الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: مواقع الربط
-
إنزيم نانو أحادي الذرة مزدوج الموقع يحاكي أكسيد اليورات مع خصوصية عالية للركائز
2024 | المؤلف: Kaiyuan Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: كيمياء المواد (Materials Chemistry)في هذا القسم، يناقش المؤلفون تطور وإمكانات الأكسيدات المستقلة عن الإنزيم المساعد والنانوإنزيمات ذات الذرة الواحدة (SAzymes) في التحفيز الانتقائي. يقدمون إنزيمًا جديدًا مزدوج الموقع للمعادن والروابط، يسمى Ni-DAB، والذي يظهر انتقائية في أكسدة حمض اليوريك (UA). يحاكي Ni-DAB آلية التحفيز المزدوجة لمؤكسد اليورات، مستخدمًا مركز معدن النيكل وذرة كربون في الرابط كمواقع ربط محددة…
-
درجة الحرارة الفسيولوجية تحرك التعرف على ligand TRPM4 وفتح القنوات
2024 | المؤلف: Jinhong Hu وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الأنظمة الحسية (Sensory Systems)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التأثير الكبير لدرجة الحرارة على هيكل ووظيفة الجزيئات الكبيرة، مع التركيز بشكل خاص على قناة الأيونات الحساسة لدرجة الحرارة TRPM4. يبرز المؤلفون أن العديد من الدراسات الفيزيائية الحيوية تُجرى عند درجات حرارة غير فسيولوجية، مما قد يؤدي إلى استنتاجات مضللة بشأن الآليات الجزيئية والتفاعلات الدوائية. من خلال المجهر الإلكتروني…
-
الأساس الهيكلي لتعديل TRPV1 بواسطة الدهون الحيوية الذاتية
2024 | المؤلف: William R. Arnold وآخرون | المجلة: Nature Structural & Molecular Biology | المجال: الأنظمة الحسية (Sensory Systems)تشير هذه الفقرة إلى أن الآلية الأساسية التي تؤثر على الظاهرة المرصودة هي طرد الدهون الفوسفورية (PI) ، بدلاً من تقلبات درجة الحرارة. تشير هذه النتيجة إلى أن ديناميات طرد الدهون تلعب دورًا حاسمًا في العملية قيد التحقيق، مما يبرز أهمية تركيبة الدهون في الوظائف الخلوية أو المتعلقة بالغشاء. قد يوفر الاستكشاف الإضافي لهذه الآلية…
-
إنزيمات RNase T2 وPLD في الحويصلات اللمفاوية تولد بشكل تعاوني جزيئات RNA لتفعيل TLR7
2024 | المؤلف: Marleen Bérouti وآخرون | المجلة: Immunity | المجال: علم المناعة (Immunology)يتناول القسم دور الإكسونوكلياز في إطلاق 2′,3′-سيكلوجوانوزين أحادي الفوسفات، والذي يعد ضروريًا للتفاعل مع مستقبل TLR7 في الجيب 1. بالإضافة إلى ذلك، يتم تسليط الضوء على إنزيمات الفوسفوليباز D (PLD) كعوامل حاسمة في توليد شظايا RNA التي تتفاعل مع TLR7 في الجيب 2. يتم التأكيد على تفاعل PLDs كعملية ضرورية لمعالجة ركائز RNA بشكل فعال،…
-
تنشيط TRPV3 بواسطة مختلف المحفزات مصحوبًا بانفصال الدهون عن موقع الفانيلايد
2024 | المؤلف: Kirill D. Nadezhdin وآخرون | المجلة: Science Advances | المجال: الأنظمة الحسية (Sensory Systems)تقدم الأبحاث هياكل المجهر الإلكتروني بالتبريد (cryo-EM) لقناة TRPV3 البشرية من النوع البري، كاشفة عن آليات تنشيطها وتثبيطها استجابةً لاثنين من المحفزات المتميزة: القنب الطبيعي تتراهيدروكانابيفارين (THCV) والمركب الاصطناعي 2-أمينوإيثوكسي ثنائي الفينيل بوران (2-APB). توضح الدراسة أن THCV يرتبط بموقع الفانيلا، بينما يتفاعل 2-APB مع قاعدة S1-S4 ومناطق الربط ARD-TMD. ومن الجدير بالذكر أنه على…
-
تصميم دواء جديد محتمل مع تعلم التفاعلات العميقة
2024 | المؤلف: Kenneth Atz وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)يتناول القسم نهجًا حسابيًا جديدًا لتصميم الأدوية من الصفر يستفيد من التعلم العميق القائم على التفاعل لإنشاء جزيئات شبيهة بالأدوية من البداية. يدمج هذا الأسلوب قدرات الشبكات العصبية الرسومية ونماذج اللغة الكيميائية (CLMs)، مما يسهل إنشاء مكتبات مركبات “صفرية” ذات نشاط حيوي محدد، وقابلية للتخليق، وتجديد هيكلي، دون الاعتماد على تقنيات التعلم المعزز أو التعلم…
-
أدوار متنوعة لمجالات ربط المعادن وآلية نقل ATPases من النوع P الناقلة للنحاس
2024 | المؤلف: Zongxin Guo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تعتبر مضخات النحاس من النوع P (P1B-1) ATPases ضرورية للحفاظ على توازن النحاس الخلوي، ومع ذلك فإن الآليات الكامنة وراء حالات E1-E1P-E2P-E2 لا تزال غير مفهومة بشكل كافٍ، خاصة فيما يتعلق بوظيفة مجالات ربط المعادن الداخلية (MBDs). تدمج هذه الدراسة بين أربعة هياكل من المجهر الإلكتروني بالتبريد (cryo-EM) ومحاكاة الديناميات الجزيئية لتوضيح أدوار MBDs في…