الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: وظيفة (علم الأحياء)
-
ينظم PD-1 وظيفة المناعة المضادة للورم للبلاعم من خلال مسار إشارة JAK2-STAT3 في بيئة الورم لسرطان القولون
2025 | المؤلف: Han Jiang وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: علم المناعة (Immunology)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في دور تعبير بروتين الموت المبرمج 1 (PD-1) على البلعميات المرتبطة بالورم (TAMs) داخل بيئة الورم الدقيقة (TME) وتأثيراته على تقدم الورم. من المعروف أن TAMs تساهم في خلق بيئة مثبطة للمناعة، وعلى الرغم من أن PD-1 يُعرف بشكل أساسي بدوره على خلايا T، تشير الأدلة الناشئة إلى تعبيره أيضًا…
-
تحليل مدعوم بالتعلم العميق لتتبع الجسيمات الفردية من أجل الارتباط الآلي بين الانتشار والوظيفة
2025 | المؤلف: Jacob Kæstel‐Hansen وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: الفيزياء الحيوية (Biophysics)يقدم هذا القسم نظرة عامة على إطار عمل جديد للتعلم العميق، DeepSPT، مصمم لتحليل الانتشار تحت الخلوي في الأنظمة الحية. يتناول هذا الإطار التحديات المرتبطة بالعملية الشاقة لاستخراج المعلومات الوظيفية من انتشار الجزيئات والعضيات على النانو. لقد مكنت التقدمات الأخيرة في المجهر الضوئي من تتبع هذا الانتشار بدقة، لكن التفسير الآلي لا يزال عقبة كبيرة.…
-
PTM-Mamba: نموذج لغة بروتين مدرك للتعديلات ما بعد الترجمة مع كتل Mamba ذات البوابات ثنائية الاتجاه
2025 | المؤلف: Zhenyun Du وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم القسم نظرة عامة على PTM-Mamba، وهو نموذج لغة بروتين جديد (LM) مصمم لدمج التعديلات ما بعد الترجمة (PTMs) في ترميز خصائص البروتين. تعتبر PTMs، مثل الفسفرة واليوبيكويتين، حاسمة لتعزيز تنوع البروتينات ولها تأثير كبير على هيكل البروتين ووظيفته وتفاعلاته. يدمج نموذج PTM-Mamba رموز PTM من خلال كتل Mamba ثنائية الاتجاه ويستخدم آلية بوابة لدمجها…
-
قياس وظيفة الغليمفاتيك: تقييم مجموعة الأدوات
2025 | المؤلف: Koushikk Ayyappan وآخرون | المجلة: Neural Regeneration Research | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)تم تحديد النظام الغليمفاتي كآلية حاسمة لتخليص نفايات الدماغ أثناء النوم، حيث يتحرك السائل الدماغي الشوكي (CSF) من المساحات المحيطة بالشرايين إلى المساحات المحيطة بالأوردة ثم يتم تصريفه إلى اللمفاويات الجافية. تم ربط الاضطرابات في تدفق الغليمفاتي بالاضطرابات العصبية، بما في ذلك مرض الزهايمر وإصابة الدماغ الرضحية، مما يبرز أهمية فهم هيكله ووظيفته. ومع ذلك،…
-
زراعة الميتوكوندريا تنقذ مؤقتًا من التنكس العصبي في المخيخ مما يحسن من وظيفة الميتوكوندريا ويقلل من الميتوفاجي في الفئران
2025 | المؤلف: Shu‐Jiao Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يؤثر عدم وظيفة الميتوكوندريا بشكل كبير على عدم التنسيق المخيخي، وهو عرض رئيسي من أعراض الأمراض التنكسية المخيخية، في خلايا بوركنجي (PCs). تستكشف هذه الدراسة زراعة الميتوكوندريا كاستراتيجية علاجية محتملة للتخفيف من التنكس العصبي المخيخي. باستخدام نموذج حذف جيني مشروط لـ Drp1 في PCs (فئران PCKO)، والتي تتميز بعدم التنسيق التدريجي، لاحظ الباحثون أن حذف…
