational Health)تقدم البحث MAD 4 HatTeR، وهو لوحة تسلسل مستهدف مصممة للتحليل الشامل لجينوم المتصورة المنجلية. يهدف هذا الأداة إلى تعزيز علم الأوبئة التقليدي للملاريا من خلال توفير بيانات جينومية قابلة للتنفيذ. يركز MAD 4 HatTeR على 165 موضعًا متنوعًا، بما في ذلك الميكروهبلوتايب المتعدد الأليلات وعلامات رئيسية لمقاومة الأدوية والتشخيص، بينما يكون قادرًا أيضًا على…
-
التقدم في نمذجة الديناميكا الدوائية القائمة على الفسيولوجيا (PBPK) وفائدتها التنظيمية لدعم تطوير وتوحيد المنتجات الدوائية الفموية
2025 | المؤلف: Yi‐Hsien Cheng وآخرون | المجلة: Pharmaceutical Research | المجال: العلوم الصيدلانية (Pharmaceutical Science)التقرير يوضح إجراءات ورشة عمل عقدتها إدارة الغذاء والدواء الأمريكية (FDA) ومركز الأبحاث على الأدوية المعقدة (CRCG) في 12 أكتوبر 2023، تركزت على التقدم في نمذجة الديناميكا الدوائية القائمة على الفسيولوجيا (PBPK) لتطوير المنتجات الدوائية الفموية. النقاشات الرئيسية سلطت الضوء على التقدم والتحديات في نمذجة امتصاص PBPK لكل من المنتجات الدوائية الفموية التي تعمل محليًا…
-
فحص RNAi للجينات غير الموصوفة يحدد أهداف واعدة قابلة للعلاج في شستوسوما يابونيكوم
2025 | المؤلف: Yuxiang Xie وآخرون | المجلة: PLoS Pathogens | المجال: علم الطفيليات (Parasitology)داء البلهارسيا، وهو مرض استوائي مهمل يؤثر على أكثر من 250 مليون فرد على مستوى العالم، يتم علاجه بشكل أساسي باستخدام البرازكوانتيل، مما يثير القلق بشأن مقاومة الأدوية. يحتوي جينوم *Schistosoma japonicum* على حوالي 11% من الجينات غير المعروفة (UGs)، والتي غالبًا ما يتم تجاهلها على الرغم من أهميتها المحتملة كأهداف للأدوية. قامت هذه الدراسة…
-
أصول مستقلة وتوقيعات اختيار غير متوازية لمقاومة التريكلا بندازول في فاسيولا هيباتيكا
2025 | المؤلف: Young‐Jun Choi وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تريكلابندازول (TCBZ) هو العلاج الرئيسي للفاسيولازيس، وهو مرض حيواني المنشأ مهم ينتج عن الطفيلي فاسيولا هيباتيكا. إن ظهور مقاومة واسعة النطاق لـ TCBZ (TCBZ-R) في الماشية وزيادة الإصابات البشرية المقاومة يتطلب فهمًا أعمق للآليات الجينية الكامنة وراء هذه المقاومة. في هذه الدراسة، تم تسلسل الجينومات لـ 99 دودة فلوكة حساسة لـ TCBZ (TCBZ-S) و210 دودة…
-
زراعة كبد خنزير معدل جينيًا إلى إنسان
2025 | المؤلف: Kaishan Tao وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الجراحة (Surgery)قسم “الطرق” في ورقة البحث يحدد التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. يوضح عملية اختيار العينة، بما في ذلك معايير الإدراج والاستبعاد، فضلاً عن الخصائص الديموغرافية للمشاركين. استخدمت الدراسة مزيجًا من الطرق الكمية والنوعية، بما في ذلك الاستطلاعات والمقابلات، لجمع بيانات شاملة. تم إجراء التحليلات الإحصائية باستخدام برامج مناسبة، مع إيلاء اهتمام…
-
النمذجة الأيضية تكشف عن تراجع التفاعلات الأيضية المرتبطة بالشيخوخة بين المضيف والميكروبيوم في الفئران
2025 | المؤلف: Lena Best وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في التفاعل بين الشيخوخة والميكروبيوم المعوي، باستخدام الميتاجينوميات، والترانسكريبتوميات، والميتابولوميات من الفئران المسنّة جنبًا إلى جنب مع النمذجة الأيضية. تعيد الدراسة بناء نماذج أيضية متكاملة للميكروبات المضيفة والمعوية، كاشفة عن اعتماد معقد لعملية الأيض المضيف على كل من التفاعلات الميكروبية المعروفة والجديدة. من الجدير بالذكر أن الميكروبيوم المتقدم في السن يظهر انخفاضًا كبيرًا…
-
البكتيريا المنقولة عبر البذور تحفز تجميع الميكروبيوم الجذري للقمح من خلال تقسيم الفضاء البيئي والتيسير
2025 | المؤلف: Daniel Garrido‐Sanz وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علوم النبات (Plant Science)في هذه الدراسة، شمل التصميم التجريبي استخدام تربة ضخمة من مرج سويسري مجاور لحقل قمح لإنشاء ميكروكوزم للتحقيق في المجتمعات الميكروبية. حصل الباحثون على غسيل التربة، الذي احتوى على تعليق ميكروبي، واستخراج تربة معقم ومصفى لتوفير المغذيات الدقيقة القابلة للذوبان والجزيئات العضوية. تم إدخال هذه المكونات في أنابيب زجاجية معقمة مليئة بمصفوفة التربة (0.5-4 مم…