-
خوارزمية البحث الجاذبي خطوة لتحسين الدوال واختيار الميزات المتزامن – تحسين المعلمات لنموذج STTM
2025 | المؤلف: Chaodong Fan وآخرون | المجلة: Artificial Intelligence Review | المجال: الذكاء الاصطناعي (Artificial Intelligence)تقدم البحث آلة دعم مصفوفة التنسور (STTM)، التي تستفيد من الارتباطات الكامنة في هياكل بيانات التنسور ولكن تواجه تحديات تتعلق بتدريب المعلمات غير الفعال والازدواجية الكبيرة في الميزات. لمعالجة هذه القضايا، يقترح المؤلفون خوارزمية البحث الجاذبي الخطوي (SGSA) التي تهدف إلى تعزيز اختيار الميزات المتزامن وتحسين المعلمات لـ STTM. تستخدم SGSA هيكل سكان مزدوج جديد،…
-
علاقات الهيكل والوظيفة في إزالة المخاط والشعيرات في مجاري الهواء البشرية ومجاري الهواء في الجرذان
2025 | المؤلف: Doris Roth وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: طب الرئة والجهاز التنفسي (Pulmonary and Respiratory Medicine)يعد الإزالة المخاطية الهدبية (MCC) آلية دفاع أساسية في مجاري الهواء البشرية، وهي ضرورية للحماية من مسببات الأمراض والجزيئات المستنشقة. ترتبط الإخفاقات في هذه العملية بأمراض الجهاز التنفسي مثل مرض الانسداد الرئوي المزمن (COPD) والربو. لقد سلطت التطورات الأخيرة في علم النسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة الضوء على تعقيد تكوين الخلايا في مجاري الهواء؛…
-
زاد السورافينيب من وظيفة خلايا المثبطات المشتقة من النخاع في سرطان الكبد من خلال تسهيل أكسدة الأحماض الدهنية المعتمدة على PPARα
2025 | المؤلف: Chunxiao Li وآخرون | المجلة: Molecular Cancer | المجال: علم المناعة (Immunology)تبحث الدراسة في دور خلايا كابحة مشتقة من النخاع (MDSCs) في مقاومة السورافينيب، وهو علاج معتمد من إدارة الغذاء والدواء لسرطان الكبد الخلوي المتقدم (HCC). استخدمت الدراسة خطوط خلايا HCC الفأرية المختلفة وMDSCs من خلال تجارب في المختبر وفي الجسم الحي، بما في ذلك نماذج الأورام وتسلسل RNA، لتقييم تأثير السورافينيب على نمو الورم وديناميات…
-
خريطة المشهد البيوكيميائي للروبيسكو
2025 | المؤلف: Noam Prywes وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)روبيسكو، الإنزيم الأساسي لثاني أكسيد الكربون في الغلاف الحيوي، يظهر حركيات بطيئة ويقدم تحديات لتحسينات الهندسة بسبب معاييره البيوكيميائية المعقدة. تقدم هذه الدراسة اختبارًا متوازيًا ضخمًا باستخدام سلالة مهندسة من *Escherichia coli* لاستكشاف منهجي لمشهد التسلسل-الوظيفة للروبيسكو من *Rhodospirillum rubrum*. من خلال تقييم أكثر من 99% من الطفرات أحادية الأحماض الأمينية تحت تركيزات مختلفة من…
-
الهندسة المتسارعة للإنزيمات بواسطة التعبير الخالي من الخلايا الموجه بتعلم الآلة
2025 | المؤلف: Grant M. Landwehr وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم ورقة البحث منصة جديدة موجهة بواسطة التعلم الآلي (ML) تهدف إلى التغلب على قيود هندسة الإنزيم التقليدية، خاصة في توليد مجموعات بيانات واسعة من علاقات التسلسل-الوظيفة للتصميم التنبؤي. تدمج هذه المنصة تجميع الحمض النووي الخالي من الخلايا، والتعبير الجيني الخالي من الخلايا، والاختبارات الوظيفية لرسم خرائط فعالة لمشاهد اللياقة عبر مساحة تسلسل البروتين، مما…